惠嫣婷 作品数:20 被引量:44 H指数:4 供职机构: 贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室 更多>> 发文基金: 贵州省重大科技专项计划项目 贵州省农业科技攻关项目 贵州省科技厅重大专项 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 更多>>
牛α-乳清蛋白基因5′调控区多态性研究 被引量:1 2013年 试验选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种α-乳清蛋白(alpha-lactalbumin,LALBA)基因5′调控区及第1外显子部分序列总长1126bp。结果表明,LALBA基因5′调控区存在5个SNPs位点:T-114C、C-166T、A-225C、C-344T、T-778C,T-114C仅在务川黑牛表现多态性。生物信息学软件预测LALBA基因核心启动子区及转录因子结合位点,SNP位点导致11个转录因子结合位点消失,其中1个位于核心启动子区,产生5个新的转录因子结合位点。突变前后RNA二级结构发生明显改变,目标序列未发现CpG岛。 杨永强 龚俞 焦仁刚 惠嫣婷 刘若余关键词:SNP 启动子 可乐猪RYR1基因的群体遗传特性分析 2013年 氟烷基因(RYR1基因)是使猪产生劣质肉及应激综合征的主要因素之一。本研究采用PCR-RFLP技术对45头可乐猪RYR1基因的多态性进行了检测,并通过直接测序对检测结果进行了验证。结果表明:试验猪群体中仅存在显性纯合(HalNN)和杂合(HalNn)两种基因型,不存在隐性纯合基因型(Halnn)。其中,HalNN为优势基因型,频率为0.9111;HalN为优势等位基因,频率为0.955 6。同时,在可乐猪群体中,RYR1基因的变异位点为低度多态(PIC<0.25),并偏离了Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。本研究结果为可乐猪的选育及开发利用提供了理论依据。 张培 惠嫣婷 潘兰兵 刘若余关键词:氟烷基因 RYR1基因 可乐猪 高原山地猪场保育猪舍的设计与应用 被引量:1 2010年 通过对凯里市宏大良种猪繁殖场保育舍结构、部分环境指标调查分析,探讨其设计合理与否,对仔猪产生的影响。结果显示:其保育舍设计、选材均较合理,断奶仔猪生长良好,成活率高,值得在贵州推广。 蒲学栋 申学林 惠嫣婷关键词:断奶仔猪 保育舍 建筑结构 贵州地方猪脂肪特异蛋白27基因SNPs筛查与生物信息学分析 被引量:5 2012年 以3个贵州地方猪种(可乐猪、贵州白香猪、黔北黑猪)为试验素材构建品种DNA池,采用直接测序技术对猪脂肪特异蛋白27(fat-specific protein 27,Fsp27)基因的第4~5外显子区域进行SNPs快速筛查,共检测出4个SNPs位点:intron3-T2169C,exon4-G5A,intron4-G21C和exon5-C5G,其中exon4-G5A和exon5-C5G使编码氨基酸发生Arg→Gln,Thr→Ser的改变。进一步的生物信息学分析显示,exon4-G5A位点的变异导致mRNA的二级结构改变,exon5-C5G多态位点使蛋白质的二级结构发生变化,且当exon4-G5A和exon5-C5G位点的碱基分别为A和G时蛋白质三级结构与其它3种碱基组合(G与G,G与C,A与C)的三级结构明显不同。 惠嫣婷 刘若余 张依裕 杨永强关键词:SNPS 生物信息学 牛JAK2基因启动子区多态及生物信息学研究 2013年 为筛选JAK2基因启动子区SNP及研究其对启动子功能元件的影响,选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,直接测序筛选SNP位点。结果表明,JAK2基因5'调控区及第1外显子存在2个SNPs位点,分别为G+5A、G+104A。生物信息学软件预测得到JAK2基因核心启动子区,SNP位点导致9个转录因子结合位点消失,而产生1个新的转录因子结合位点。G+5A对转录因子结合位点、RNA二级结构和CpG岛均有显著影响。 龚俞 杨永强 焦仁刚 惠嫣婷 刘若余关键词:启动子 贵州省2个猪种APOA5基因比较分析 被引量:2 2011年 根据GenBank中报道的猪载脂蛋白A5(apoA5)基因序列设计3对引物,通过PCR方法分别对可乐猪和贵州白香猪的apoA5基因进行扩增、测序,将2个猪种apoA5基因序列进行比对,并找出基因变异位点。结果表明:可乐猪apoA5基因DNA长为2474bp,白香猪apoA5基因DNA长为2473bp,分别包含3个外显子,2个内含子。2个猪种apoA5基因编码区长皆为1092bp,编码363个氨基酸。