康宏
- 作品数:7 被引量:15H指数:2
- 供职机构:同济大学生命科学与技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
- 相关领域:医药卫生理学生物学化学工程更多>>
- 嘧啶衍生物对牛蒡子苷元片段修饰的研究
- 2012年
- 用一系列具有生物活性的嘧啶衍生物修饰牛蒡子苷元,旨在寻找增强牛蒡苷元子抗肿瘤活性的同时又能降低嘧啶抗肿瘤副作用的先导化合物.本研究通过把卤代后的嘧啶衍生物与牛蒡子苷元酚羟基相接,合成得到11个新的化合物,通过1H NMR与LC-MS表征确定其结构.最终,增加了牛蒡子苷元抗肿瘤化合物库中化合物的数量,为接下来的体外活性筛选做准备.
- 王欢欢吴平康宏许亮朱瑞新康廷国
- 关键词:牛蒡子苷元结构修饰嘧啶衍生物
- AT1受体的中药活性成分筛选模型及其作用机理研究
- 背景:心血管类疾病是中老年人的多发病,严重的危害人民身体健康。中医临床治疗此类疾病时多处以活血化瘀、益气扶正或平肝潜阳类药物,在临床中疗效显著。有资料进一步表明,AT1受体直接参与调节心脑血管生理变化,因此,本文从探寻治...
- 吴琼康宏王欢欢朱瑞新康廷国
- 关键词:AT1受体中药活性成分同源模建分子对接
- 文献传递
- AT_1受体的中药活性成分筛选模型及其作用机理研究被引量:10
- 2012年
- 传统中药对治疗心血管类疾病疗效显著,例如钩藤、黄芪、益母草等在临床应用广泛.现代药理研究表明钩藤碱可以降压;黄芪中毛蕊异黄酮能舒张血管平滑肌、保护心脑血管;益母草碱可扩张微血管,改善血液流变异常,但它们分子层面作用机制尚不明确.首先以牛视紫红质蛋白为模板,模建出心血管疾病主要靶点AT1受体的三维结构.然后将AT1受体拮抗剂和中药活性成分与受体模型结合的作用方式进行了对比研究,据此提出了中药活性成分治疗心血管疾病的作用机理,并建立了AT1受体的中药活性成分筛选模型.结果表明:黄芪毛蕊异黄酮等中药活性成分能与AT1受体活性口袋中的残基发生氢键作用,结合方式与AT1受体拮抗剂相似.每一种AT1受体拮抗剂均与His183,Lys199,His256,Gln257,Ser105,Ser109,Tyr113,Asn200中多个发生氢键作用;黄芪毛蕊异黄酮与Try113,Lys199,Gln257,Ser105发生氢键作用.本研究从分子层面上阐释了一些中药活性小分子的治病机理,为进一步挖掘中药资源,研究AT1受体相关的心脑血管类药物,合理设计和筛选AT1受体的拮抗剂提供重要依据.
- 吴琼康宏王欢欢高军朱瑞新康廷国
- 关键词:AT1受体中药活性成分同源模建分子对接分子机理
- 化合物结构特征与其基因表达信息的互补性研究被引量:2
- 2010年
- 化合物分子指纹在化合物相似性比较、生物芯片技术在分子标记识别中都有着重要的应用,因而受到广泛的重视.但是由于这两个研究对象依传统的观点,分属于化学信息学和生物信息学两个不同的研究领域,因此一直未能在同一研究对象中同时得到应用.近年来,小分子刺激的生物芯片数据的大量出现,使得联合化合物的结构特征及其基因表达谱信息共同的用于药物筛选成为可能.为此,根据本质和外延互补的哲学思想,提出了综合运用这两种数据来共同描述化合物的新方法.通过(1)只利用化合物分子指纹,(2)只利用化合物基因表达谱信息和(3)前面两种方法互补等三种方法在化合物相似性比较的研究中,发现本文提出的互补方法比前两种方法的查询结果更准确:(1)使结构和功能两方面均相似的化合物之间的相似性更高,(2)并且能有效使那些仅在某一方面表现非常特殊的化合物能够暴露出来,而得到有效地排除.本研究给化学信息者和生物信息者重新审视以往的数据,联合致力于药物的筛选提供了线索.化合物分子指纹(本质)和基因表达谱(外延)的互补原理则为药物的筛选提供更有效的依据,并最终加快药物的研发进程.
