康宁
- 作品数：37 被引量：214H指数：10
- 供职机构：广西壮族自治区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：广西省自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 广西2008年肠道病毒71型VP1区序列特征分析被引量：7
- 2010年
- 目的阐述引起广西2008年手足口病流行的肠道病毒71型VP1区序列特征及种系进化分析。方法对从广西2008年HFMD患者分离到的EV71毒株,采用逆转录-聚合酶链反应（reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR）,进行VP1编码区序列扩增,并对扩增产物进行序列测定和分析。结果从广西2008年HFMD患者标本中共分离到12株EV71毒株,12株毒株VP1编码区核苷酸长度均为891 bp,在进化树中与C4亚型同处一簇,属于C4亚型C4b分支;各株核苷酸和氨基酸同源性分别为96%-100%和99%-100%,至少存在5条传播链。结论广西2008年EV71流行株属于C4基因亚型C4b分支,与我国近年的EV71流行株具有较高的同源性和共进化性;应加强广西EV71病原监测和研究,掌握EV71流行株的基因型别和特征。
- 陈敏玫周开姣闭福银康宁谭毅莫兆军杨进业
- 关键词：手足口病人肠道病毒71型传播链
- 2020-2021年广西Victoria系乙型流感病毒的抗原性及基因特性分析被引量：6
- 2022年
- 目的 了解广西壮族自治区(广西)2020—2021年度B/Victoria(Bv)系流感病毒的抗原性及基因特征。方法 选取广西2020—2021年分离的36株Bv系流感毒株进行全基因组测序,并对血凝素(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶(neuraminidase,NA)基因进行序列拼接和基因特性分析。同时采用血凝抑制实验进行抗原性分析。结果 2020—2021年广西分离的Bv系流感病毒与WHO推荐的疫苗株B/Washington/02/2019相比,HA和NA基因的核苷酸同源性分别为99.1%~100.0%和99.1%~99.9%。系统进化树分析发现这36株Bv系流感毒株均属于1A(?3)B分支,与疫苗株属于同一分支,但广西毒株又进一步分为两个小分支。抗原性分析显示这两个小分支没有明显差异,均为疫苗株的类似株。氨基酸变异位点分析发现,HA蛋白携带R133G、N150K、N197D的氨基酸突变,变异涉及3个抗原决定簇。NA蛋白的酶活位点和神经氨酸酶抑制剂耐药位点均未发生突变。结论 2020—2021年度广西流行的Bv系流感病毒与WHO推荐的北半球疫苗株的组分匹配但存在持续变异,需要密切监测流行株的变异情况。
- 陈华凤康宁康宁王静居昱王静
- 关键词：神经氨酸酶血凝素基因特性抗原性
- 2009年广西253例疑似肠道病毒感染病例病原学监测结果分析被引量：4
- 2010年
- 目的了解广西肠道病毒的感染情况,为制定预防和控制肠道病毒感染策略提供依据。方法采用实时荧光定量PCR方法,对广西253例疑似肠道病毒感染者咽拭子、疱疹液和粪便标本共505份进行肠道病毒、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A16型(CoxA16)核酸检测。结果共检出290份肠道病毒核酸阳性,阳性率为57.43%,其中EV71核酸阳性105份,阳性率为20.79%,CoxA16核酸阳性143份,阳性率为28.32%。结论 505份标本中CoxA16核酸的阳性率高于EV71;疱疹液标本的阳性检出率高于肛拭子、咽拭子、粪便标本的阳性检出率;CoxA16和EV71是引起儿童手足口病的主要病原体,要加强对CoxA16和EV71的的鉴别诊断。开展手足口病流行病学和病原学研究,将有助于提出更好的预防和控制措施。
- 康宁闭福银谭毅周开姣
- 关键词：肠道病毒属手足口病
