何翔 作品数:36 被引量:163 H指数:8 供职机构: 广东省疾病预防控制中心 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 国家自然科学基金 国家科技重大专项 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 自动化与计算机技术 更多>>
苏云金杆菌毒蛋白基因克隆和工程菌株构建 陈启民 耿运琪 马明 刘淑红 王金忠 陈晨 何翔 刘子敬 刘坤 李冬颖 将地衣芽孢杆菌(B.licheniformis)的热稳定α-淀粉酶基因通过原生质体转化的方法引入Bt.ken-Ag,构建成高效工程菌株,解决了发酵液中淀粉固形物含量高和粘度大的问题。以pUC19为母体,加入pUC4K的K...关键词:关键词:苏云金芽孢杆菌 毒蛋白 生物杀虫剂 贵州省HIV-1毒株基因亚型变异特征分析 被引量:4 2011年 目的分析贵州省人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)毒株亚型的变异特征,为获得性免疫缺陷综合征(艾滋病,AIDS)防治提供科学依据。方法收集贵州省1998、2002、2007年HIV-1感染者190例,采集血液样品,采用巢式聚合酶链反应(nested PCR)扩增env基因并进行测序分析,与国际标准亚型毒株和其他地区阳性株进行对比,根据[同源性、离散率等]分析HIV-1毒株亚型的变异特征。结果贵州省HIV-I毒株经变异产生3种新亚型毒株,B、B'、C亚型通过基因重组变异为CRF 07-BC、CRF08-BC流行性重组亚型毒株;E亚型毒株变异成了CRF01-AE重组亚型毒株;3种亚型毒株分别占当年核酸检测阳性数的63.41%、36.59%、52.10%;CRF07-BC、CRF08-BC与来源于印度的C.IN.92.同源,CRF01-AE与从欧美传入泰国的01AE.TH90.同源;变异后的BC亚型组内基因离散率为(0.049±0.007)%,AE亚型的组内基因离散率为(0.064±0.008)%。结论贵州省的HIV-1毒株具有高度变异特性;HIV-I变异毒株在传播和流行中较易形成当地流行的优势毒株。 孙显光 邢辉 李志坚 何翔 申莉梅 邵一鸣河北省不同途径感染人群HIV-1基因亚型分析 被引量:8 2011年 目的了解河北省不同途径感染人群艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)亚型分布特点。方法从感染者的血浆样品中提取病毒RNA,反转录后采用套式聚合酶链反应(Nested PCR)扩增HIV-1 gag和env基因的部分片段,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考株序列比对,进行系统进化树分析,确定基因型。结果对154份HIV-1感染者的样品进行扩增,得到了146份样品的HIV-1基因片段。发现6种HIV-1亚型和重组型,其中B’亚型61例(41.8%),CRF01_AE 59例(40.4%),CRF07_BC 16例(11.0%),CRF08_BC 6例(4.1%),C亚型和B01重组株各2例(1.4%)。血液途径传播为B’亚型,男男性行为传播以CRF01_AE和B'亚型为主。结论河北省不同途径感染人群HIV-1亚型分布具有明显的人群特征。血液途径传播者为单一B’亚型,性传播人群中亚型分布较广。 赵翠英 李巧敏 李保军 赵宏儒 路新利 李岩 王莹莹 邢辉 何翔关键词:基因亚型 宿主HLA限制性的CTL选择压力对于HIV进化的影响 2009年 在宿主免疫选择压力的作用下,病毒为了生存改变自身的结构而不断进化。人白细胞抗原(HLA)限制的细胞毒性T细胞(CTL)反应,在控制人类免疫缺陷病毒(HIV)感染过程中发挥重要作用,是宿主体内驱动HIV进化的一种主要选择压力。