职晓阳
- 作品数：33 被引量：147H指数：8
- 供职机构：云南大学生命科学学院微生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生轻工技术与工程化学工程更多>>
- 滇重楼根茎内生细菌生物多样性研究
- 滇重楼[Paris polyphylla,mith var.yunnanensis(Franch.)Hand.-Mazz.]为百合科重楼属多年生草本植物,以根茎入药,是我国常用的传统中药.作为西南地区道地药材,滇重楼具有...
- 杨玲玲职晓阳徐丽华
- 关键词：滇重楼植物内生细菌细菌多样性
- 云南江城和黑井盐矿沉积物未培养放线菌多样性比较被引量：16
- 2008年
- 类群特异性引物的应用使得研究者可以对感兴趣的微生物类群进行针对性研究。围绕云南江城和黑井两个地区的3个盐矿样点沉积物中放线菌的多样性和群落组成,我们通过放线菌特异性引物对总DNA进行16SrRNA基因扩增,经过克隆文库构建,利用酶切并选择其中不同带型的133个克隆的16SrRNA基因插入片段进行测序。系统发育分析和统计学结果表明,两地放线菌16SrRNA基因克隆广泛分布于整个放线菌门,同时发现部分序列可能属于放线菌的新类群。分析结果还预示,江城和黑井两地盐矿虽处云南不同地域含盐区,但两地未培养放线菌物种多样性和系统发育关系均较为相似。
- 吴晋元职晓阳李岩关统伟唐蜀昆徐丽华李文均
- 关键词：盐矿极端环境放线菌多样性
- 新疆高盐环境可培养放线菌的分离、快速筛选及系统分类研究
- 高盐环境放线菌的研究远落后于嗜盐古菌和嗜盐细菌，主要原因是是对其适应高盐环境的特殊生理机制不清楚，无法为纯培养分离技术提供理论指导。随着分子生物学理论和技术的不断发展而出现的免培养技术，虽然可以不依赖于纯培养物就可以从一...
- 李文均唐蜀昆职晓阳张玉琴徐丽华
- 关键词：高盐环境嗜盐放线菌菌株筛选
- 文献传递
- 涅斯捷连科氏菌特异性引物PCR分子鉴定(英文)被引量：1
- 2008年
- 涅斯捷连科氏菌属的建立基于对 Micrococcus halobius 的再分类,这是一类广泛分布于高盐土壤环境的革兰氏阳性细菌,属放线菌类。在对我国西部盐湖环境放线菌的生物多样性及分类学研究中,大量类似菌株被分离。【目的】为了对其进行快速鉴定,特别是筛选出属于优势类群的涅斯捷连科氏菌,【方法】本研究根据前人以报道的方法设计了一对针对其16S rRNA 基因的特异性PCR 引物(Nes1/Nes2),【结果】并通过部分典型菌和野生菌株的PCR实验验证,结合16S rRNA基因的测序验证,证明了Nes1/Nes2 的 PCR 反应有效性及其对涅斯捷连科氏菌的特异性。【结论】利用该引物可以快速准确的对涅斯捷连科氏菌进行鉴定。
- 职晓阳杨玲玲王芸唐蜀昆娄恺李文均
- 关键词：分子鉴定
- PCR-SSCP技术在嗜盐放线菌链单孢菌属快速筛选中的应用被引量：2
- 2008年
- 为提高嗜盐放线菌的研究效率,快速、准确的从大量分离菌株中去除重复菌株、筛选出目的菌株,在特异性引物快速定属的基础上,以嗜盐放线菌链单孢菌属的34株菌株为研究对象,采用与PCR相结合的单链构象多态性分析(PCR-SSCP),扩增出16SrRNA基因中的两个高变区,根据结果对34株菌株进行聚类分析,并将其16SrRNA基因片段测序予以验证。结果表明,聚类后34株菌株可大致分为3类,且与16SrRNA基因片段分析结果一致。从而可快速去除重复菌株并反映出菌株间的系统进化关系。同时实验数据可构建成库,使后续分离菌株的筛选工作只需比对数据即可完成,利于提高工作效率,降低实验成本。
- 蔡曼职晓阳吴晋元唐蜀昆李文均
- 关键词：PCR-SSCP
- 新疆艾丁湖可培养嗜盐放线菌生物多样性研究
- 在嗜盐放线菌营养、生理、生长条件等研究的基础上,对新疆艾丁湖地区的土样进行了可培养嗜盐放线菌分离方法研究,在营养生理上抑制拟诺卡氏菌属的出菌率等嗜盐放线菌分离方法上取得了较大的突破,克服了原先只能分离到大量拟诺卡氏菌属的...
