古英洪
- 作品数：10 被引量：31H指数：4
- 供职机构：四川大学生命科学学院四川省分子生物学及生物技术重点实验室更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划教育部“新世纪优秀人才支持计划”四川省教育厅重点项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程化学工程更多>>
- 甘薯不同组织间差异表达基因的数字表达谱分析
- 甘薯作为世界第6大粮食作物,虽然具有营养丰富、耐贫瘠、种植投入低、易于管理等特点,但因其主要种植于发展中国家与地区,与水稻等主要粮食作物相比,长期未受到足够的重视,导致分子生物学研究进展缓慢,其基因表达规律几乎仍是空白。...
- 陶向古英洪王海燕张义正
- 关键词：甘薯RNA-SEQ
- 文献传递
- 转昆虫抗冻蛋白基因增强甘薯抗冻能力被引量：4
- 2020年
- 为明确昆虫抗冻蛋白基因转入甘薯(Ipomoea batatas)后是否能提升其抗冻能力,进而为培育甘薯抗冻育种材料奠定基础,将黄粉虫(Tenebrio molitor)抗冻蛋白基因TmAFP导入植物基因表达质粒,经农杆菌介导的遗传转化获得抗冻甘薯新材料。以甘薯品种Huachano为受体材料建立甘薯植株高效再生体系,并采用不同成分的体细胞胚成熟培养基培养胚性悬浮细胞。胚性愈伤组织对除草剂的敏感性测试结果表明,转基因阳性植株筛选的最适培养基为MS+0.2 mg·L–12,4-D+0.8 mg·L^–1 GAP+100 mg·L^–1 Carb。将表达质粒分别转化Huachano后共获得7个胚性愈伤团并最终获得42株再生抗性植株,其中转pSUIBEV3-AFP有23个株系,转pCAMBIA-AFP有19个株系,经PCR、Southern杂交和RT-PCR检测后证实TmAFP基因已整合至甘薯基因组中并获得表达。将转基因甘薯及对照植株在–1℃下处理15小时后转移至室温,结果表明,转基因甘薯植株的抗冻能力显著提升。
- 赖先军张义正古英洪颜朗
- 关键词：甘薯抗冻蛋白分子育种
- 桃PGIP蛋白基因片段的克隆、序列分析及在大肠杆菌中的表达被引量：13
- 2008年
- 【目的】克隆桃(Prunus persica)多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白(polygalacturonase-inhibiting protein,PGIP)基因,并进行原核表达研究。【方法】根据李属植物pgip保守区域设计1对特异引物,以桃叶片总RNA为模板,通过RT-PCR获得了约1kb的cDNA片段,T/A克隆后进行序列测定,并对该序列进行分析。随后将该蛋白成熟肽cDNA片段克隆到原核表达载体pET-32a(+)中,构建融合表达质粒,转化到Escherichia coli Rosetta-gami(DE3)pLysS中进行表达。【结果】测序结果显示,桃多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白cDNA编码区长993bp,编码330个氨基酸残基,命名为Pppgip。PpPGIP分子量为36.4kD,等电点为7.42,信号肽为N端24个氨基酸残基,具有7个潜在的N-糖基化位点。Pppgip与李属其它pgip核苷酸和氨基酸序列的同源性分别为93.2%～94.6%和89.7%～92.7%。同源树分析表明,该基因明显区别于其它pgip,与马哈利樱桃pgip的关系较近,与寿星桃、桃栽培品种‘久保’等pgip的关系都较远。该基因所编码的蛋白质的三维结构含11个α-螺旋和21个β-折叠,中心LRR结构域由10个串联的LRRs基序组成。原核表达产物经SDS-PAGE分析表明,重组蛋白主要以包涵体形式出现。【结论】克隆了桃PGIP基因,并可在大肠杆菌中表达。
- 古英洪汤浩茹张义正
- 关键词：多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因克隆基因表达
- 甘薯的病毒种类及其基因表达分析
- 病毒侵染是造成甘薯减产和品种退化的主要原因。迄今为止,已在甘薯中发现了近30种病毒。为研究在自然栽培条件下甘薯体内的病毒种类及其基因表达,从我国广泛栽培的甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)品种‘徐薯1...