- 广西首起新冠奥密克戎变异株引起的本土聚集性疫情病例新冠病毒基因特征分析被引量：1
- 2023年
- 目的揭示2022年2月广西德保县本土新冠疫情中病例新型冠状病毒(SARS-CoV-2)基因组特征及变异情况,为广西新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情溯源及防控工作提供科学依据。方法从广西德保县2月本土新冠疫情的确诊病例中选取30份病例的上呼吸道标本进行核酸提取、构建DNA测序文库、第二代测序仪上机测序、拼接测序数据,通过基因比对和构建进化树完成病毒基因变异位点和进化分析。结果与武汉参考株相比,广西德保县2月本土聚集性新冠疫情病例的SARS-CoV-2核苷酸突变中位数为57个(56~58个),氨基酸突变的中位数为63个(62~65个),同源性非常高,均属于VOC/Omicron变异株BA.1进化分支。结论SARS-CoV-2全基因组测序分析对新冠疫情的溯源研判提供科学依据,对新冠疫情的防控至关重要。
- 康宁刘银品闭福银蒋震羚廖驰真周树武周正东黄彦谭冬梅居昱
- 关键词：新型冠状病毒系统进化分析
- 广西某监狱一起重大流感爆发疫情分析被引量：2
- 2007年
- 康宁谭毅闭福银韦增良江超穗蒙理坚江蓓
- 关键词：流感
- 2007-2009年广西壮族自治区甲3亚型流感病毒HA1基因变异的特征研究被引量：3
- 2011年
- 目的从HA1基因层面探讨2007-2009年广西壮族自治区(广西)甲3流感病毒的变异、进化发展规律,探寻与WHO疫苗推荐株以及上海市、北京市和浙江省等地当年流行株之间的差异。方法提取广西22株2007-2009年甲3流感毒株RNA,并测定其血凝素重链(HA1)区域的核苷酸序列,采用生物信息软件,分析与当年疫苗推荐株及上海、北京和浙江等地在HAI以及HAI抗原决定簇区域的差异,分析进化关系。结果 22株广西甲3流感病毒2007年与2008年比较接近,HA1区核苷酸和氨基酸的同源性均值分别为99.39%和99.08%;而与2009年变异较大,同源性均值分别为99.04%和97.78%。而对比世界卫生组织(WHO)推荐的2008-2009年甲3流感疫苗株A/B risbane/10/2007,广西3年分离株HA1区氨基酸酸同源性均值分别为99.81%、99.25%和97.94%。2009年广西甲3流感病毒与当年疫苗株比较,HA1抗原决定簇发生了6个氨基酸的替换,且发生在A、D、E三区。各年度散发株和暴发株同源性较均在99.00%以上。2007年广西甲3毒株与上海及北京比,HA1区氨基酸同源性均值分别为99.83%和99.12%,2008年比较结果分别为98.93%和99.25%。基因进化树分析显示2009年分离株与2007年、2008年及当年疫苗株距离较远,单独分支。结论广西2007年与2008年甲3流感病毒HA1基因特性较为接近,2009年毒株发生了较大变异。广西与上海、浙江等地分离株更为接近,而与北京分离株差异较大。WHO推荐的当年疫苗株均滞后广西流行株。
- 康宁谭毅闭福银居昱韦增良潘浩
- 关键词：HA1基因
- 2008-2010年广西边境地区流感和人禽流感监测结果分析被引量：3
- 2011年
- 目的对广西壮族自治区(广西)8个边境市(县)所属的综合性医院不明原因肺炎、病原待查重症肺炎和流感样病例开展病原学监测,了解广西边境地区流感病毒优势株及其变化,探索广西边境地区流感流行规律,为科学防控边境地区流感和人禽流感提供依据。方法在边境地区医院设置监测点,开展相关病例监测,提取监测病例咽拭子标本病毒核酸,反转录合成cDNA,多重PCR扩增目的基因,电泳检测扩增产物;采用细胞培养法分离鉴定流感病毒;采集从事饲养、销售和屠宰家禽的职业人群的静脉血34份,通过血凝抑制实验进行禽流感H5亚型抗体检测。