逄宇
- 作品数：57 被引量：545H指数：14
- 供职机构：中国疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项比尔和梅琳达·盖茨基金福建省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学更多>>
- 快速DNA提取环介导等温扩增技术检测结核分枝杆菌的成本分析被引量：1
- 2014年
- 结核病的早期诊断，对于很好地控制结核病的传播具有十分重要的意义。固体培养具有很高的诊断价值，但耗时较长，至少需要6～8周的时间。近年来涌现出很多新的技术和方法用于结核分枝杆菌的快速诊断及鉴定。然而除了检测效能，检测成本也是制约各种技术或方法能否推广的决定性因素之一。结核分枝杆菌快速DNA提取环介导等温扩增检测技术（procedure for ultra rapid extraction of loop-mediated isothermal amplification, PURE-LAMP；Eiken Chemical，日本）是一种基于分子生物学原理的快速检测试剂盒，整个试剂盒采用封闭的反应体系，在反应体系内加入2条内引物和2条外引物，
- 欧喜超夏辉李强逄宇赵冰张治英李俊晨章建康池俊英赵雁林
- 关键词：环介导等温扩增结核分枝杆菌DNA提取快速检测试剂盒
- 单耐利福平结核分枝杆菌耐药分子机制研究被引量：6
- 2012年
- 目的探讨单耐利福平结核分枝杆菌中耐药相关基因突变以及药物外排泵两种不同耐药机制的功能。方法从国家结核病参比实验室2007—2008年全国耐药基线调查菌株库中挑选单耐利福平的菌株23株。采用直接测序法检测利福平耐药相关基因rpoB突变情况。提取rpoB无突变菌株的RNA后反转录并采用real-timePCR方法检测20个药物外排泵基因的表达量,对比菌株最低抑菌浓度(minimum inhibitory concentration,MIC)实验结果,筛选可能与利福平药物外排相关的基因,并选用大肠埃希菌为模式生物,构建表达载体,检测过表达目的外排泵的大肠埃希菌对利福平的耐药程度以验证。结果在23株单耐利福平的菌株中,有16株(69.6%)检测到rpoB突变,其中包括531位点突变9株,526位点突变6株及533位点突变1株。Ser531Leu、His526Asp表现为高浓度耐药,其MIC分别为192μg/ml和256μg/ml;而突变类型His526Gly、His526Leu、His526Arg和Leu533Pro表现为低浓度耐药,其MIC分别为0.75μg/ml、4μg/ml、2μg/ml和0.5μg/ml。在rpoB未突变菌株中,通过real-time PCR发现Rv2936、Rv0783和Rv0933的转录水平与MIC呈正相关。在对照组和转入pEASY-E1-Rv0933的大肠埃希菌中MIC均为8μg/ml,而转入pEASY-E1-Rv2936和pEASY-E1-Rv0783的大肠埃希菌的MIC均有不同程度的提高,分别为32μg/ml和16μg/ml。结论不同耐药突变类型导致的耐药程度不同,Rv2936和Rv0783可能是与利福平耐药相关的的药物外排泵基因。
- 逄宇李桂莲王玉峰宋媛媛李强欧喜超董海燕赵雁林
- 关键词：利福平
- 两种耐药结核病检测方法的成本分析
- 2015年
- 目的评价传统药敏试验和基因芯片方法检测耐药结核病的成本,探讨基因芯片诊断耐药结核病的应用价值。方法按照"要素法"收集四个市级实验同时开展传统药敏试验和基因芯片方法检测耐药结核病的资料,进行成本分析。结果传统药敏试验检测一例耐药结核病的平均成本为334.1元,而基因芯片方法成本为141.0元。结论基因芯片方法检测一例耐药结核病成本较传统药敏试验要低,市级实验室适合开展基因芯片检测耐药结核病。
- 王素萍李辉逄宇赵雁林
- 关键词：结核病基因芯片耐药
- 结核分枝杆菌北京基因型菌株的流行特征及其与耐药的关系——2007年全国结核病耐药基线调查资料分析被引量：10
- 2015年
- 目的探讨结核分枝杆菌北京基因型菌株的流行特征及其与耐药的关系。方法2007年我国开展全国结核病耐药基线调查，调查覆盖除香港、澳门和台湾地区外的全国31省（自治区、直辖市），含70个调查点。本研究对来自基线调查的3861例涂阳结核病患者的分离菌株进行分析，采用比例法进行药物敏感性试验，以间隔区寡核苷酸分型（Spoligotyping）方法对结核病患者的分离株进行基因分型。采用EpiInfo3．5．1建立数据库，SAS9．1软件进行统计学分析，以卡方检验分析不同变量之间的关系，以P〈0．05为有统计学意义。结果北京基因型菌株在我国广泛流行，占总分离菌株的63．97％（2470／3861）。感染北京基因型菌株与年龄（〈30岁和≥60岁：OR=0．9604，95％CI=0．7995～1．1536；30～岁和≥60岁：OR=1．0620，95％CI=0．