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郑晓皎: 作品数：15 被引量：86H指数：5; 供职机构：上海交通大学附属第六人民医院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金上海市第六人民医院院级科学研究基金国家重点基础研究发展计划更多>>; 相关领域：医药卫生生物学自动化与计算机技术理学更多>>

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转化医学科研资源管理服务平台的设计和实现被引量：3: 2016年; 转化医学研究是医学研究的新热点,资源整合和多学科协同是转化医学的特色,其对资源管理方式和信息挖掘技术有很高的依赖性和特殊需求。旨在针对转化医学研究的特点和通用流程,基于网络和数据库技术,对多款自主研发的资源管理软件进行模块化和后台化改造,依托ASP和0racle技术将所有模块进行关联和组合,为转化医学研究人员提供一站式服务,实现生物样本、临床信息、检测仪器、存储设备、实验耗材、检测数据、研究项目、标准品和研究结果等科研资源的集中化和网络化管理,提高转化医学科研资源管理的集成化、标准化和自动化程度,提高多学科协同工作的效率和资源利用率,为转化医学研宄提供技术支撑。; 郑晓皎刘佳健王守丽赵爱华王从容陈天璐; 关键词：信息化建设服务平台数据库技术一站式服务

基于超高效液相色谱-四极杆飞行时间高分辨质谱的高通量血清代谢组学方法被引量：13: 2013年; 采用超高效液相色谱-四极杆飞行时间高分辨质谱(UPLC-QTOFMS)联用技术,对血清前处理进行了考察和优化,并对液-质联用分析条件进行了优化,旨在建立用于血清中广谱小分子代谢物分析的高通量强耐用代谢组学方法,以期满足大批次生物样本数代谢组学研究的要求(样本数≥400个).通过考察不同有机溶剂沉淀蛋白对血清中蛋白的去除程度及38个代表性标准品化合物的提取效果,确定采用甲醇/乙腈(体积比1∶9)沉淀蛋白法.血清和有机溶剂的体积比不小于1∶4时,达到最佳的沉淀蛋白处理效果,符合大批量样本测试的要求;预先冷藏沉淀蛋白的有机溶剂,涡旋2 min,超声1 min,加入有机溶剂后冷冻静置10 min,可以进一步提高前处理沉淀蛋白和化合物提取的效果.通过对不同流动相体系和梯度条件的考察,对液-质联用分析条件进行了优化.方法学考察结果表明,本方法重现性、精密度及稳定性均良好.对重现性和48 h稳定性数据进行变异系数分析和主成分分析法的多维分析,证明本方法在代谢组学研究中的可重复性及所得数据的可靠性.本方法高通量强耐用,每天可测定100多个血清样本(13 min测定1个样本),适用于代谢组学研究,特别是大批次生物样本的代谢组学研究.; 成玉刘玉敏黄凤杰陈天璐郑晓皎赵爱华何品刚贾伟; 关键词：代谢组学

猪胆汁酸类化合物在制备治疗脂质代谢异常和免疫性疾病的药物中的应用: 本发明提供了猪胆汁酸类化合物在制备治疗脂质代谢异常疾病和/或免疫性疾病的药物中的应用，该猪胆汁酸类化合物包括牛磺猪胆酸、牛磺猪去氧胆酸、甘氨猪胆酸、甘氨猪去氧胆酸、猪胆酸、猪去氧胆酸或其衍生物中的一种或多种。本发明证明了...; 贾伟郑晓皎赵爱华谢国祥况俊良

代谢组学全功能软件研究进展被引量：6: 2018年; 高通量代谢组学研究的一大难点在于数据的处理和分析。为分析和处理此类数据,各种生物信息学工具应运而生。这些工具能够对复杂高维的数据集进行预处理、物质鉴定、统计分析和结果解释等。该文以代谢组学数据处理与分析的整体流程和方法为基础,对现阶段一些常用的代谢组学全功能软件进行归纳整理,并对4种代表性软件作详细介绍和对比,为代谢组学研究提供工具选择和方法学参考。; 梁丹丹李忆涛郑晓皎陈天璐; 关键词：代谢组学数据处理统计分析

肠道法尼醇X受体对糖脂代谢调节作用的研究进展被引量：3: 2019年; 法尼醇X受体(farnesol X receptor,FXR),又称为胆汁酸核受体,是配体依赖性的核转录因子,可分布于体内肝脏、肠道等多个组织器官;胆汁酸是其内源性天然配体。近年有研究表明,肠道FXR对于糖脂代谢调节具有不可或缺的作用,肠道特异性FXR激动剂或抑制剂均可参与体内糖脂代谢调节。该文对近年来报道的肠道FXR在糖脂代谢中的作用进行系统的综述。; 赵明亮赵爱华郑晓皎贾伟; 关键词：法尼醇X受体胆汁酸糖脂代谢激动剂抑制剂