结果 2008年广西边境地区分离到6株流感病毒,其中B型5株,H1N1亚型1株;2009年分离到33株流感病毒,其中B型17株,H3N2亚型8株,H1N1亚型2株,甲型H1N1 6株;2010年分离到流感毒株130株,其中B型55株,H3N2亚型49株,H1N1亚型1株,甲型H1N1 25株;2008-2010年检测不明原因肺炎、病原待查的重症肺炎标本9份,人禽流感核酸和多重呼吸道病毒核酸检测均为阴性;采集从事饲养、销售和屠宰家禽的职业人群血样本34份,未检出H5N1亚型禽流感病毒抗体阳性的标本。结论 2008年和2009年广西边境地区的流感优势株为B型流感毒株,2010年为B型和H3N2亚型流感毒株;从有限的不明原因肺炎和病原待排查的重症肺炎病例标本中未检出禽流感病毒;禽流感H5亚型在职业暴露人群中未发现隐性感染。进一步加强对广西边境地区的流感和人禽流感病原学监测工作,对广西的流感和人禽流感的防控工作有重要意义。
- 康宁谭毅居昱闭福银谢镇国韦增良
- 关键词：人禽流感病毒病毒分离
- 广西流感与人禽流感监测网络的建立和运行效果被引量：12
- 2007年
- 目的建立广西流感与人禽流感监测网络并了解运行效果。方法对广西2004-2006年哨点医院流感样病例监测数据、流感样病例爆发疫情监测数据、实验室病原学监测数据进行分析。结果2004-2005年度监测医院流感样病例每周平均为291.72例,就诊百分比为18.39%;2005-2006年度监测医院流感样病例每周平均为158.59例,就诊百分比为8.16%。2004-2005年度检测流感样病例标本280份,分离出15株毒株,阳性率5.36%,其中H1N1亚型13株(86.67%),H3N2亚型2株(13.33%);2005-2006年度检测流感样病例标本3115份,分离出381株毒株,阳性率12.23%,其中H1N1亚型40株(10.50%),H3N2亚型115株(30.18%),B型为226株(59.32%)。结论广西流感与人禽流感监测网络已建立并能提供可靠的监测数据。
- 谭毅康宁闭福银谢艺红
- 关键词：流感样病例流感病毒
- 2005年广西H1N1亚型流感病毒基因特性研究被引量：1
- 2009年
- 目的阐明2005年广西流行的H1N1亚型流感病毒血凝素基因变异情况。方法挑选3株2005年广西流感病毒分离株,进行血凝素基因HA1区核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后使用DNA-STAR分析软件进行进化特性分析。结果HA1区核苷酸序列和氨基酸序列分析表明,与2005年的国际疫苗推荐株A/New Caledonia/20/1999(H1N1)比较,三株分离株的HA1蛋白均含有7个糖基化位点。分离株A/GX/566/2005发生以下氨基酸位点替换:82 T>K、94 Y>R、145 R>K、165 V>A,208 R>K、251 W>R、266 T>N,其中165位点位于HA1的抗原决定簇上。分离株A/GX/8/2005及分离株A/GX/13/2005发生了以下位点变异:165 V>A、194E>G、251 W>R、252 Y>F、314 V>A,其中165及194位于HA1抗原决定簇上。结论2005年在广西同时流行着三系不同的H1N1病毒。一系接近国际疫苗推荐株A/New Caledonia/20/1999(H1N1)东部江苏的2000-2002年毒株,一系接近江苏2005-2006年毒株。尤其需要密切关注与疫苗株HA1蛋白发生较大变异一系H1N1,避免此系H1N1病毒的流行和暴发。
- 康宁潘浩
- 关键词：流感病毒A型基因血凝素类病毒
- 2009年广西农贸市场环境标本禽流感病毒的病原学监测被引量：19
- 2011年
- 1997年中国香港首次发生人禽流感（H5N1）疫情，引起全球关注。2005年11月广西首次报告一起人禽流感（H5N1）疫情，至2009年广西共累计报告3例人禽流感（H5N1）病例。为了解禽流感病毒在广西人群及高危环境中的感染分布情况，近年来全面加强了禽流感疫情监测，现将广西2009年农贸市场环境禽流感H5N1亚型病毒病原学的监测情况报道如下。
- 康宁谭毅何为涛居昱周开姣韦增良
- 关键词：禽流感病毒市场环境病原学监测标本人禽流感疫情监测