9071～1．2434，x^2=0．3885，Ptrend=0．6977）、性别（OR=1．1526，95％CI=0．9973～1．3321，x^2=3．7024，P=0．0543）无关；北京基因型菌株与抗结核药物INH（OR=0．9020，95％CI=0．766～1．0619，x^2=1．5356，P=0．2153）、RFP（OR=1．0017，95％CI=0．8166～1．2288，x^2=0．0003，P=0．9868）、Sm（OR=0．9406，95％CI=0．8139～1．08711，x^2=0．6869，P=0．4072）、EMB（OR=0．9222，95％Ci=0．7205～1．1804，X^2=0．4140，P=0．5199）、Ofx（OR=0．9624，95％CI=0．6923~1．3378，x^2=0．0520，P=0．8196）和Km（OR=1．1666，95％CI=0．7624～1．7852，x^2=0．5049，P-0．4774）任何耐药均无关联；与单耐INH（OR=0．9955，95％CI=0．7206~1．3753，x^2=0．0007，P=0．9783）、RFP（OR=0．9615，95％CI=0．4880～1．8944，x^2=0．0129，P=0．9096）、EMB（O=0．5533，95％CI=0．2023～1．5136，x^2=1．3675，P=0．2422）、0fx（OR=0．8445，95％CI=0．3965～1．7984，x^2=0．1926，P=0．6608）、Km（OR=1．7779，95％CI=0．4440~7．1203，x^2=0．6791，P=0．4099）也均无关联；与耐�
- 王胜芬周杨逄宇赵雁林
- 关键词：结核分枝杆菌基因型抗药性
- 加强结核病的科学研究被引量：12
- 2013年
- 我国结核病疫情严峻，如若不能有效控制结核病在我国的流行，那么wHO确定的在2050年基本消除结核病的目标将不能实现。结核病的有效控制离不开科学研究提供的技术支撑；结核病的防治需要依靠日益进步的科学技术，就科学研究的应用性而言，亦需面向结核病防治；耐药结核病是人类与结核病长期斗争过程中，必须高度重视和着力解决的问题。1948年英国医学委员会组织的世界上第一个大规模临床试验（关于链霉素的临床应用治疗肺结核）开创了循证医学的先河，该研究被誉为世界上第一个发表的随机对照试验，为后来的相关研究奠定了方法学的参照和标准。
- 逄宇赵雁林
- 关键词：结核病疫情大规模临床试验随机对照试验循证医学耐药结核病
- 耐多药结核分枝杆菌对贝达喹啉的耐药性及其与基因型关系分析被引量：5
- 2016年
- 目的分析耐多药结核分枝杆菌菌株对贝达喹啉（Bedaquiline, BDQ）的耐药性并探讨耐药表型与基因型之间的关联，为临床合理使用贝达喹啉治疗耐多药结核病（multidrug-resistant tuberculosis, MDR-TB）提供科学依据。方法选取2015年重庆市结核病防治所分离的全敏感临床株100株、MDR-TB临床株77株、2007—2008年全国结核病耐药基线调查收集的MDR-TB菌株210株，采用微孔板法测定BDQ的最低抑菌浓度（MIC），并采用间隔区寡核苷酸分型方法（Spoligotyping）对其进行基因分型，进一步比较MDR-TB菌株中北京基因型和非北京基因型的BDQ耐药率差异。结果287株MDR菌株中，BDQ的MIC50为0.03 μg/ml，MIC90为0.25 μg/ml，BDQ耐药株19株，耐药率为6.6%（19/287），北京基因型菌株195株，非北京基因型菌株92株，北京基因型菌株对BDQ的耐药率[4.6%（9/195）]低于非北京基因型[10.9%（10/92）]（χ^2＝3.955，P＝0.047）。100株全敏感菌株中，BDQ的MIC50为0.03 μg/ml，MIC90为0.12 μg/ml，北京基因型与非北京基因型菌株数分别为63株、37株，均未发现BDQ耐药株。结论BDQ对MDR结核分枝杆菌有较好的体外抗菌活性，MDR菌株非北京基因型与BDQ耐药相关，北京基因型菌株对BDQ的敏感性优于非北京基因型。
- 胡彦逄宇郑惠文赵雁林刘洁杜昌廷胡代玉
- 关键词：结核分枝杆菌MDR药物敏感性基因型
- 宁夏回族自治区结核分枝杆菌基因分型及与耐药性关系的研究被引量：16
- 2013年
