张凤洁
- 作品数:12 被引量:35H指数:4
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- 谷子miR169家族及其靶基因的鉴定与功能分析
- 2022年
- micro RNA广泛参与植物中多个生长发育过程,mi R169家族是最保守的mi RNA家族之一。对谷子mi R169(sit-miR169)家族进行生物信息学分析,包括染色体分布、系统进化、碱基保守性、二级结构和sit-mi R169及其靶基因的表达。鉴定了15个sit-miR169,分布于7条染色体上。系统进化分析显示,sit-miR169家族前体sit-MIR169大致可以分为2簇,部分sit-MIR169成员与水稻osa-MIR169家族成员亲缘关系较近。sit-miR169的前体均可形成稳定的二级茎环结构,成熟体均产生于前体的5′端臂上,且成熟序列的碱基保守性很强。sit-miR169在花、叶和根中均有表达,具有明显组织表达特异性。sit-miR169的靶基因主要是NF-YA转录因子基因,此外还有L型凝集素类受体蛋白激酶、ω-6脂肪酸去饱和酶、转运蛋白Sec1a、SDG40蛋白、环指跨膜蛋白和核糖体大亚基假尿苷合酶SVR1基因等。mi R169通过调控靶基因,尤其是NF-YA的表达量来影响植物的生长发育和对环境的应答。谷子NF-YA基因主要在根和穗中表达,表现出明显的组织表达特异性。此外,sit-mi R169靶基因的表达受环境诱导,如干旱条件能进一步诱导Seita.9G521100基因在根中的表达。
- 卢平康庆芳赵孟瑶张凤洁武强强马芳芳王宇珅韩渊怀王兴春李雪垠
- 关键词:谷子MIRNA靶基因生物信息学
- 谷子和狗尾草WOX转录因子基因的全基因组鉴定与分析被引量:3
- 2019年
- WOX转录因子主要功能涉及植物组织发育、器官形成和干细胞维持等。为了深入研究谷子和狗尾草WOX转录因子基因家族,为后续狗尾草属植物生长发育相关WOX基因的克隆和功能研究奠定理论基础,研究鉴定了谷子和狗尾草WOX转录因子家族基因,并进行了生物信息学分析。结果表明,谷子和狗尾草基因组分别包含13,12个WOX基因,谷子和狗尾草共有12对直系同源基因,这些同源基因具有相似的基因结构,谷子和狗尾草WOX基因内含子相位为0或1;谷子和狗尾草WOX基因蛋白质基序Motif1,Motif3,Motif4和Motif5较为保守;SiWOX1等基因启动子包含AACA_motif,CAT-box,GCN4_motif,RY-element等元件,说明它们可能参与调控胚乳或种子发育、或分生组织形成;SiWOX11和SvWOX10这2个基因在根组织中表达量非常高,说明这2个基因可能与根系发育密切相关。
- 李雪垠武懿茂张凤洁
- 关键词:谷子狗尾草转录因子生物信息学
- 行距配置对晋中晚熟冬麦区群体冠层结构的影响被引量:4
- 2012年
- 为了研究晋中晚熟冬麦区不同行距配置对不同穗型冬小麦群体冠层结构的影响,选用2种不同穗型品种,在播量一致的前提下,分别采用10cm和20cm两种行距配置,研究群体叶面积指数(LAI)、群体平均叶倾角(MLIA)、群体直接辐射透过系数(TCRP)、消光系数(K)和产量的差异。结果表明:与20cm(B6)行距配置相比,采用10cm(B3)行距配置提高了2个小麦品种全生育期总LAI值、灌浆中期K和产量;降低了2个小麦品种开花期和灌浆期的MLIA。多穗型品种全生育期总LAI值高于大穗型品种。B3处理的2个生育时期MLIA表现为A1>A2。随着天顶角增加,各处理TCRP均呈现逐渐减小的趋势。大穗型品种‘山农9-1’(A1)B3处理的TCRP均值和极差均较B6减小,且均值差异显著。多穗型品种‘山农9801’(A2)B3处理TCRP均值和极差均较B6增加,均值差异不显著。B3处理对多穗型小麦的增产作用更明显。B3行距配置改善了晋中晚熟冬麦区群体冠层结构,适用于北方晚熟冬麦区。
