董迎辉
- 作品数:134 被引量:419H指数:13
- 供职机构:浙江万里学院更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金浙江省自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学天文地球经济管理更多>>
- 泥蚶(Tegillarca granosa)基因组SSR和EST-SSR的开发及比较研究被引量:11
- 2013年
- 采用SSPHunter软件在泥蚶(Tegillarca granosa)磁珠富集文库和454转录组文库中搜索核心序列长度12bp以上的2—6核苷酸重复序列,根据富集文库所得基因组SSR侧翼序列设计47对引物,可成功扩增17对且均为多态性引物,多态率100%,平均等位基因数(Na)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态性信息含量(PIC)分别为6.8、0.468、0.785、0.733。11344条EST序列中得到1683个SSR位点,检出率14.83%,平均每3.85kb出现1个位点。根据部分EST序列设计120对引物,62对可扩增出目的片段,其中29个位点具有多态性,多态率为46.77%,平均Na、Ho、He、PIC分别为4.2、0.372、0.554、0.500,均低于基因组SSR。双变量相关性分析的结果表明,46个多态性SSR位点的核心序列长度与其Na、Ho、He、PIC极显著正相关,Spearman相关系数分别为0.632、0.387、0.657、0.
- 周小龙朱靖华董迎辉林志华富凯立姚韩韩齐晓艳
- 关键词:泥蚶基因组SSREST-SSR
- 泥蚶生长性状相关AFLP分子标记的筛选
- 以浙江乐清泥蚶养殖群体为育种基础群,经过2代连续选育获得了泥蚶快速生长品系,生长对比试验发现其在壳长、壳高、壳宽、总重等性状上都表现出了显著的生长优势。为了研究快速生长品系的遗传结构并筛查生长性状相关的分子标记,利用AF...
- 董迎辉姚韩韩林志华肖国强柴雪良
- 关键词:泥蚶生长性状AFLP
- 文献传递
- 一种利用红外心跳测评缢蛏氨氮耐受性的方法
- 本发明提供了一种利用红外心跳测评缢蛏氨氮耐受性的方法,包括以下步骤:S1:将待检测的缢蛏在设置驯化条件后进行养殖和驯化,使其适应实验环境;S2:测评前准备好心跳检测装置的连接;S3:取所述步骤S1驯化后的缢蛏用于心率测评...
- 董迎辉孙改改郦琪钧姚韩韩吕丽媛徐洪强
- 文蛤遗传标记研究进展被引量:4
- 2009年
- 朱东丽林志华董迎辉王昭萍
- 关键词:文蛤软体动物门双壳贝类双壳纲帘蛤科
- 文蛤30个微卫星标记的开发及在斧文蛤和帘文蛤中的通用性检测被引量:11
- 2013年
- 为开展文蛤多态性微卫星标记及其在斧文蛤和帘文蛤中的通用性研究,实验从磁珠富集法构建的基因组文库和EST文库中开发了30个文蛤多态性微卫星标记,包括8个G-SSR和22个EST-SSR多态性位点。共获得140个等位基因,平均等位基因数为4.67;多态性信息含量、观测杂合度、期望杂合度分别为0.172~0.744、0.040~0.720、0.187~0.793;G-SSRs的平均等位基因数、平均多态性信息含量、平均观测杂合度和平均期望杂合度都较EST-SSRs高;Hardy-Weinberg平衡检测发现,24个位点偏离了平衡状态;利用BLASTx对含多态性SSR位点的EST进行功能注释,11个位点来自注释基因序列。将30对文蛤多态性SSR引物分别在斧文蛤和帘文蛤中进行了通用性检测,通用率分别为40%和30%。这些微卫星多态性位点的获得,为进一步开展文蛤遗传多样性分析、种质资源评价、分子标记辅助选育等奠定了基础,并且可用于文蛤、斧文蛤和帘文蛤的比较作图、基因发掘和QTL定位等研究。
- 齐晓艳董迎辉姚韩韩周小龙林志华
- 关键词:文蛤EST-SSRS多态性
- 一种浮筏式贝类苗种养殖装置与方法
- 本发明涉及贝类养殖领域,尤其涉及一种浮筏式贝类苗种养殖装置与方法。本发明技术问题是提供一种便于贝类苗种摄食池塘中更多的藻类的浮筏式贝类苗种养殖装置与方法,包括有浮筏框架、过滤网一、过滤网二、塑料浮筒等;浮筏框架其中两侧均...
