李德峰 作品数:16 被引量:3 H指数:1 供职机构: 中国科学院生物物理研究所 更多>> 发文基金: 国家重点基础研究发展计划 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 环境科学与工程 更多>>
细胞程序化死亡因子10(PDCD10)的表达、纯化和初步结晶 <正>PDCD10最早是在TF-1前骨髓瘤细胞的凋亡诱导实验中表达水平显著上调而被鉴别到的,实验表明,PDCD10在肝脏和其它组织中均有显著的表达。近来在诱导纤维原细胞凋亡以鉴别特异的凋亡相关基因的研究中也发现该基因的表... 丁璟珒 李德峰 张英 王大成文献传递 美诺培南抑制结核分枝杆菌细胞壁特有3->3转肽连接的结构基础 结核病是由结核分枝杆菌所致、以呼吸系统感染为主的慢性传染病。由于缺乏有效的疫苗、近40年来几乎无新药发现和使用、结核分枝杆菌耐药性以及与HIV共感染的情况出现,使得近年来结核病在世界范围内又卷土重来,成为严重影响人类健康... 李文娟 李德峰 毕利军 王大成文献传递 2-氨基苯酚1,6-双加氧酶及其底物/抑制剂复合物的晶体结构 对氯硝基苯由于其高度稳定性可在自然界长期存在,从而造成严重的环境污染,欧共体早己宣布氯代硝基苯是一种在环境中难以降解且特别有害的优先污染物(EEC)。因此,研究其微生物降解和降解相关分子酶学机理可为利用微生物治理芳香烃污... 李德峰 张宁 王大成文献传递 新型甜味蛋白mabinlin Ⅱ的晶体结构及其活性部位研究 <正>Mabinlin Ⅱ(Mab Ⅱ)是从云南Capparis masaikai Levl.中分离得到的一种甜味蛋白,它由一条33 氨基酸残基的A链和一条72残基的B链通过两对链间二硫键和两对链内二硫键连接而成。我们通... 李德峰 朱德裕 王大成文献传递 半乳糖凝集素糖结合的新模式:一个糖结合域的双重配体结合(英文) 被引量:1 2011年 半乳糖凝集素家族通过糖识别结构域(CRD)可以专一性识别和结合含β-半乳糖的多糖配体来发挥其生物学功能.到目前发现的CRD对β-半乳糖的识别模式是非常保守的,在结构已知的半乳糖凝集素结构中,一个CRD只能结合一个多糖配体分子.最近,通过对人源半乳糖凝聚素-3 CRD与对硝基TF二糖(TFN)复合物的晶体结构解析首次发现,一个CRD可以同时结合2个TFN分子.与这2个TFN分子有双向结合的残基突变体E165A结构分析显示,一个残基的突变引起的结构上的微小变化会使结合位点2丧失结合糖底物的能力,而位点1的配体结合却不受影响.这表明,结合位点1对糖底物保守的识别和结合是基本的、主要的,而结合位点2对于糖有条件的结合,是额外的、次要的.序列比对和立体化学分析显示,参与新位点2结合的关键残基在其他半乳糖凝集素分子中都是保守的,而它们参与糖配体结合并不常见,表明它们作用的发挥是有条件的.可能在复杂寡聚结构的情况下,如有多重分支结构,双重结合位点将有利于对这类配体分子的辨识和结合,已有一系列研究报道,具有分支结构的寡糖与半乳糖分子的亲和势明显高于单价糖配体,与上述分析相一致.对这类双重位点糖结合的可能生物学意义进行了讨论. 卞乘凤 张英 李德峰 王大成毛白杨4-香豆酸:辅酶A连接酶晶体结构与功能研究 苯丙氨酸类代谢途径(phenylpropanoid pathway)是植物中最重要的次级代谢途径之一。植物通过这个代谢途径,将碳以苯丙氨酸的形式从主要代谢途径中分流出来,生成种类繁多的最终产物,例如类黄酮类化合物和木质素... 胡永林 殷雷 李德峰 盖颖 蒋湘宁 王大成人类半乳糖凝集素对TF抗原具有不同结合能力的结构基础 TF抗原在肿瘤细胞中的高表达和高特异性表达,同时TF抗原的表达量和肿瘤进程以及转移等密切相关。TF抗原在体内的互作对象有人类半乳糖凝集素家族成员。已有实验证据显示,galectin-1可以通过结合胚胎滋养层细胞表面的TF... 卞乘凤 李德峰 王大成His-234是毛白杨对香豆酸:CoA连接酶的重要酶催化活性残基 被引量:2 2013年 对香豆酸∶CoA连接酶(4-coumarate:coenzyme A ligase,4CL)是植物苯丙烷类代谢途径中的一个重要的酶.4CL以肉桂酸衍生物(香豆酸、咖啡酸、阿魏酸等)、ATP和CoA为底物合成相应的酰基-CoA酯,这些酰基-CoA酯是一系列重要化合物(如木质素)的前体.4CL的酶催化反应分两步进行:第一步以肉桂酸衍生物和Mg2+-ATP为底物合成酰基-AMP,第二步用CoA取代AMP,产生酰基-CoA酯,催化过程中酶的构象产生明显的变化.因为4CL在木质素的合成中所起的作用,这个酶是通过蛋白质工程方法改进林产品质量的重要靶标.我们通过X射线衍射技术,解析了毛白杨对香豆酸∶CoA连接酶1(Pt4CL1)与其中间产物对香豆酰-AMP的复合物晶体结构,与同家族成员结构比对,确定所获得的蛋白质结构为Pt4CL1催化第二步反应,即酰基-CoA酯合成的构象.结构分析表明:His-234残基在Pt4CL1的酶催化机理中起着多重作用,即通过侧链与AMP磷酸基团形成氢键,降低磷酸基团的负电荷,催化CoA的亲核取代反应;侧链可以采取两种不同的构象以调节CoA进入Pt4CL1的催化中心;His-234的侧链还可能夺取CoA巯基的质子,从而增强CoA的亲核反应活性.突变体酶活数据结果也显示His-234对Pt4CL1的活性非常重要,是Pt4CL1催化中心的活性残基. 任百光 李德峰 郑彩霞 盖颖 蒋湘宁 胡永林关键词:木质素合成 芳香烃降解调控蛋白HydR三种状态的结构研究 研究芳香烃类化合物的微生物降解及其调控不仅具有重要的基础生物学意义,而且为治理芳香烃污染提供理论基础,从而具有重要的应用价值。HydR是中科院微生物所首次鉴定的来源于谷氨酸棒杆菌的调节间苯二酚降解的一个调控蛋白,是一个全... 李德峰 张宁 侯彦婕 王大成AAL与TF抗原的识别对其抗肿瘤活性的影响 AAL(Agrocybe aegerita lectin)是从真菌A.aegerita中分离得到的一种β半乳糖凝集素,具有显著的抗肿瘤活性[1]。糖搜索矩阵显示,除了结合乳糖以外,AAL对磺酸化Thomsen-Fried... 丰蕾 李德峰 王大成