- 古英洪陶向王海燕赖先军张义正
- 关键词：甘薯病毒转录组组织特异性
- 文献传递
- 中矮1号梨砧木(S_2)PGIP基因的克隆及序列分析被引量：3
- 2008年
- 利用RT-PCR技术,根据GenBank中梨属PGIP基因序列设计1对特异引物,以梨矮化砧木S2叶片总RNA为模板,克隆到1条约1100bp的cDNA片段,将其与pMD18-Tvector连接后转化Escherichia coli JM109,对筛选到的阳性克隆进行序列测定并使用生物信息学方法对所得结果进行综合分析。结果表明,克隆片段为梨PGIP基因,该cDNA编码330个氨基酸,预测分子量为36388ku,第1～24个氨基酸残基是信号肽。与梨属其它种中已获得的PGIP核苷酸序列开放阅读框(Open reading frame,ORF)的同源性为97.5%～99.6%,氨基酸序列的同源性为97.6%～99.1%。
- 蒋豪汤浩茹古英洪张勇罗娅
- 关键词：矮化砧木基因克隆PGIP基因
- 运动发酵单胞菌基因组序列测定和比较基因组分析
- 运动发酵单胞菌(Zymomonas mobilis)具有特殊的Entner-Doudoroff代谢途径、乙醇产率高、生物量生成少和乙醇耐受力强等特点,但其底物利用范围窄和副产物较多的缺点限制了其生产应用。基因组序列的测定...
- 陈诚曹庆华古英洪张义正
- 关键词：运动发酵单胞菌基因组比较基因组
- 文献传递
- 甘薯G病毒外壳蛋白基因克隆与序列分析被引量：4
- 2006年
- 根据已报道的甘薯G病毒(SweetpotatovirusG,SPVG)外壳蛋白基因(coatprotein,CP)序列,设计和合成了一对特异引物,采用反转录-聚合酶链式反应(Reversetranscription-polymerasechainre-action,RT-PCR)技术,从甘薯病叶总RNA中克隆到了SPVG-CPSC1和SPVG-CPSC2两个约700bp的cDNA片段。该片段与pMD18-T载体连接后转化EscherichiacoliJM109,对筛选到的阳性克隆进行序列测定与分析结果表明,该片段与已报道的甘薯G病毒外壳蛋白基因具有较高的同源性,证实获得的DNA片段是SPVG的外壳蛋白基因。两个克隆片段与埃及分离物Egypt1的序列同源性最高,核苷酸同源性分别为98.7%和89.1%,对应推导的氨基酸同源性分别为98.7%和94.8%,与中国分离物CH2的序列同源性最低,核苷酸同源性分别为87.4%和87.0%,对应推导的氨基酸同源性分别为96.6%和94.8%,而2个克隆片段之间的核苷酸以及对应推导的氨基酸序列同源性分别为89.5%和96.1%,表明SPVG具有一定的多态性。
- 古英洪汤浩茹张义正
- 关键词：外壳蛋白RT-PCR基因克隆
- 甘薯转录组序列的从头组装与分析
- 甘薯(Ipomoea batatas(L.)Lam.)是世界第6大粮食作物,除了食用外,还作为重要的饲料以及淀粉、乙醇等工业原材料。我国是全世界最大的甘薯生产国,然而与其他作物相比,甘薯基因数据资源极少,为甘薯的分子生物...
- 古英洪陶向王海燕郑文刘震张义正
- 关键词：甘薯转录组RNA-SEQ基因注释
- 文献传递
- 桃pgip基因cDNA的克隆及其在大肠杆菌中的表达
- 多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白/(Polygalacturonase inhibiting proteins，PGIPs/)是一种胞外的细胞壁结合糖蛋白，在植物的防卫反应中具有重要的作用。它能够特异性结合病原真菌分泌的内切多聚...
- 古英洪
- 关键词：多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白基因克隆
- 文献传递
- 甘薯Sporamin家族基因克隆与表达分析被引量：5
- 2013年
- 为研究甘薯sporamin家族基因的结构和功能,通过对本实验室构建的甘薯转录组序列进行分析,设计相应引物并采用高保真DNA聚合酶进行PCR扩增,经TA克隆和序列测定,利用在线软件对甘薯sporamin结构进行分析和功能预测.从转录组数据库中共发现61条sporamin contigs,其中sporamin A家族有31条,sporamin B家族有30条,已从甘薯中克隆到6个sporamin A基因和10个sporamin B基因.所有sporamin A基因编码区全长660 bp,基因间序列一致性为95%以上;sporamin B基因编码区全长651 bp,基因间序列一致性达到98%;两个基因家族间序列一致性为84%.对克隆的sporamin A和sporamin B进行的数字表达谱分析结果表明,sporamin A和B在膨大初期的块根和成熟块根中的转录水平最高,在膨大中期转录水平较低,在叶片和茎中表达量极低.Sporamin氨基酸保守序列和同源比对结果显示,该蛋白质含有STI(Soybean Trypsin Inhibitor)保守序列,此序列有170多个氨基酸,属于Kunitz型蛋白酶抑制剂超家族,表明该蛋白具有蛋白酶抑制剂功能.
- 赖先军古英洪王海燕张义正
- 关键词：甘薯储藏蛋白基因克隆蛋白酶抑制剂