- 何琳何京董迎辉林志华
- 泥蚶Smad1/5基因cDNA全长克隆及时空表达特征分析被引量:6
- 2015年
- 为了研究Smad1/5基因在泥蚶生长、发育过程中的调控作用,本研究利用SMART RACE方法克隆得到泥蚶Smad1/5基因(Tg-Smad1/5)的c DNA全长序列,该序列全长2 424bp,开放阅读框1 386 bp,编码462个氨基酸。Tg-Smad1/5蛋白与合浦珠母贝Smad5、太平洋牡蛎Smad5和大西洋舟螺Smad1的同源性分别达到了92.3%、91.2%和80.4%,与脊椎动物的同源性都在70%以上;该蛋白包含MH1和MH2区2个较为保守的结构域,此结构与高等动物Smad1和Smad5蛋白极为相似,表明该基因在物种进化过程中比较保守。利用qRTPCR技术,研究了Smad1/5基因在泥蚶6个组织和9个发育时期中的表达情况,结果显示,TgSmad1/5基因在泥蚶成贝6个组织中均有表达,在斧足中的表达量最高,极显著地高于其他组织;在各发育时期中,Tg-Smad1/5表达量随发育进程呈逐渐升高的趋势,在眼点幼虫期达到最高,极显著高于其他时期,而在变态至稚贝时,表达量又极显著地下降。研究结果表明,TgSmad1/5具有类似于高等动物的分子结构,并在泥蚶不同组织、不同发育时期表达有所差异,这为进一步研究该基因在贝类中的功能和作用机制奠定了重要基础。
- 钱雪骏董迎辉姚韩韩林志华
- 关键词:泥蚶基因克隆
- 文蛤生长因子受体结合蛋白2(GRB2)基因克隆、时空表达及SNP位点筛查被引量:5
- 2015年
- 为探索贝类GRB2基因的结构、功能特征,以及在贝类生长发育过程中的作用,实验通过已构建的文蛤转录组文库,利用SMART RACE技术扩增得到了文蛤GRB2基因的c DNA全长序列,对其生物信息学、组织及发育阶段表达特征进行了分析,并利用直接测序方法在外显子中筛选SNP位点。结果显示,GRB2基因c DNA全长1 791 bp,开放阅读框669 bp,编码223个氨基酸,蛋白由SH-SH2-SH3 3个结构域组成;氨基酸序列比对发现,文蛤G RB2与泥蚶的同源性最高,达到65.6%,与脊椎动物的同源性都在60%以上,说明GRB2基因在进化过程中比较保守。荧光实时定量PCR(qRT-PCR)结果表明,GRB2在文蛤6个组织和10个发育时期中均有表达,但不同组织间的表达量并没有显著差异;发育时期中的表达量呈现逐渐升高的趋势,在壳顶幼虫时期达到最高,之后表达量又有所降低。SNP位点的筛选结果表明,在G RB2基因的外显子区域共发现16个SNP位点。
- 高晓艳董迎辉施沈佳姚韩韩阮文斌赵家熙林志华
- 关键词:文蛤克隆SNP
- 一种耐氨氮、高产缢蛏新品种的制种方法
- 本发明提供了一种耐氨氮、高产缢蛏新品种的制种方法,包括S1:初次筛选、S2:二次优选、S3:同代多点遗传力评估、S4:品系纯化的步骤,经过连续4代的耐氨氮和生长性状综合选育,本发明获得了适用于池塘混合养殖模式的耐氨氮能力...
- 徐洪强董迎辉林志华何琳何京孙长森吕丽媛
- 文蛤“万里红”和“万里2号”稚贝池塘养殖生长性能比较研究被引量:2
- 2018年
- 为筛选适宜在连云港推广的文蛤(Meretrix meretrix Linnaeus)新品种,课题组引进了文蛤"万里红"系列新品种(系)。通过前期的成贝试养殖,预选出"万里红"与"万里2号"的池塘养殖性能更优,但稚贝到幼贝阶段生长尚不清楚。进一步比较研究了这两种文蛤稚贝在池塘中生长性能以及季节性差异。经过1年的生长比较(2016年12月10日-2017年12月10日),结果表明,稚贝在160~220 d养殖期间,"万里2号"的壳长、壳高、壳宽和体质量都显著大于"万里红"(P<0.05);在220~280 d养殖期间,"万里红"生长性能指标又显著大于"万里2号"(P<0.05);280 d后,"万里红"各项生长性能逐渐与"万里2号"缩小差距直至趋于一致。该品种(系)受季节影响大,在连云港沿海养殖具有春冬季(11-5月)迟缓、夏秋季(5-11月)生长迅速的规律,8月份为生长顶峰期,"万里红"日均增重为"万里2号"的1.2倍。
- 张冬冬徐官根李晓英董志国董志国董迎辉董迎辉林志华
- 关键词:文蛤稚贝