陈国强
- 作品数:13 被引量:42H指数:5
- 供职机构:淮海工学院海洋学院更多>>
- 发文基金:江苏省“青蓝工程”基金江苏省自然科学基金中央财政支持地方高校发展专项资金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学文化科学更多>>
- 海洋稀有放线菌Salinispora arenicola CNP193基因组新颖NRPS基因簇的异源表达初步研究
- 利用基因组发掘技术,从海洋稀有放线菌S.arenicola CNP193基因组序列中发掘新颖NRPS基因簇,并将基因簇在放线菌中异源表达,为新颖非核糖体多肽的发现和利用组合生物合成技术对化合物结构进行改造奠定基础。在利用...
- 房耀维王淑军刘姝吕明生焦豫良陈国强潘建梅
- 文献传递
- 植物铜锌超氧化物歧化酶的分子进化分析
- 从 NCBI、Expasy、Swiss-Prot 等主要数据库下载植物 Cu/ZnSOD 的成熟氨基酸序列, 包括单子叶植物9种、双子叶植物37种、裸子植物1种、苔藓植物2种、绿藻植物1种,共 50个物种的56个氨基酸序...
- 陈国强吴文建孟鹏王萍
- 关键词:超氧化物歧化酶分子进化进化树
- 文献传递
- 高粱抗坏血酸过氧化物酶基因的电子克隆及序列分析被引量:12
- 2011年
- 利用高粱EST数据库及电子克隆等技术克隆了高粱APX基因,其开放阅读框大小为753bp,编码250个氨基酸残基,推导的蛋白质分子量为27.1kDa,等电点约为5.135。它与C4植物玉米的胞质APX(ACG41151)在进化上的距离最短,亲缘关系最近。高粱APX无信号肽,是亲水性蛋白,推测它定位于细胞质中。第33-44氨基酸片段为其过氧化物酶活性区域,第155-165氨基酸片段则是其与亚铁血红素配基结合的区域。预测的二级结构及三级结构都表明高粱APX含有较多的不规则卷曲和α螺旋,三级结构上呈椭球体。
- 陈国强孟鹏刘李黎陈刚王萍
- 关键词:高粱电子克隆
- 向日葵抗坏血酸过氧化物酶的电子克隆和生物信息学分析被引量:2
- 2012年
- 利用电子克隆技术得到长753 bp的向日葵抗坏血酸过氧化物酶(HaAPX)cDNA。通过生物信息学分析发现,HaAPX在核酸水平和蛋白质水平上都与常见物种的APX非常相似,具有极其保守的酶活作用域Peroxidase-1(-divtlsggHtl-)和Peroxidase-2(-aplmlRlawHsa-),且配体结合位点和金属结合位点完全保守。HaAPX与甘薯(Ipomoea batatas)APX亲缘关系很近,其编码蛋白由250个氨基酸组成,分子量为2.7 ku,无信号肽和跨膜区,二级结构由37.6%α-螺旋、13.2%β-折叠、9.2%β-转角和40%无规则卷曲组成,三维构象与豌豆APX的非常相似。
- 孟鹏李根英陈国强王振东
- 关键词:向日葵抗坏血酸过氧化物酶电子克隆生物信息学
- NaCl胁迫对向日葵组培苗生长的影响
- <正>盐逆境是植物生长的主要限制因子之一。全世界盐渍土约10亿公顷,我国约有200多万公顷。随着我国人口的不断增加,土地盐碱化的日益严重,会导致我国相对的人均耕地面
- 王萍赵欢易乐飞陈国强周向红
- 文献传递
- 西沙群岛海域海洋放线菌的分离及其抗菌活性被引量:6
- 2014年
- 分离西沙群岛海域放线菌并研究其抗菌活性。采用干燥、辐射、冷冻及加热处理等11种样品预处理方式和10种培养基对海洋放线菌进行分离,对代表性菌株进行鉴定,并考察分离放线菌生长的海水依赖性。进一步以金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、啤酒酵母和扩展青霉为指示菌考察分离放线菌的抗菌活性。从西沙群岛海域样品中分离获得放线菌383株,其中专性海洋放线菌23株。选定93株代表菌株进行鉴定,93株菌隶属于9个科,11个属。不同培养基对分离放线菌菌株的数量及种类影响显著。6株放线菌对4种指示菌均有抑菌活性,其中4株为专性海洋放线菌,表明海洋环境具有丰富的放线菌资源,这些放线菌特别是专性海洋放线菌有望为新型抗菌物质的发现与开发提供菌种来源。