- 王爱萍董琦张凤洁苗果园
- 关键词:行距配置冠层结构
- 氮肥运筹对不同种植方式冬小麦群体结构及产量的影响被引量:5
- 2015年
- 以山西农业大学培育的多穗型冬小麦山农9801为供试材料,采用随机区组的方法,在施氮总量每公顷300 kg时,分别对常规条播(B1)和窄行稀条播(B2)实施不同氮肥基追比:CK(10∶0)、C1(7∶3)、C2(5∶5)、C3(3∶7),研究其对拔节期小麦群体形态、各生育期叶面积指数及总茎数、产量构成因素的影响。结果表明:窄行稀条播促进了冬小麦群体生长,提高了实际产量。不同氮肥运筹对两种播种方式小麦生长及产量的影响很大,拔节期追施氮肥后小麦各指标均在C1、C2较高,整体看C1最高,且对窄行条播的提高作用更为明显。B2种植基追比7∶3时,旗叶面积、株高、次生根数最多,黄叶数最少,且与其他处理达到显著差异,拔节期到孕穗期LAI最高,群体总茎数及单株成穗数最大,C1处理通过显著增加有效穗数、穗粒数及千粒重来增加实际产量。上述分析结果为晋中窄行条播冬小麦氮肥合理利用,优质高产提供了实验和理论依据。
- 冯变娥张凤洁乔俊芳范晋波荀洁董琦王爱萍
- 关键词:冬小麦LAI
- 普通小麦祖先种类TaNAC2a基因的鉴定分析和表达模式研究被引量:1
- 2014年
- 采用生物信息学方法,利用核酸、蛋白数据库对普通小麦祖先种乌拉尔图小麦(Triticum urartu L.)和粗山羊草(Aegilops tauschii L.)NAC转录因子基因家族进行分析,分别鉴定出107、126个NAC蛋白家族成员。根据拟南芥、水稻NAC基因家族分类系统,将其分为15个亚族。通过与抗逆相关基因TaNAC2a进行同源进化树分析,发现5个TuNAC、6个AetNAC基因与其高度同源,对这些基因的蛋白结构域、基因结构、启动子顺式作用元件及组织表达特性进行分析。结果表明,11个NAC蛋白具有典型的NAC结构域。进化关系较近的基因具有相似基因结构;启动子区域预测发现其均含有逆境胁迫响应作用元件。实时荧光定量PCR结果显示,TuNAC、AetNAC基因分别在乌拉尔图小麦和粗山羊草根、胚芽鞘、叶组织中均有表达,并呈现出明显的组织表达特异性。通过芯片表达数据和逆境胁迫基因表达试验,推测AetNAC2c基因可能参与植物干旱胁迫响应,AetNAC2b可能参与调控植物的耐旱、耐低温胁迫反应。上述分析结果为普通小麦祖先种基因家族的系统研究,优异候选功能基因的预测、筛选提供了试验依据。
- 张凤洁李雪垠高世庆冯变娥刘婷婷唐益苗赵昌平王爱萍
- 关键词:粗山羊草NAC生物信息学
- 稀土浸种对水旱地小麦根苗生长及产量的影响被引量:6
- 2014年
- 以山西农业大学培育的冬小麦031165为供试材料,对水、旱地小麦采用浓度均为1 000 mg/kg的稀土溶液[La(NO3)3,Ce(NO3)3]进行浸种,研究其对小麦根苗生长、抗氧化酶系活性及产量的影响。结果表明:干旱胁迫抑制了小麦根苗生长,降低了小麦的实际产量。无论干旱胁迫与否,稀土浸种均能显著提高不同生育期小麦株高、地上干重、叶面积及根系生物量;稀土浸种可提高部分生育期旗叶中SOD、POD活性,降低胞内MDA含量,显著提高小麦产量和经济系数,且在干旱胁迫下作用较明显。从整体上看,Ce浸种对小麦生长的促进作用比La浸种明显。
- 张凤洁李雪垠冯变娥乔俊芳荀洁李慧明王爱萍董琦
- 关键词:小麦浸种干旱胁迫
- NATs对基因调控的作用
- 2013年
