朱家璧 作品数:18 被引量:49 H指数:5 供职机构: 中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所 更多>> 发文基金: 国家重点基础研究发展计划 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
苜蓿中华根瘤菌Sm NifA蛋白与阴沟肠杆菌Ec NifA蛋白功能差异的研究 被引量:7 2003年 nifA基因是固氮基因nif的调节基因,其产物NifA蛋白是固氮过程的中心调节因子。将多拷贝组成型表达的苜蓿中华根瘤菌(Sinorhizobium meliloti,Sm)nifA基因或阴沟肠杆菌(Enterobacter cloacae,Ec)nifA基因引入苜蓿中华根瘤菌野生型菌株Sm 1021和苜蓿中华根瘤菌nifA突变型菌株SmY中,并检测这些苜蓿中华根瘤菌感染苜蓿之后根瘤的表型及固氮酶活性。实验结果表明,苜蓿中华根瘤菌NifA蛋白和阴沟肠杆菌NifA蛋白在苜蓿中华根瘤菌中的功能有明显差异。在野生型菌株Sm 1021中,引入多拷贝SmnifA基因对宿主根瘤固氮效率的促进作用明显优于引入多拷贝Ec nifA基因的作用。引入多拷贝Sm nifA基因的SmY菌株(nifA突变型)能够共生固氮,而引入Ec nifA基因的SmY菌株仍然不能固氮。氨基酸序列同源性分析显示,N末端结构域是Sm NifA蛋白和Ec NifA蛋白同源性最低的功能域。进一步研究表明,Sm NifA蛋白的N末端结构域在互补苜蓿中华根瘤菌nifA突变型菌株SmY的固氮功能时是必需的。 杨成涛 俞冠翘 沈善炯 朱家璧关键词:苜蓿中华根瘤菌 阴沟肠杆菌 同源性 苜蓿中华根瘤菌烯脂酰ACP还原酶基因fabI1的功能研究 被引量:3 2009年 我们先前的工作表明,苜蓿中华根瘤菌的烯脂酰ACP还原酶基因fabI1在nifA突变根瘤中表达水平降低.本研究构建了fabI1的定点插入突变体.与野生型相比,突变菌株的生长速度变慢,在高浓度NaCl培养基上的生长能力降低.在半固体培养基上,该突变体的涌动能力完全丧失.在共生过程中,突变菌株在宿主植物上延迟结瘤,形成根瘤的能力下降.虽然苜蓿中华根瘤菌中的烯脂酰ACP还原酶基因fabI2的序列与fabI1有66%的一致性,但fabI2不能恢复fabI1突变体的表型,揭示了这两个基因在功能上的差异. 刘影 朱家璧 俞冠翘 邹华松关键词:苜蓿中华根瘤菌 表型 结瘤 苜蓿根瘤菌nodD3P1启动子下游序列的调节功能 被引量:4 1999年 苜蓿根瘤菌 (Rhizobiummeliloti)结瘤正调节基因nodD3的P1启动子到编码区间有一长6 6 0bp的序列 ,称为P1下游序列 ,内含两个潜在的开放阅读框 (ORF) ,即ORF1和ORF2 .其中ORF2可编码一个含 86个氨基酸残基的多肽 .构建P1下游序列缺失的一系列nodD3P1启动子lacZ转录融合子 ,测定它们的表达活性 ;并进一步研究ORF2对nodD3P1启动子表达的影响 。 朱冰 戴小密 朱家璧 俞冠翘 沈善炯关键词:苜蓿根瘤菌 基因表达 苜蓿根瘤菌多拷贝固氮基因启动子对根瘤发育的抑制 被引量:4 1994年 以荧光素酶基因作为报道基因研究苜蓿根瘤菌nif/fix基因在根瘤发育过程中的激活,发现多拷贝的nifHDK启动子和fixABCX启动子抑制根瘤的发育和固氮活性,与nifA突变型的表型相同.用β-半乳糖苷酶基因作为报道基因得到同样的结果。但是低拷贝的nifHDK启动子或fixABCX启动子对根瘤发育和固氮活性没有影响。固氮基因启动子的多拷贝抑制效应进一步说明nifA产物除了作为共生固氮基因转录的正调节因子外,对根瘤的发育也有作用。 吴桐 朱家璧 俞冠翘 沈善炯关键词:苜蓿根瘤菌 固氮基因 苜蓿中华根瘤菌(Sinorhizobium meliloti) nifA基因通过诱导宿主防卫反应调节根瘤的形成 被引量:2 2007年 苜蓿中华根瘤菌nifA基因是固氮基因的正调节因子,本文研究了nifA基因对根瘤形成的调节作用.在分裂根实验中,nifA突变株对另一侧根的结瘤抑制率比野生型菌下降43.7%,感染突变株植物合成的植保素和形成的坏死细胞的数量也相应减少,与植物防卫反应相关的苯丙氨酸解氨酶基因、查儿酮合成酶基因和几丁质酶基因不能表达.这些结果说明,苜蓿中华根瘤菌nifA基因通过诱导宿主植物的防卫反应对根瘤的形成进行调节.虽然nifA突变株在宿主植物上引发根瘤的数量增加,它合成的结瘤因子的量却比野生型菌株少.因此,可以推测nifA基因介导了多种信号途径对根瘤的形成进行调节. 陈笑涛 邹华松 姚振华 CHENG HaiPing 戴小密 朱家璧 俞冠翘关键词:NIFA基因 防卫反应 根瘤形成 结瘤因子 苜蓿根瘤菌固氮酶基因启动子P1转录起始点下游顺序(DS)的特性 被引量:5 1996年 自生状态的苜蓿根瘤菌(Rhizobium meliloti)nifHDK操纵子的启动子P1能被微氧诱导而呈高水平表达,而fixABCX操纵子的启动子P2则呈微弱的表达.P1和 P2的 DNA顺序从转录起始点到上游-160处具有 85%的同源性,但从转录起始点到翻译起始点的核苷酸顺序则完全不同.用P1转录起始点下游从+17到+61核苷酸的DNA片段(DS)取代P2区的相应的DNA顺序,在自生状态微氧诱导条件下能提高P2的表达水平,在大肠杆菌中有NifA存在时P2亦呈高水平表达,说明P1和P2区的DS顺序是决定P1和P2自生状态微氧诱导条件下表达或异源表达差异的根本原因.在共生状态下P2的表达不依赖启动子下游顺序.采用引物延伸法测定 P2的转录起始点,发现 P2区当引入 P1区的 DS后不改变它的转录起始点.