- 目的利用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)方法对宁夏回族自治区(简称"宁夏")结核分枝杆菌流行株进行分型研究,并分析北京基因型与耐药性的相互关系。方法搜集宁夏结核分枝杆菌临床分离株115株,应用Spoligotyping方法进行基因分型研究,采用BioNumerics软件将分型结果进行基因聚类分析。应用比例法药物敏感性试验对115株结核分枝杆菌进行检测,最后将药敏结果结合基因型及流行病学资料进行分析。采用卡方检验比较不同组间结果的差异。结果在分离培养的115株菌株中,具有特异Spoligotyping指纹图谱的北京基因型菌株90株,占78.3%(90/115),25株为非北京基因型,占21.7%(25/115)。90株北京基因型菌株中,41株为古代基因型(45.6%,41/90),任意耐药株为16株(17.8%,16/90);49株为现代基因型(54.4%,49/90),任意耐药株为33株(36.7%,33/90),两者间差异无统计学意义(χ2=1.27,P>0.05)。结论宁夏结核分枝杆菌以北京基因型流行为主,结核分枝杆菌北京基因型与耐药性之间无明显相关性。
- 王晓平逄宇赵晓王晓林王玉峰肖慧霞王福锐刘晓妮赵雁林
- 关键词：分枝杆菌结核基因型基因分型技术
- 结核性脑膜炎临床分离株基因型和耐药表型的特征分析被引量：11
- 2013年
- 目的了解导致结核性脑膜炎(TBM)的致病菌在基因型和耐药表型方面的特征。方法利用间隔区寡核苷酸分型法(Spoligotyping)和数目可变串联重复序列(VNTR)分型法对25株TBM临床分离菌株进行基因分型;采用MGIT(mycobacteria growth indicator tube)960液体和比例法固体药敏试验分别对所选15种药物:异烟肼(INH)、利福平(RFP)、乙胺丁醇(EMB)、吡嗪酰胺(PZA)、链霉素(S)、卡那霉素(Km)、阿米卡星(Am)、卷曲霉素(Cm)、莫西沙星(Mfx)、氧氟沙星(Ofx)、左氧氟沙星(Lfx)、对氨基水杨酸(PAS)、乙硫异烟胺(Eto)、丙硫异烟胺(Pto)、环丝氨酸(Cs)进行药敏实验。结果Spoligotyping分型法确定了在25株TBM临床分离株中有20株为北京基因型,占80.0%(20/25),2株为T1基因型,另外3株分别为T2型、LAM6型及未知型;VNTR有2株成一簇,基因型一样;25株TBM分离株中耐多药结核性脑膜炎(MDR-TBM)占12.0%(3/25),广泛耐药结核性脑膜炎(XDR-TBM)占4.0%(1/25),耐氟喹诺酮类的菌株占8.0%(2/25),都属于北京基因型;任意耐药的菌株占48.0%(12/25),其中83.3%(10/12)为北京基因型;全敏感者占52.0%(13/25),其中76.9%(10/13)为北京基因型。结论北京基因型在耐药TBM中所占比例很高,尤其是MDR-TBM,较其他基因型更易引起脑脊液生化的改变;耐氟喹诺酮类的菌株所占比例最少,提示临床上氟喹诺酮类药物对治疗TBM会有很好的疗效。
- 王婷赵雁林刘家云逄宇周杨赵冰赵钢
- 关键词：结核脑膜分枝杆菌结核基因型
- 相对定量分析异烟肼、链霉素单耐药与多耐药结核分枝杆菌临床分离株的蛋白质组差异被引量：2
- 2018年
- 【目的】探讨异烟肼(isoniazid,INH)、链霉素(streptomycin,SM)单耐药结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)与INH/SM多耐药MTB蛋白质组差异。【方法】应用i TRAQ结合Nano LC-MS/MS定量蛋白质组学技术,分析临床分离INH、SM或INH/SM耐药MTB与H37Rv标准株间均表达差异蛋白;并以INH/SM耐药MTB与H37Rv比值为对照,相对定量分析单耐药与多耐药MTB蛋白表达差异倍数;运用DAVID 6.7分析差异蛋白生物功能;STITCH 5.0分析差异蛋白与INH和SM相互作用。【结果】与H37Rv标准株比较,58个蛋白在INH、SM耐药与INH/SM耐药MTB间均有表达差异,共同差异蛋白生物功能主要为氧化还原酶活性和转移酶活性;主要参与丙酸代谢信号通路。共同差异蛋白中,与INH/SM耐药MTB比较,Rv2986c和Rv1908c在INH、SM耐药MTB均表达上调>1.25倍;Rv3133c和Rv0577则均表达下调<0.7倍;生物信息学预测发现以上4种蛋白可直接或间接与INH、SM进行相互作用。【结论】INH、SM单耐药和INH/SM多耐药MTB蛋白表达谱有较大差异,蛋白Rv2986c、Rv1908c、Rv3133c和Rv0577表达水平及相互作用可能与INH和SM耐药有关。
- 朱传智赵雁林黄香玉逄宇庄玉辉何秀云
- 关键词：结核分枝杆菌异烟肼链霉素
- 建立适合我国结核分枝杆菌特征的可变串联重复序列（VNTR）分型方法被引量：6
- 2014年
- 建立相对统一的结核分枝杆菌基因分型方法对掌握我国流行菌株的遗传特征及评估各地区结核病的近期传播有重要意义。结核分枝杆菌可变串联重复序列（VNTR）分型在全球范围内得到了广泛运用，Philip Supply等于2006年提出的15／24位点VNTR（VNTR-15／24）是目前应用最多的方案，但该方案对我国高度流行的北京家族菌株的分辨率较低。
- 罗涛杨崇广逄宇赵雁林梅建高谦
- 关键词：可变串联重复序列结核分枝杆菌基因分型方法流行菌株