该文简要综述了HLA限制性的CTL反应对病毒的控制作用,及目前在人群水平上HLA限制性的CTL反应,对HIV进化影响的研究进展。 周晓兰 洪坤学 何翔 邵一鸣关键词:人类免疫缺陷病毒 人白细胞抗原 陕西省MSM人群中HIV-1分子流行病学研究 被引量:3 2012年 目的了解陕西省近年来发现的男男性行为人群(Men who have sex with men,MSM)中,艾滋病病毒(Human immunodeficiency virus,HIV)流行株的基因序列特征、亚型、流行现状和趋势,为艾滋病防治工作提供科学依据。方法对HIV感染者进行流行病学相关因素调查,无菌采集全血,分离血浆提取病毒核酸,应用套式反转录聚合酶链式反应(Nested reverse transcription-polymerase chain reaction,Nested RT-PCR)扩增gag、env和pol基因的部分片段,并对扩增产物进行测序,用Mega 5.0软件将测序结果与各亚型国际参考株比对,根据基因离散率和系统进化树分析确定基因型及其特征。结果 71份样本中成功获得51份PCR扩增阳性产物并得到相应序列。综合gag、env和pol基因离散程度和系统进化树分析发现,陕西省MSM人群中至少存在3种HIV-1基因亚型和重组毒株(即B亚型、CRF01_AE和CRF07_BC重组型)。其中CRF01_AE为主要流行株,共28例(54.9%),其次是CRF07_BC重组型20例(39.2%)和B亚型3例(5.9%),重组型占到了94.1%(48/51)。根据基因离散率,在三种不同基因片段中,以env基因变异程度最大,HIV-1B亚型、CRF07_BC和CRF01_AE重组型的组内离散率分别为(12.8%±1.2%)、(6.6%±0.6%)和(8.4%±0.7%)。结论首次在陕西省MSM人群HIV感染者中,发现至少存在HIV-1B亚型和CRF01_AE、CRF07_BC重组型,以CRF01_AE重组型为主。该人群显示多亚型且近期呈高度流行的趋势。加强对MSM人群的行为干预,控制HIV在MSM人群中的传播,将是今后陕西省艾滋病防治工作的重点之一。 邢爱华 李翔 张梦妍 何翔 任强 常文辉 付钰淋 董丽芳 贾华 邢辉 王敬军关键词:男男性行为人群 基因测序 系统进化树 HIV/AIDS患者肺脏移植进展 2022年 HIV/AIDS患者的实体器官移植在国外已快速发展,但我国实施器官移植手术较少。本文通过回顾当前HIV/AIDS患者的肺移植开展情况,从抗排斥反应、高效抗反转录病毒治疗、术后并发症及生存状况等多个角度讨论我国开展HIV/AIDS患者肺移植手术的可行性。 李小杉 高蓉 钟平 何翔 胡春晓 陈静瑜关键词:艾滋病病毒 艾滋病 肺移植 器官移植 适用于中国HIV-1分型的gag基因引物及其应用 被引量:18 2009年 目的对中国流行的主要HIV-1毒株进行遗传特征分析,确定适用于中国HIV分子流行病学调查的gag基因扩增引物。方法从HIV序列数据库下载CRF07_BC、CRF08_BC、C亚型及M组参考毒株的gag全长序列,经序列比对后设计gag基因扩增引物;获得的基因片段采用邻接法构建系统进化树,评价不同片段用于分析和确定HIV-1亚型的可靠性,并检测部分样本以评定效果。结果目前我国常用的gag基因306/c-gag引物扩增片段(HXB2836~1507)构建的系统进化树中,CRF07_BC、C亚型进化簇的Bootstrap值分别为70%和59%,其可靠性较低,难以形成较为稳定的进化簇用于病毒亚型判断。而利用设计的gag基因GUX/GDX引物扩增片段(HXB2781~1861)构建的系统进化树中,CRF07_BC、CRF08_BC和C亚型序列能够独立成簇,其Bootstrap值分别为99%、99%和77%,具有较高的可靠性。在实际应用中,新设计的引物具有较高的扩增阳性率和测序成功率,获得序列形成B、C亚型和CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC等5个大的进化簇,其Bootstrap值均超过80%。