柳清云
- 作品数：6 被引量：70H指数：4
- 供职机构：复旦大学更多>>
- 发文基金：艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家科技重大专项上海市科学技术委员会资助项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 结核分枝杆菌(MTB)异质性耐药研究进展被引量：21
- 2013年
- 异质性耐药,是指在同一样本中同时存在耐药菌和敏感菌的现象,这体现了细菌群体从部分耐药向完全耐药转变的过程。研究异质性耐药对于认识耐药结核病的发展过程,以及评估治疗方案和指导临床用药具有重要的意义。本文对结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)异质性耐药的产生及其对临床的影响进行了综述。
- 柳清云孙刚高谦
- 关键词：耐药结核病
- 异质性耐药对结核分枝杆菌表型和基因型耐药检测结果的影响被引量：36
- 2014年
- 目的 研究异质性耐药对MTB基因型耐药检测结果的影响.方法 选择上海市疾病预防控制中心在2009年收集的80株氧氟沙星临床耐药菌株,利用基因测序检测菌株在gyrA和gyrB耐药决定区的基因突变情况,再用分子克隆和荧光定量PCR探针熔解曲线法,分析经基因测序未检测到耐药突变的菌株中是否存在异质性耐药现象.结果 基因测序报告显示,80株氧氟沙星耐药菌株中有15株未发现已知gyrA或gyrB耐药决定区的基因突变.测序图谱及分子克隆和探针熔解曲线法分析结果表明,其中14株菌株含有已知gyrA耐药突变,即存在异质性耐药现象.纳入异质性耐药的菌株后,基因型与表型耐药检测的符合率从81.3％（65/80）提高到98.8％（79/80）.结论 异质性耐药是导致表型和基因型耐药检测结果不符的重要原因.为排除异质性耐药对耐药基因检测的影响,提高基因型与表型耐药检测结果的一致性,需要开发应用更敏感的基因型耐药检测技术,以提高耐药结核病快速检测水平.
- 高旭李静柳清云沈鑫梅建高谦
- 关键词：分枝杆菌结核遗传异质性
- 不同可变数目串联重复序列组合鉴定结核分枝杆菌临床菌株分型的效果被引量：9
- 2015年
- 目的 探讨不同可变数目串联重复序列（VNTR）组合鉴定MTB临床菌株分型的效果并在全国推广使用.方法 连续收集国内5个区县的891株MTB菌株样本,通过计算不同VNTR组合的分辨力指数（HGI）,系统评估目前常用的VNTR分型组合,包括国外推荐的12个散在分布重复单位（MIRU）位点组合（MIRU-12）、15/24 VNTR位点组合（VNTR-15/VNTR-24）、24 VNTR位点加4个高变位点组合（VNTR“24＋4”）以及国内吕冰等建立的15位点组合（VNTR-L15）和本课题组筛选的VNTR“9＋3”组合.结果 分辨力由高至低依次为VNTR“24＋4”（0.999 2）、VNTR“9＋3”（0.998 9）、VNTR-24 （0.992 9）、VNTR-15 （0.988 4）、VNTR-L15 （0.970 9）、MIRU-12（0.924 8）.VNTR“9＋3”的分型能力不仅超过VNTR-15,且高于VNTR-24,与分辨力最高的VNTR“24 ＋4”组合分型结果一致的菌株数为822株,一致率达到96.6％ （822/851）.结论 VNTR“9＋3”的分辨力和分型结果均与VNTR“24＋4”相当,且具有位点数少、工作量小,易于推广的优点.建议将VNTR“9＋3”组合作为我国MTB基因型分型的推荐方案推广应用.
- 刘梅罗涛杨崇广柳清云高谦
- 关键词：串联重复序列基因型
- 结核分枝杆菌复合群快速鉴定方法及试剂盒
- 本发明属检测试剂领域，涉及核分枝杆菌复合群检测鉴定试剂盒及结核分枝杆菌复合群鉴定的方法，本方法通过序列比对，设计了用于检测结核分枝杆菌复合群的荧光探针及扩增引物，并基于实时荧光定量PCR平台，通过非对称扩增PCR技术和探...
- 罗涛柳清云高谦
- 文献传递
- 不同VNTR组合对我国结核分枝杆菌基因型分析的效果评估
- ：评估适用于我国结核分枝杆菌菌株基因型特点的VNTR分型组合.方法：利用在全国5个区县连续收集的851株菌株样本,系统地评估目前常用的VNTR组合.结果：分辨力由高至低依次为VNTR"24+4" 、V...
- 刘梅罗涛杨崇广柳清云高谦
- 关键词：结核分枝杆菌基因分型流行病学
- 双通道实时荧光PCR熔解曲线法检测结核分枝杆菌药物耐药相关基因突变被引量：6
- 2013年
- 目的基于双标记荧光探针熔解曲线分析技术，建立一种利用实时荧光PCR快速检测结核分枝杆菌耐药突变的方法。方法根据结核分枝杆菌一线药物常见耐药突变位点（包括rpoB81bp耐药决定区、inhA启动子、katG315、ahpC启动子以及embB306）设计6条荧光双标记探针和对应引物，通过PCR扩增耐药突变位点所在基因片段，在扩增完成后通过熔解曲线检测分析实现对耐药突变的快速检测。通过对2008年上海市疾控中心收集的76株临床耐多药（MDR）菌株进行检测，验证本方法的敏感度和特异度。结果本方法成功从76株MDR菌株中检测出相关耐药突变，各种突变对应△Tm值范围为1．8～14．4℃。将检测结果和测序结果对比表明该方法检测敏感度和特异度都为100％（rpoB，80／80；inhA，7／7；katG315，59／59；ahpC，8／8；embB306，27／27）。本方法可以成功从最低浓度为100拷贝／μl的结核分枝杆菌DNA样本中准确地检测耐药突变。结论双通道实时荧光PCR熔解曲线法可以快速灵敏地检测结核分枝杆菌常见耐药突变。该方法具有检测迅速准确、结果易判读、交叉污染概率低等特点，可用于快速检测临床结核耐药相关的基因突变，并对结核耐药情况进行评估。（中华检验医学杂志．2013．36：63-67）
- 柳清云罗涛李静梅建高谦
- 关键词：实时聚合酶链反应分枝杆菌结核