代谢性疾病中胆汁酸水平变化及相关治疗策略被引量：9: 2019年; 胆汁酸作为一种信号分子可以特异性地与胆汁酸受体(如法尼醇X受体、G蛋白偶联胆汁酸受体1)结合介导一系列生物调节反应。近年发现,胆汁酸在调节糖代谢、脂质代谢和能量代谢中扮演着十分重要的角色。在代谢性疾病的发生发展过程中,也常伴随着胆汁酸谱以及受体的改变。基于胆汁酸在代谢性疾病中的重要性,未来其可能成为临床诊断、预测、评价治疗效果的潜在生物标志物。该文对胆汁酸与代谢性疾病关系以及基于调节胆汁酸代谢治疗代谢性疾病进行综述。; 况俊良郑晓皎赵爱华贾伟; 关键词：胆汁酸代谢性疾病法尼醇X受体生物标志物

血清猪胆酸类胆汁酸与糖脂代谢的相关性研究被引量：1: 2022年; 目的探讨人群血清猪胆酸类胆汁酸(HCAs)水平与糖脂代谢的关系。方法选取2009年12月至2010年6月上海肥胖研究中的受试者进行横断面研究。收集其性别、年龄、身高、体重,并计算体重指数(BMI)。检测研究对象的空腹血糖(FPG)、空腹胰岛素(FINS)、高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)等生化指标,检测受试者的血清胆汁酸谱[包括猪胆酸(HCA)、猪脱氧胆酸(HDCA)、甘氨猪胆酸(GHCA)和甘氨猪脱氧胆酸(GHDCA)等]并计算血清总猪胆酸类胆汁酸(总HCAs)。根据公式计算受试者的稳态模型评估β细胞功能指数(HOMA-β)及Gutt-胰岛素敏感性指数(Gutt-ISI)等。根据研究对象的BMI以及是否患有2型糖尿病(T2DM)将其分为3组:健康对照组、单纯超重/肥胖组及超重/肥胖T2DM组。采用Kruskal-WallisH检验、Mann-WhitneyU检验或χ2检验对组间相应指标进行比较。采用Spearman相关分析法和多重线性回归探讨HCAs与糖脂代谢指标的相关性。结果共纳入304例研究对象。其中,健康对照组127例,单纯超重/肥胖组107例,超重/肥胖T2DM组70例。与健康对照组相比,超重/肥胖T2DM组的总HCAs、HCA、GHCA、GHDCA均更低(P<0.05)。在校正性别、年龄和BMI后,HCA与LDL-C呈负相关(β=-0.006,P=0.011),而与Gutt-ISI呈正相关(β=0.496,P=0.003);HDCA与Gutt-ISI呈正相关(β=0.240,P=0.028);GHCA与FINS(β=0.048,P=0.011)、HOMA-β(β=0.582,P=0.032)均呈正相关。结论超重/肥胖T2DM患者的多个血清HCAs水平显著降低;HCAs水平的降低与超重/肥胖T2DM患者血脂异常、胰岛β细胞功能受损以及胰岛素抵抗密切相关。; 郑江菲金力彭丹凤郑晓皎陈天璐何珍胡承; 关键词：超重肥胖症糖脂代谢

代谢物批量定量工具的开发与应用被引量：1: 2015年; 目的针对代谢组学研究中的定量分析需求,开发一款可以自动绘制标准曲线和定量计算的软件工具,并采用该工具对一批临床血清样本进行定量计算。方法使用代谢物批量定量工具对临床血清样本的代谢组学检测结果进行定量计算,包括建立标准曲线、自动拟合和手动拟合及样本中代谢物的定量。结果建立40个代谢物的标准曲线,对90例临床血清样本进行定量计算,获得绝对浓度。结论代谢物批量定量工具可以对代谢组学研究中批量样本的大量代谢产物进行快速定量计算。软件具备数据变换和缺失值补充等基本数据预处理功能。该软件的应用有助于提升代谢组学物质定量环节的自动化和标准化程度,有效降低人为因素导致的误差,提高数据分析的效率和准确性。; 卫润民黄凤杰谢燮池逸郑晓皎赵爱华陈天璐; 关键词：代谢组学自动化

肠道菌-宿主代谢物组的分析平台的建立及应用: 哺乳动物是一个由动物体和体内共生的微生物共同组成的“超级生物体”。体内微生物主要分布在与外界相通的腔道内，其中胃肠道细菌最为复杂、对机体最为重要。肠道菌群与其宿主在长期的进化过程中建立了密切的关系，发挥着重要的生理功能，...; 郑晓皎; 关键词：分子机制

代谢组学技术在多组分中药药代动力学中的应用被引量：5: 2016年; 传统的药代动力学研究的是单一或者几种有效成分在生物体内的动态变化过程。中药的多组分、多靶点、多效应等特点决定了其药代动力学的复杂性。药代动力学研究的片面性将限制人们对中药、复方制剂的药理和毒理认识的准确性,已成为中医药现代化研究中的瓶颈之一。代谢组学技术依托先进的高通量测试平台和多种大数据挖掘技术,能够同时获得并分析数百种甚至数千种小分子物质的波动情况,为复杂组分的PK研究提供了新的契机。本文综述了2010年以来多组分中药的药代动力学研究进展,介绍了代谢组学技术在其中的成功应用,重点介绍了两种新的整合了代谢组学和传统PK思想的中药方证代谢组学和中药多组分药代动力学研究策略(Polypharmacokinetics,Poly-PK),并展望了两种研究策略在中药药理学研究中的发展前景和所面临的技术挑战。; 王守丽黄凤杰郑晓皎陈天璐; 关键词：药代动力学代谢组学

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