徐璐
- 作品数：26 被引量：30H指数：3
- 供职机构：扬州大学动物科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技支撑计划江苏省“六大人才高峰”高层次人才项目更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 鸡NLRC5启动子区转录调控序列的初步研究
- 2017年
- 为了探讨NLRC5启动子的潜在调控机制,将NLRC5基因启动子系列缺失片段插入到pGL3-basic载体,构建重组质粒,并转染DF1细胞系。通过双荧光素酶实验寻找核心调控区,然后用目标捕获测序检测27个鸡品种的NLRC5核心启动子区的SNPs,并利用TRANSFAC,JASPAR和Meth Primer预测该区域的转录因子结合位点和CpG岛。结果显示,NLRC5启动子有2个核心区域,分别是1—617和1448—2108。第一个核心区域内存在3个SNPs,其中SNP1影响转录因子Hic1的结合序列,但SNPs对CpG岛不产生影响,表明NLRC5基因的启动子区的调控可能受不同因素的影响,但SNPs并不在甲基化的水平上影响启动子的活性。
- 张莘郭晓敏常国斌朱鹏飞徐璐仇玲玲张扬徐琪陈国宏
- 关键词：SNPS转录因子结合位点CPG岛
- 鸡不同生精细胞中Piwil1基因启动子区DNA甲基化差异研究被引量：3
- 2014年
- 旨在通过检测不同类型生精细胞中Piwil1基因的转录水平和启动子区甲基化状态,为深入探讨该基因在鸡精子发生过程中的转录调控机制奠定基础。通过荧光定量PCR技术检测Piwil1基因在不同生精细胞的mRNA表达水平,同时采用Bisulfite sequencing PCR法对启动子区进行甲基化修饰、转化和克隆测序,分析甲基化状态。结果发现,鸡Piwil1基因在精子中几乎不表达,在精原细胞的表达量显著高于PGCs、SSCs和四倍体(P<0.01)。鸡Piwil1基因启动子区-233^+298bp存在1个CpG岛,该岛有56个CpG位点。第1~10个CpG位点(-233^-129bp区域),精子细胞、四倍体细胞、PGCs、SSCs中处于未甲基化状态,而精原细胞中甲基化比例高达0.600;第39~55个CpG位点(+105^+252bp区域),不同细胞中的甲基化水平差异显著,精原细胞中仅为0.212。PGCs、SSCs中DNA高甲基化在一定程度上抑制了Piwil1基因的表达。研究表明:在+105^+252bp非编码区域甲基化可能对Piwil1基因转录调控有一定影响,但还存在其他转录调控机制。
- 陈静翟飞夏明秀陈蓉徐琪常国斌李建超马腾王洪志徐璐刘璐陈国宏
- 关键词：甲基化精子发生
- 鸡TGF-β2基因启动子区多态性分析被引量：1
- 2016年
- 为了研究鸡TGF-β2基因启动子区的SNP及其对启动子功能元件的影响,采用PCR-SSCP方法对16个鸡种的TGF-β2启动子区的554~824 bp（即3号染色体的19 433 476~19 433 746 bp）进行基因分型,经测序,共检测到3个有效的SNPs位点,分别是679位点的C/G,699位点的G/A,774位点的T/C。其中大骨鸡和太湖鸡在3个位点均检测到SNP存在,AA鸡在3个位点都没有发现SNPs。分别利用生物信息学软件JASPAR和Meth Primer预测TGF-β2基因启动子区转录因子结合位点和Cp G岛,发现SNP位点可改变转录因子结合位点且位于Cp G岛上,表明TGF-β2启动子区SNPs可能通过不同方式影响基因表达调控。
- 鲁伟吴允徐璐徐琪常国斌陈国宏
- 关键词：TGF-Β2启动子SNP
- 鸡Piwill基因启动子区转录调控元件的初步分析
- 1引言Argounaute蛋白是一类高度保守的蛋白家族,含有保守的结构域PIWI和PAZ。根据氨基酸序列的不同,可以分为两个不同的亚家族:Ago和Piwi亚家族。前者与siRNAs和miRNAs相结合,在基因调控中起着重...
