陈润生 作品数:129 被引量:642 H指数:12 供职机构: 中国科学院生物物理研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 中国科学院知识创新工程 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 自动化与计算机技术 农业科学 更多>>
基于高通量测序的全基因组关联研究策略 被引量:12 2014年 全基因组关联研究(Genome-wide association study,GWAS)是人类复杂疾病研究的重要组成部分之一,在群体水平检测全基因组范围的遗传变异与可观测性状间的遗传关联。传统的GWAS是以芯片(Array)技术获得高密度的遗传变异,尽管硕果累累,但也存在不少问题。如:所谓的"缺失的遗传力",即利用关联分析检测达到全基因组水平显著的遗传变异位点只能解释小部分遗传力;在某些性状上不同研究的结果一致性较弱;显著关联的遗传变异位点的功能较难解释等。高通量测序技术,也称第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)技术,可以快速、准确地产出高通量的变异位点数据,为解决以上问题提供了可行的方案。基于NGS技术的GWAS方法(NGS-GWAS)可在一定程度上弥补传统GWAS的不足。文章对NGS-GWAS策略和方法进行了系统性调研,提出了目前较为可行的NGS-GWAS的实施策略和方法,并对NGS-GWAS如何应用于个体化医疗(Personalized medicine,PM)进行了展望。 周家蓬 裴智勇 陈禹保 陈润生关键词:全基因组关联研究 个体化医疗 高级脑活动的功能性核磁共振成像 被引量:5 1996年 功能性核磁共振成像(fMRI)技术可以显示大脑各个区域内静脉毛细血管中血液氧合状态所起的磁共振信号的微小变化.使用fMRI的方法,可以在正常的活体上无损伤地实现大脑活动的功能定位,时空分辨率可分别达到秒和毫米数量级,尽管目前还面临一系列技术上的困难,fMRI已经日益成为观察大脑活动,研究人脑的拓扑结构。 汪云九 陈润生 唐孝威关键词:核磁共振成像 大脑 非编码RNA研究的源起及对未来发展的一些思考 近年来大量的新的转录组实验结果表明基因组中的非编码序列绝大部分是可以表达的,同时越来越多的事实证明转录出来的非编码RNA,从长度为21-24个碱基的microRNA到长度为kb数量级的Xist,都具有重要的生物学功能。本... 陈润生文献传递 用比较聚类法寻找转录因子的结合位点 被引量:4 1996年 将动态序列比较和自动聚类算法相结合,对92个mRNA的转录调控区域的所有8元碱基片段进行了分析,得到了52个聚类中心,并与已知的转录因子结合位点相比较,结果表明,用本方法寻找蛋白质基因调控区的转录因子结合位点是简单可行的。 刘军 孙健 凌伦奖 陈润生关键词:转录因子 结合位点 聚类分析 生物物理学的几个热点领域 被引量:6 2002年 物理学与生物科学的交叉由来已久 ,这不仅解决了自然界许多重大的理论问题 ,并且在高层次上开辟了新的技术领域 ,如生物信息学、纳米生物学和脑与认知科学等 . 黄耀江 陈润生关键词:生物物理学 生物信息学 纳米生物学 脑科学 长非编码RNA研究进展 长非编码RNA是指一类长度大于200个核苷酸、不编码蛋白质的非编码RNA.越来越多的研究表明,人类基因组中高达80%的非编码蛋白质的区段同样具有重要作用,而不是所谓的"转录噪声".针对长非编码RNA的功能研究表明其在转录... 陈润生紫茉莉抗病毒蛋白(Mirabilis antiviral protein,MAP)的空间结构和与底物相互作用的模拟研究 被引量:10 1996年 首先应用同源构筑方法建立了低序列同源性的紫茉莉抗病毒蛋白(MirabilisantiviralProtein,MAP)的空间结构,然后对此粗结构进行了分子动力学优化。最后通过对MAP,TCS与其底物类似物的相互作用,了解RIP特异糖苷酶活性的机制。结果表明模拟结构是合理的。RIP特异糖苷酶活性主要是由于酶的活性口袋与底物的特殊构象相互匹配。 陈润生 董贻诚 梁曦云 黄岳顺关键词:紫茉莉 抗病毒蛋白 空间结构 一种预测影响长非编码RNA生物学功能的SNP位点的方法 本发明公开了一种预测影响长非编码RNA生物学功能的SNP位点的方法。本发明首先建立了长非编码RNA所包含的RNA结合蛋白能够识别的特异的motif序列的识别及显著性评价方法,然后基于此方法对位于这些特定序列中的SNP位点... 陈小伟 范珍 陈润生文献传递 一种用于肝癌与肝癌微环境相互作用的新的长链非编码RNA检测及其应用 本发明提出了核酸在制备药物中的用途,所述药物用于预防或治疗肝癌,所述核酸用于沉默lncRNA‑MUF。利用用于沉默lncRNA‑MUF的核酸所制备的药物,可有效用于预防或治疗肝癌。 阎新龙 张栋栋 范祖森 陈润生 杜颖文献传递 细菌视紫红质的构象模拟和视黄醛的顺反异构模型 被引量:3 1989年 本文在细菌视紫红质构象模拟的基础上提出了一个视黄醛顺反异构模型.该模型中视黄醛的C_(13)—C_(14)与Lys—216的C~δ—C^e处于一直线上,这样,顺反异构只涉及视黄醛C_(15)和Lys—216的N~ζ绕此直线为抽的旋转.理论计算表明,这是一种空间障碍最小的模型,并能通过Asp—96和Asp—212传递质子. 凌伦奖 倪向善 陈润生 石秀凡关键词:视紫红质 构象