- 唐蜀昆李文均职晓阳姜怡田新朋徐丽华
- 文献传递
- 云南盐矿和新疆盐湖拟诺卡菌株生物地理分布及遗传进化初探
- 本研究通过新疆盐湖和云南拟诺卡氏属菌株遗传进化差异来阐述拟诺卡属菌株地理分布的特征。利用DNA-DNA序列相似性和16S rRNA基因序列相似性相关性来进一步确定拟诺卡氏属菌株之间的亲缘关系，并通过gyrB、rpoB、s...
- 何松涛职晓阳杨玲玲唐蜀昆李文均
- 关键词：生理生化特性遗传进化
- 文献传递
- 云南江城和黑井盐矿沉积物未培养放线菌多样性比较
- 高盐环境中存在着丰富的微生物资源,研究人员通过分子生物技术及纯培养分离技术,不断认识高盐极端环境中的细菌和嗜盐古菌类群的多样性。目前由于放线菌资源的广泛应用,高盐环境中的放线菌资源调查和应用日益得到重视。围绕云南江城和黑...
- 吴晋元唐蜀昆职晓阳徐丽华李文均
- 文献传递
- 拟诺卡氏菌16S rRNA,gyrB,sod和rpoB基因的系统发育分析被引量：15
- 2007年
- 为了更好地了解拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)各物种间的系统发育关系,该属现有有效描述种的gyrB,sod和rpoB基因的部分序列被测定,结合16S rRNA基因,对拟诺卡氏菌属进行了系统发育重建。研究发现拟诺卡氏菌属gyrB,sod和rpoB基因的平均相似性分别为87.7%、87.3%和94.1%,而16S rRNA基因的平均相似性则达到96.65%,3个看家基因均比16S rRNA具有更高的分歧度。比较基于不同基因的系统树发现,由gyrB基因得到的系统树拓扑结构与16S rRNA得到的结构在亚群上基本一致。因此,gyrB基因在拟诺卡氏菌属的系统分类上比16S rRNA基因更具优越性。
- 杨玲玲职晓阳李文均
- 关键词：系统发育分析RRNA基因
- 腾冲两热泉泉古菌多样性及系统发育的初步分析被引量：10
- 2008年
- 通过构建16SrRNA基因片段的克隆文库对腾冲热海两温泉中泉古菌的多样性和系统发育关系进行了初步的研究。一共得到18个泉古菌克隆序列,可分为12个OTUs,两温泉的克隆序列与已知GenBank上关系最近序列的平均相似性较低,无名泉为92.56%,热爆区为93%。从基于16SrRNA基因片段序列构建的系统发育树来看,74℃的无名泉样点中既有属于超高温环境类群的泉古菌,同时又有属于和常温环境较接近的泉古菌;45℃的热爆区样点的泉古菌,相对来说则更接近于常温类群。本次研究表明,腾冲热泉与世界其它同类热泉之间的泉古菌类群存在着一定的差异;而且两实验样点代表了超高温和高温环境泉古菌逐渐向常温过度的两个重要环境。
- 宋兆齐陈经全职晓阳黄志勇张传伦李文均
- 关键词：系统发育RRNA基因克隆文库热泉