- 夏明秀常国斌陈蓉翟飞戴爱琴马腾王洪志徐璐陈静刘璐陈国宏
- 关键词：转录调控
- 文献传递
- 鸡NLRC5基因启动子多态性分析被引量：2
- 2015年
- 为了研究NLRC5基因启动子区的SNP及其对启动子功能元件的影响,采用目标捕获测序和PCR产物直接测序的方法对27个鸡品种和2种细胞的NLRC5基因启动子区进行SNP检测,总共检测到37个SNP位点,其中斗鸡未发现SNP存在,SNP9存在于除斗鸡以外的其他鸡种和细胞。生物信息学软件预测得到NLRC5基因启动子区转录因子结合位点和CpG岛,SNP位点对转录因子结合位点和CpG岛大小均有影响,表明NLRC5启动子区SNP可能通过不同方式影响基因表达调控。
- 郭晓敏刘向萍常国斌徐璐马腾王洪志李志腾陈静万方徐琪陈国宏
- 关键词：启动子SNP
- 基于时序表达谱芯片挖掘鸡脂肪酸代谢关键调控基因被引量：1
- 2013年
- 不同脂肪酸的代谢产物决定了鸡肉风味的差异,找出影响鸡肌肉组织中脂肪酸代谢的关键调控基因对提高肉品质以及对优质肉鸡新品系选育具有重要意义。本研究对KEGG和Wikipathway数据库中脂肪酸代谢网络进行整合分析,挖掘鸡脂肪酸代谢的关键基因,通过Gene Spring筛选出不同周龄的肌肉组织中表达谱芯片与关键基因共表达的差异基因(Pearson相关系数≥0.9),然后导入Cytoscape进行共表达网络分析,最后进行跨物种检索关键调控基因功能,得到鸡肌肉组织中脂肪酸代谢的节点基因和相关通路。结果表明,Ep300、Traf2和Pak1等基因是影响鸡肌肉中脂肪酸代谢的节点基因,MAPK通路、ErbB通路和Herpes simplex infection通路可能是肌肉中脂肪酸代谢调控的关键通路,该结果为研究家禽肌肉中脂肪酸代谢的分子机制和进一步筛选优质肉质基因提供了基础资料。
- 王洪志常国斌马腾翟飞夏明秀刘璐陈静徐璐陈国宏
- 关键词：脂肪酸表达谱芯片调控通路
- 鸡Piwil1基因启动子区转录调控元件的初步分析
- 夏明秀刘璐陈国宏常国斌陈蓉翟飞戴爱琴马腾王洪志徐璐陈静
- 关键词：核心启动子定点突变NF-Y
- 鸡生殖干细胞中Piwi基因的干涉效率
- 2016年
- 【目的】针对禽类干细胞研究中,存在转染效率与干涉效率低下的问题,通过比较不同干涉方式对鸡原始生殖细胞(primordial germ cells,PGCs)中Piwi基因的干涉效果,探讨提高禽类生殖干细胞干涉效率的有效方法。为进一步研究Piwi基因参与干细胞自我更新、RNA沉默以及转录后调控过程等生物学功能研究奠定基础。【方法】根据已建立的原代细胞分离技术,分别从健康鸡群的10日龄和4日龄鸡胚中分离成纤维细胞(chicken embryo fibroblast,CEF)与生殖脊,其中CEF作为PGCs细胞的饲养层,生殖脊经Trypsin-EDTA室温下消化获得PGCs细胞,并通过形态学、化学方法(PAS糖原染色、AKP活性检测)和免疫学方法(TERT抗体、SSEA-1抗体)对其进行鉴定。根据Genbank公布的鸡Piwi基因的m RNA序列(NM_001098852),利用在线软件分别靶向不同位点设计合成得到3个小片段的stealth si RNAs,并将通用无义序列BLOCK-i T^(TM) Alexa Fluor®Red Fluorescent Oligo作为荧光素标记的阴性对照si RNA。同时,在线设计三条干扰序列和一条非特异性阴性对照序列,将其插入线性化空载体p RNA-U6.1,构建不同的sh RNA干涉载体。分别采用不同类型的转染试剂将构建好的si RNA和sh RNA转染PGCs细胞。首先利用通用无义si RNA以及仅带有GFP荧光标记基因的sh RNA载体作为阴性对照,检测si RNA和sh RNA转染效率,确定最佳转染条件。其次,将试验组si RNA和sh RNA在优化条件下转染PGCs细胞,分别收集转染了24、48、72和144 h这4个时间点的细胞,提取各个时间段的总RNA,采用实时荧光定量PCR技术检测Piwi基因m RNA表达水平,并用SPSS软件分析不同处理组的差异。【结果】在对原代分离的PGCs细胞进行了形态学、化学以及免疫学方法鉴定后,确认其所获得的细胞为PGCs细胞且状态良好。根据不同的转染试剂量与si RNA或sh RNA载体量的配比,得出si RNA转染最优条件为si RNA﹕Lipofectamine TM 2
- 李志腾常国斌徐璐马腾陈静陈蓉王洪志刘璐徐琪陈国宏
- 关键词：SHRNAPGCSRNAI
- 不同鸡种对白痢沙门菌的定植与免疫反应差异分析
- 本研究对狼山鸡和罗斯鸡肠道内的白痢沙门菌含量及相关免疫指标进行检测,探讨白痢沙门菌在鸡肠道内定植及其对鸡免疫性能的影响.选取狼山鸡、罗斯鸡各40只,分为攻毒组(30只),空白组(10只),攻毒组口服灌注0.5ml白痢沙门...
- 王洪志马腾徐璐陈静翟飞李志腾郭晓敏万方常国斌陈国宏
- 关键词：狼山鸡免疫性能
- 文献传递
- 基于时序表达谱芯片挖掘鸡脂肪酸代谢关键调控基因
- 王洪志徐璐陈国宏常国斌马腾翟飞王克华窦套存夏明秀刘璐陈静
- 关键词：脂肪酸表达谱芯片调控通路