- 盛振康宏戴天力刘琦朱瑞新
- 关键词:分子指纹基因表达药物筛选
- HIV-1蛋白酶抑制剂靶点的广谱性研究
- HIV-1蛋白酶是治疗艾滋病的主要靶点之一,然而其非常高的突变率成为了治疗该疾病的一大瓶颈。找到一种能有效预测对突变病毒株具有抗病毒能力的药物的方法,对于艾滋病的临床治疗将有很大帮助。为此,我们引入能够同时对多个蛋白与多...
- 黄琦高军康宏刘琦曹志伟朱瑞新
- 关键词:艾滋病
- 基于配体、受体和复合物指纹的虚拟筛选方法比较被引量:3
- 2011年
- 近年来,作为基于配体和基于受体两种方法的补充,以复合物指纹为基础的药物筛选方法相关研究正受到广泛的重视.那么这种新兴的方法相对于传统方法在筛选结果准确率上是否具有优势?同时,由于复合物指纹可以通过复合物结构测定和将相应蛋白和配体进行分子对接两种方式获得,那么基于这两种方式获得的复合物指纹所得的筛选结果准确率是否有显著性差异呢?通过对一系列HIV-1蛋白酶复合物晶体结构同时进行基于配体的相似性搜索、分子对接传统的能量打分、基于复合物晶体结构的复合物指纹的相似性搜索和基于分子对接所得复合物结构的复合物指纹的相似性搜索的筛选比较,结果表明:(1)如果三种方法都是直接基于实验结构,那么复合物指纹和分子对接两种方法都因为是兼顾了受体和配体两个方面,准确率都要高于仅仅基于配体的方法;(2)实际运用中,通过实验测定所有复合物结构并不可行,因此需要进行分子对接才能大量的获得复合物结构并进一步生成相应的复合物指纹,令人兴奋的是,基于此种方式获得的复合物指纹与直接基于实验复合物结构获得的复合物指纹在筛选结果上并无显著性差异,从而可以作为实验复合物指纹筛选方法的有效补充.
- 黄琦康宏张端峰盛振刘琦朱瑞新曹志伟
- 关键词:药物筛选
- 一种新的化合物指纹及其在药物筛选中的应用
- 2011年
- 相似性搜索技术在大规模药物筛选中有着广泛的应用,而作为其构成要素之一的化合物描述符,则在相似性搜索中起着至关重要的作用.但是迄今为止,尚未发现一种描述符能够全面的描述化合物.近来,融合不同结构描述符用于相似性搜索的研究屡见报道,不过由于这些描述符都源自化合物的结构,融合以后不仅不能保证对化合物进行更全面的描述,还带来严重的冗余现象.为此,根据哲学中对于一个事物的描述需要同时从本质与外延两个方面同时进行这一基本原理,构建了一个全新的化合物活性描述符:基因功能模块指纹(GO指纹),综合运用结构指纹(本质)和GO指纹(外延)来描述化合物.与将化合物基因表达直接构建的活性指纹不同,GO指纹不仅(1)降低了芯片数据的维度,避免了其维度高、相关性强、噪声大的问题;同时(2)拉近了描述符和化合物活性之间的距离.通过将GO指纹和结构指纹融合后用于化合物相似性搜索,结果表明新的描述符(1)使得结构和功能都相似的化合物之间的相似性更高;(2)而使得仅在单方面相似性较高的化合物得到有效排除.本研究为进行快速、高效、大规模的药物筛选提供了新的思路,这势必将提高药物筛选的结果,进一步加快新药研发和旧药新用的进程.
- 盛振黄琦康宏刘琦曹志伟朱瑞新
- 关键词:药物筛选