即使仅用下游引物GDX测序获得的较短片段亦能获得较为可靠的系统进化树。结论GUX/GDX引物扩增获得的gag基因片段可以构建较为可靠的系统进化树,用于区分和判断我国流行的主要HIV-1毒株亚型,尤其是BC重组毒株和C亚型毒株。该方法在我国HIV分子流行病学调查和研究中有广泛的应用价值。 辛若雷 冯毅 程春林 胡园园 孟哲峰 邢辉 邵一鸣 何翔关键词:HIV-1 流行病学 分子 基因 GAG 全国主要HIV毒株的基因变异和流行特征研究及数据库建立 邵一鸣 邢辉 洪坤学 冯毅 陈健平 尚红 钟平 张伟 王哲 秦光明 万卓越 羊海涛 赵全壁 袁霖 何翔 2001年1月~2005年12月,在科技部基础性研究课题、国家973课题、卫生部艾滋病应用性研究课题资助下,进行了研究。一、方法:应用流行病学调查、基因和遗传分析、生物学和免疫学等技术,对全国31个省(市、自治区)随机抽...关键词:关键词:艾滋病 HIV毒株 基因变异 数据库 209例HIV-1阳性静脉吸毒者中HCV基因型研究 被引量:4 2015年 目的了解2007—2012年广东省内HIV-1感染的静脉吸毒者(IDUs)中HCV基因型的种类和亚型分布情况。方法对2007—2012年HIV-1抗体阳性IDUs样本进行HCV抗体检测,对HCV抗体阳性样本提取RNA,用反转录巢式聚合酶链反应方法扩增HCV核心基因Core片段和非结构基因NS5B片段,目的片段测序后通过分子系统发育树进行基因型分析。结果 209份样本分别来自惠州、东莞、阳江、云浮、清远、佛山、中山和江门,以阳江和东莞为主,占36.84%(77/209),以男性为主,占93.78%(196/209),年龄在18-49岁之间。HCV抗体阳性166份,阳性率为79.4%。进化树显示样本序列分别与标准株1a、1b、2a、3a、3b和6a等6种亚型聚集在一起,la、lb、2a、3a、3b、6a基因亚型构成比分别为10.6%、9.9%、1.4%、22.7%、11.3%、44.0%。结论 6a是广东省内被检测HIV-1感染IDUs中HCV主要流行亚型,其次为3a亚型。 况轶群 黄旭和 颜瑾 周平平 于国龙 鄢心革 刁丽梅 何翔关键词:HIV感染 基因型 中国南方四省区流行的HIV-1 CRF01_AE病毒株基因特征研究 被引量:18 2009年 目的分析中国南方四省区HIV-1感染者中流行CRF01_AE病毒株的遗传特征。方法从广东、广西、江西和湖南省(自治区)2006年新报告HIV-1感染者的血浆样本中提取病毒RNA,用反转录/巢式PCR方法扩增gag和env基因片段,对获得的CRF01_AE病毒株核酸序列进行系统进化分析,并通过计算基因距离和Entropy核苷酸多态性差异方法分析毒株的遗传特征。结果从210例CRF01_AE病毒株感染者中,发现四省区流行的CRF01_AE病毒株存在2个主要的流行簇。流行簇Ⅰ共有123例样本,未发现与之直接相关的国际参考毒株。流行簇Ⅱ共有57例样本,与越南CRF01AE病毒株关系密切,且存在不同时间样本的混杂。gag和env基因遗传距离分析结果表明,流行簇Ⅰ内基因遗传多样性均明显小于流行簇Ⅱ;核苷酸多态性分析结果显示,在gag基因片段42个位点核苷酸组成具有显著差异,env基因片段40个位点核苷酸组成存在显著差异;流行簇Ⅰ相对于流行簇Ⅱ多态性减少的位点上有61个,多态性增加的位点有21个。结论在中国南方四省区流行的CRF01_AE病毒株中首次观察到2个独立的流行簇。流行簇I病毒株为该地区最主要的CRF01_AE病毒株,其流行时间相对较短,在人群中所占比例较多,可能是病毒在流行过程中形成的具有传播优势的病毒株。流行簇Ⅱ病毒与来自于越南的CRF01_AE病毒株有较高同源性,且存在与越南病毒株问的多次传播。 程春林 冯毅 何翔 林鹏 梁淑家 易志强 贺健梅 胡园园 邢辉 范雁 吴士良 邵一鸣关键词:病毒株 HIV-1 进化分析