白香猪apoA5基因序列与可乐猪相比,存在12个突变位点,其中6个位点为颠换,5个为转换,1个为缺失,两者核苷酸同源性为99.6%。这为进一步研究猪apoA5基因的多态性、生物学活性以及与猪生产性状相关性研究奠定了一定基础。 杨远青 李敬瑞 惠嫣婷 刘若余关键词:可乐猪 贵州白香猪 不同牛种CSN1S1基因启动子区SNP研究 被引量:3 2012年 为研究牛CSN1S1基因启动子多态性,选择产奶性能差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种CSN1S1基因5'调控区及第1外显子部分序列总长1035bp。结果表明:CSN1S1基因5'调控区存在3个新SNPs位点:G-531A、C-706T、T-761C,2个牛品种在各位点表现出不同多态性特征。生物信息学软件预测CSN1S1基因核心启动子区及转录因子结合位点,SNP位点造成核心启动子区2个重要转录因子结合位点消失,而产生3个新的转录因子结合位点。突变前后RNA二级结构有明显改变,目标序列未发现CpG岛。研究结果为进一步确定CSN1S1启动子功能奠定实验基础。 杨永强 龚俞 焦仁刚 惠嫣婷 刘若余关键词:SNP 启动子 牛α_(s2)酪蛋白、κ酪蛋白基因启动子区多态性研究 被引量:2 2013年 为研究牛CSN1S2、CSN3基因启动子多态性。选择品种差异较大的贵州荷斯坦奶牛和务川黑牛构建不同DNA池,设计特异性引物分别扩增2个牛种CSN1S2、CSN3基因5’调控区及第1外显子部分序列。结果表明:CSN1S2基因5’调控区存在3个SNPs位点:A-253T、A-317G、A-407G,CSN3基因5’调控区发现4个SNPs:T-79G、G-415G、T-421C、T-658G,2个牛品种在不同位点的多态性有显著差异。生物信息学软件预测CSN1S2、CSN3基因核心启动子区及转录因子结合位点,CSN1S2基因A-253T、A-317G位于预测核心启动子区。SNP位点造成CSN3基因7个转录因子结合位点消失,而产生10个新的转录因子结合位点。对于CSN1S2、CSN3基因,突变前后RNA二级结构有明显改变,目标序列均未发现CpG岛。研究结果为进一步确定其启动子功能奠定试验基础。 杨永强 龚俞 焦仁刚 惠嫣婷 谢海强 肖超能 刘若余关键词:SNP 启动子 猪APOA5和APOC3基因mRNA的表达差异及与肌内脂肪沉积的相关性分析 被引量:10 2014年 为了探究载脂蛋白A5(apolipoprotein A5,APOA5)基因和载脂蛋白C3(apolipoprotein C3,APOC3)基因组织表达差异及其与肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)沉积的相关性,本研究利用荧光定量PCR方法分析APOA5和APOC3基因mRNA在可乐猪和江口萝卜猪7个组织中的相对表达量及其与IMF沉积的相关性。研究结果表明:APOA5和APOC3基因在可乐猪和江口萝卜猪的7个组织中均有不同程度表达,在肝脏中表达量最高,在皮下脂肪和背最长肌中表达量次之;APOA5基因在可乐猪多数组织中的表达量显著低于江口萝卜猪(p<0.05),而APOC3基因未呈现类似规律性;可乐猪中,除心脏外,其它组织均表现为APOC3基因mRNA表达量高于APOA5,江口萝卜猪心脏、肝脏、脾脏、小肠和背最长肌中同样呈现上述表达差异。相关及回归分析表明,IMF沉积量与可乐猪APOC3 mRNA表达丰度呈线性正相关(p<0.05)。根据研究结果,可以推测APOA5和APOC3基因与IMF沉积有一定关联性。 惠嫣婷 杨永强 刘若余关键词:肌内脂肪 DNA池快速筛查牛STAM1基因SNPs及估算等位基因频率 被引量:2 2012年 目的:旨在对不同牛种STAM1基因进行SNPs筛查,为地方牛种选种选育提供一定理论依据。方法:选取生长发育性状明显差异的务川黑牛和贵州荷斯坦奶牛2个牛种构建DNA池,设计1对引物分别扩增2个牛种STAM1基因第14外显子序列总长898bp。切胶回收后对PCR产物进行双向测序。结果:在牛STAM1基因中快速筛查到5个SNPs:A33C、C66G、C356T、T523A、T652C,其中A33C(Tyr→Ser)、C66G(Pro→Arg)、C356T(Glu→Lys)为错义突变,T523A为同义突变,T652C位于内含子区。贵州荷斯坦奶牛在T523A和T652C两个位点基因频率为1.000 0,而务川黑牛分别为0.673 0和0.810 6。生物信息学分析表明:突变前后STAM1的RNA二级结构和蛋白质二级、三级结构均有明显改变。结论:DNA池结合测序技术可快速筛选SNP位点,检测到STAM1基因第14外显子5个SNPs。 杨永强 焦仁刚 龚俞 惠嫣婷 刘若余关键词:SNPS JAK/STAT