- 房耀维王淑军刘姝吕明生焦豫良陈国强潘建梅
- 关键词:海洋放线菌抗菌活性
- 盐地碱蓬耐盐相关基因克隆研究进展被引量:10
- 2008年
- 盐地碱蓬是一种生长于盐碱地和海滨沙滩的盐生植物,富含氨基酸、维生素、矿物质等,极具开发价值。由于其具有很强的耐盐性,人们日益重视其耐盐机理的研究。目前对其耐盐机理的研究已经进入到耐盐基因的克隆、结构分析、功能研究等方面。综述了近年来盐地碱蓬与耐盐相关的基因克隆、结构及功能分析等方面的研究进展。
- 陈国强王萍
- 关键词:盐地碱蓬盐胁迫基因克隆
- 海洋稀有放线菌Salinispora arenicola CNP193基因组新颖PKS和NRPS基因簇的发掘被引量:5
- 2014年
- 利用基因组发掘技术,从海洋稀有放线菌Salinispora arenicola CNP193基因组序列中发掘新颖PKS和NRPS基因簇,并初步预测基因簇对应产物,为新颖聚酮化合物的发现,基因簇的异源表达和利用组合生物合成技术对化合物结构进行改造提供信息。在利用anti SMASH对S.arenicola CNS 205和S.arenicola CNP193次级代谢产物基因簇进行预测,并经过NRPS-PKS knowledgebase验证的基础上,以S.arenicola CNS 205基因簇为对照,初步选择新颖基因簇;进一步用NCBI Blast和Nap Dos分析判断基因簇的新颖性后获得3个新颖基因簇:基因簇7,基因簇10和基因簇20。结合anti SMASH对基因簇核心结构的预测和与已知功能同源性基因簇,NCBI Blast比对的同源序列,以及Nap Dos对个基因簇中KS domain和C domain的进化分析等信息,初步表明基因簇7和基因簇20的对应产物分别为烯二炔类和有半胱氨酸及其他氨基酸参与合成的肽类化合物。由于基因簇10得到的信息较少,不能预测其代谢产物。
- 房耀维刘姝王淑军吕明生焦豫良陈国强潘建梅牛军
- 一株海洋专性放线菌的分类鉴定及其抑菌活性被引量:7
- 2014年
- [目的]对一株海洋专性放线菌进行菌种鉴定,并考察其抑菌物质的性质。[方法]通过形态特征、生理生化特性以及16S rRNA基因序列分析,对专性海洋放线菌CMZ023进行鉴定;采用管碟法测定抑菌谱;测定菌株CMZ023抑菌物质的性质。[结果]鉴定菌株CMZ023为Salinispora arenicola,该菌对革兰氏阴性细菌、革兰氏阳性细菌、啤酒酵母以及多种植物病原真菌均有拮抗作用。其抑菌物质粗提液耐酸碱、耐高温,紫外照射不影响抑菌活性。[结论]该菌株具有开发成新型广谱生物农药的潜力。
- 房耀维王淑军刘姝吕明生焦豫良陈国强潘建梅
- 关键词:抑菌物质
- 1种基于平板共培养筛选抗菌海洋放线菌的方法
- 2017年
- 为开发1种基于共培养的抗菌性海洋放线菌平板高效筛选方法,并对菌株提高放线菌产抗菌物质能力的机制进行探索,以单独培养的海葵共附生放线菌为对照,研究与菌株共培养对海葵共附生海洋放线菌抗菌性菌株筛选效率的影响,以及不同生长期蜡样芽孢杆菌菌株Bacillus cereus AS1.1846的发酵液、发酵液添加量和添加时间对放线菌菌株AAA015抗菌活性的影响,初步探索提高放线菌抗菌活性的机制。结果表明,通过平板共培养可以显著提高抗菌性海洋放线菌筛选效率。B.cereus AS1.1846从稳定期开始分泌到胞外提高放线菌抗菌活性、对热稳定的次生代谢产物,少量的该物质即可显著提高菌株AAA015的抗菌活性。获得了1种基于共培养的高效抗菌活性海洋放线菌平板筛选方法。
- 刘姝房耀维王淑军焦豫良陈国强潘建梅金志勇
- 关键词:平板共培养海洋放线菌抗菌活性