由于P2不论有DS的插入与否均不影响其在根瘤菌共生状态的正常表达,因此P2在自生状态的根瘤菌中与共生状态时的表达调节将有所不同. 高云峰 吴桐 朱家璧 俞冠翘 沈善炯关键词:苜蓿根瘤菌 启动子 转录 苜蓿根瘤菌的正调节蛋白SyrM与nodD3基因P1上游区结合的位点及特性 被引量:1 1998年 在苜蓿根瘤菌中 ,nodD3分别由 2个启动子P1和P2在不同条件下介导表达 .通过凝胶滞后技术进一步研究与nodD3基因P1介导表达有关的反式作用因子 ,证明SyrM能与P1上游区结合 ,而NodD3则不能 ,因而排除了NodD3直接自身激活的可能性 .利用DNA酶Ⅰ足印分析确定了SyrM结合于nodD3基因P1上游区的顺式因子序列 ,在该序列中含有 2个顺向重复的反转重复结构 .通过合成的只含有 1个反转重复结构的 3种寡核苷酸片段与SyrM进行结合分析 ,结果表明SyrM不能与它们结合 。 肖晖 沈善炯 朱家璧关键词:根瘤菌 苜蓿根瘤菌 苜蓿根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)nodD3P1启动子下游序列的缺失和互补分析 被引量:2 2002年 在苜蓿根瘤菌中,nodD3基因的转录由两个彼此分离的启动子P1和P2控制.在P1下游是一段由660 bp组成的序列,接着是nodD3的编码区.由P1下游序列3’末端开始缺失得到的一系列缺失突变体的遗传分析指出,P1下游+1~+125 nt序列对P1的表达是必须的.互补分析和结瘤试验指出,ORF2自我抑制P1的表达,而+1~+125nt序列可对抗ORF2对P1的抑制作用. 陈迪 刘彦杰 朱家璧 沈善炯 俞冠翘关键词:启动子 编码区 质粒构建 异源nifA基因对苜蓿中华根瘤菌nifA突变体的互补分析 被引量:4 2006年 为深入研究苜蓿中华根瘤菌NifA的特性,分别用组成型表达的慢生型大豆根瘤菌和紫云英根瘤菌的nifA基因互补苜蓿中华根瘤菌nifA突变体,观察其共生表型.结果表明,慢生型大豆根瘤菌和紫云英根瘤菌nifA基因不能互补苜蓿中华根瘤菌nifA突变体的共生表型.以苜蓿中华根瘤菌nifA突变体为遗传背景,利用全基因组微阵列实验比较分析引入异源nifA基因后产生的基因表达谱的变化.结果显示,苜蓿中华根瘤菌自身NifA蛋白引起238个基因的表达发生变化.这些表达差异的基因分属共生、能量和中心代谢、持家、细胞结构与运输等生物学功能组.慢生型大豆根瘤菌、紫云英根瘤菌和阴沟肠杆菌的NifA蛋白分别引起了20,7和9个基因的表达发生变化.这些基因主要是固氮相关基因,但差异不及苜蓿中华根瘤菌NifA互补菌明显.以苜蓿中华根瘤菌nifH启动子与lacZ融合基因为报道基因,研究nifH的表达.结果指出,慢生型大豆根瘤菌和紫云英根瘤菌的NifA蛋白只能部分激活苜蓿中华根瘤菌nifH的表达,激活水平分别为苜蓿中华根瘤菌NifA蛋白激活率的70%和50%,与微阵列实验结果相符. 姚振华 田哲贤 戴小密 Anke Becker 李健 严海芹 肖琰 朱家璧 俞冠翘 Silvia Rüberg 王忆平 邹华松关键词:SINORHIZOBIUM MELILOTI Disruption of nifA Gene Influences Multiple Cellular Processes in Sinorhizobium meliloti 2007年 Sinorhizobium meliloti nifA is important in fixing nitrogen during symbiosis. A nifA null mutant induces small white invalid nodules in the roots of host plant. The additional phenotypic alterations associated with the disruption of the nifA gene are reported in this study. Under a free-living state, S. meliloti nifA mutant reduces its ability to swarm on a half-solid plate. Interestingly, the AHL (Acylhomoserine lactones) contents in the nifA mutant are lower than that of the wild type during the lag phase, whereas it is reversed in the logarithmic and stationary phases. Quantitative spectrophotometric assays reveal that the total amount of extracellular proteins of the nifA mutant are lower than that of the wild type. In addition, the mutant abolishes its nodulation competitive ability during symbiosis. These findings indicate that NifA plays a regulatory role in multiple cellular processes in S. meliloti. 巩子英 朱家璧 俞冠翘 邹华松关键词:NIFA SWARM