- 通过高通量测序的方法,发现细胞中存在许多非编码蛋白RNA,在生命过程中起着重要的调控作用。NATs属于这一类非编码蛋白RNA。NATs普遍存在于真核、原核生物中,通过与相应的mRNA或靶序列直接或间接作用,对X染色质失活、RNA剪接编辑、转录干扰等方面均产生影响。随着研究的深入,NATs将作为一种有效的工具来研究基因的功能,调控基因的表达,并对基因治疗及改良作物性状方面提供思路与方法。简介了NATs的分类、作用和相关机制。
- 王光达崔辰明张凤洁董琦王爱萍
- 关键词:小RNARNA干扰非编码RNA
- 小麦WOX转录因子基因的全基因组鉴定与分析被引量:3
- 2021年
- 小麦是全球主要粮食作物之一。本研究运用生物信息学技术手段对普通小麦(Triticum aestivum L.)的WOX基因进行了全基因组鉴定、系统发育树构建、序列分析。结果显示:小麦基因组一共包含了26个WOX基因,其中在Phytozome数据库中收录有序列信息的有20个,可分为3个亚族,各亚族内的WOX基因具有相似的基因结构,内含子相位为0或1;该家族基因的蛋白质基序Motif 1、Motif 2、Motif 5和Motif 9较为保守,其中Motif 1和Motif 2推测为核心基序;该家族基因启动子包含ABRE、CAT-box、CGTCA-motif、RY-element等元件,说明小麦WOX基因可能参与调控胚乳或种子的发育,或参与分生组织的形成;TaWOX6、TaWOX8、TaWOX10可能参与小麦穗和茎秆的发育过程;TaWOX15、TaWOX18、TaWOX20在小麦胚乳中的表达量非常高,而在别的部位的表达量几乎为零,说明这3个基因与小麦胚乳的形成发育密切相关。该研究结果为进一步探讨小麦WOX基因的功能与分子作用机理奠定了基础。
- 武强强张凤洁董浩欢卢平樊婕李雪垠王爱萍董琦
- 关键词:小麦转录因子生物信息学
- 不同种植方式对丘陵地小麦田土壤水分、产量及水分利用效率的影响被引量:5
- 2015年
- 目的:为研究不同种植方式对丘陵地小麦田土壤水分,产量及水分利用效率的影响.方法:以临旱536小麦品种为供试材料,采用随机区组方法,以常规种植方式为对照进行研究.结果:与常规播种(CK)相比,窄行稀条播(C1)、膜侧条播(C2)、沟播(C3)播种0~240cm土层的含水量在整个生育时期下降较大,对0~120cm土壤含水率有明显改善,同时提高了深层土壤水分的利用,C2有利于拔节期前中层土壤(80~220cm)保墒.各处理间的总耗水量达极显著差异,C2最大,C3、CK、C1依次降低,且在拔节期达到耗水量的最大值,占总耗水量27.58% ~37.56%.C2、C3灌浆速率和地上生物量明显高于C1、CK,千粒重、产量、降水利用效率表现为C2〉C3〉C1〉CK.结论:C2显著改善土壤水分,提高了小麦地上生物量、灌浆速率、降水利用率、千粒重,进而增加了产量.
- 董琦冯变娥乔俊芳范晋波张凤洁李莎莎高志强王爱萍
- 关键词:土壤水分生物产量水分利用效率
- 水势梯度对盆栽小麦生长发育特性的影响
- 2013年
- 以"加拿大冬小麦2号"为材料,研究不同土壤水势梯度下盆栽冬小麦株高、节间长、穗长、单株绿叶面积、单株干鲜重以及小麦旗叶超氧化物歧化酶(SOD)活性及过氧化物酶(POD)活性的变化规律。结果表明,晋中冬小麦的形态指标受土壤水势梯度的变化影响较大,随着水势梯度(23%、18%、15%、13%)的逐渐减小,在冬小麦的各生育时期,其株高、节间长、穗长、单株叶面积及鲜、干重在数值上都表现出相应的减小;23%和13%水势处理对小麦形态指标的影响差异较明显,18%和15%水势处理对小麦形态指标的影响差异不明显;在小麦的苗期与拔节期,随着水势梯度的减小,小麦旗叶的SOD和POD活性表现出增强的趋势,但在抽穗期小麦旗叶SOD和POD活性表现为先增强后减弱的趋势;且各水势下抽穗期的旗叶SOD、POD活性都低于相应水势下苗期及拔节期旗叶的SOD、POD活性。
- 张凤洁王爱萍董琦王瑞云
- 关键词:冬小麦生长发育特性