北京药物化学研究所
- 作品数：205 被引量：510H指数：12
- 相关作者：丁晓琴丁俊杰陈常英陈乐贵李丽琴更多>>
- 相关机构：中国人民解放军防化指挥工程学院北京医科大学中国人民解放军总医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家科技重大专项“九五”国家科技攻关计划更多>>
- 相关领域：医药卫生理学生物学化学工程更多>>
- 传统中药槲寄生的化学与药理研究
- 目的:研究槲寄生Viscum coloratum(Komar．)Nakai的化学成分与药理作用。方法:利用多种色谱技术进行分离纯化,根据理化性质和波谱解析等进行结构鉴定;对槲寄生总提取物做小鼠体内抗 S180肿瘤活性研究...
- 徐建富杜秀宝范崇旭郑晓军杨廷松
- 文献传递
- 甲胺磷碱性水解机理与反应速率常数理论计算被引量：1
- 2013年
- 运用密度泛函(DFT)理论,研究了农药甲胺磷分子在碱性条件下,水解微观反应机理和速率常数。在B3LYP/6-31+G(d,p)水平上分别优化了水溶液相反应途径上各反应态的几何结构,溶剂化模型采用连续极化连续模型(CPCM)。并用频率分析方法和内禀反应坐标(IRC)计算,分别确认了过渡态的结构和反应途径。计算结果表明,反应决速步骤为第一步氢氧根离子进攻反应物,对3个不同离去基团(甲氧基TS2、甲硫基TS1和氨基TS5)活化自由能分别为15.64 kcal/mol、17.19 kcal/mol和25.80 kcal/mol。采用经Wigner校正的Eyring过渡态理论,计算了(100～1200)K温度范围内的各通道反应速率方程分别为,InK(C-O)=11.19524-2.37134×1000/T;Ink(C-S)=11.68184-3.28612×1000/T;Ink(C-N)=12.03234-7.73338×1000/T,3个方程的相关系数分别为R=-0.99809;-0.99891;-0.99981。计算结果显示甲胺磷在碱性条件下不稳定,能水解,并首先解离的是甲氧基和甲硫基,反应具有较大的自发反应趋势,氨基在碱性条件下不易离去。研究结果为解析有机磷杀虫剂在不同条件下的水解反应机制提供理论依据。
- 丁晓琴丁俊杰孙杨陈冀胜
- 关键词：甲胺磷速率常数
- 葡萄球菌肠毒素B亲和体的分子设计研究
- 亲和体是一种新型的蛋白质配体,可作为抗体的替代品,用于蛋白质识别、实验诊断、分子显像及靶向治疗等。本文采用分子模拟的方法,对应用噬菌体展示方法获得的9个亲和体和葡萄球菌肠毒素B（SEB）进行三维结构搭建和优化,应用蛋白-...
- 丁俊杰高川潘里王亮亮丁晓琴
- 关键词：分子对接分子设计
- 文献传递
- 二氢吡啶类化合物的三维定量构效关系被引量：7
- 2003年
- 通过分子力学和量子化学计算,得出两种二氢吡啶衍生物的低能构象,再应用比较分子力场分析方法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析方法(CoMSIA)分别对两种构象的43个二氢吡啶衍生物进行3D-QSAR研究.计算结果表明,用两种方法建立的两种构象的构效关系模型均有较好的预测能力.通过分析CoMFA和CoMSIA的系数等势图,直观地了解二氢吡啶衍生物的结构对生物活性的影响,为进一步设计高活性的二氢吡啶衍生物提供一定的理论依据.
- 丁俊杰丁晓琴赵立峰陈冀胜
- 关键词：三维定量构效关系钙离子通道心血管疾病
- 磷酸酯类胆碱酯酶不可逆抑制的反应性指数理论计算
- 丁晓琴李大禹丁俊杰裴承新陈冀胜
- 基于概念密度泛函理论磷酸酯类反应性物质毒性预测被引量：3
- 2018年
- 磷酸酯类反应性物质是乙酰胆碱酯酶不可逆抑制剂。本文应用概念密度泛函理论(CDFT),采用四组条件(B3LYP/6-311++G(2d,3p)/gas,B3LYP/6-311++G(2d,3p)/CPCM/water,MP2/6-311++G(2d,3p)/gas,MP2/6-311++G(2d,3p)/CPCM/water),对20多个磷酸酯反应性物质进行反应性描述指数计算,包括分子的化学势μ,绝对硬度η、亲电性指数ω、分子的前线轨道能量等分子整体描述参数,以及原子福井函数、自然键轨道(NBO)电荷、Wiberg键级、NBO键级等分子局域描述参数。通过对反应性描述指数以及定量构性关系(QSPR)方程预测结果的比较分析,得出结论:大多数化合物亲电进攻的反应中心发生在磷原子上;磷酸酯类化合物侧链乙胺基叔氮的质子化,将显著增强反应中心磷原子的亲电进攻能力;B3LYP/6-311++G(2d,3p)/gas为最合理的计算条件;应用反应性描述指数建立的QSPR模型明显优于常规的2D-QSPR模型,能够用于乙酰胆碱酯酶不可逆抑制剂的精确毒性预测。
- 丁晓琴丁俊杰李大禹潘里裴承新
- 关键词：定量构性关系
- 蛇磷脂酶A2抑制剂的研究概况
- 磷脂酶A2(PLA2)已经从哺乳动物组织和蛇毒液中分离和鉴定出,哺乳动物的PLA2有许多的生理学功能并且是无毒的,相反从蛇毒液中分离的PLA2是有毒的,并且通过膜受体介导许多药理学效应。蛇血清中的PLA2抑制剂(PLI)...
- 李艳军刘娟刘雁勇刘威董之海
- 关键词：磷脂酶抑制剂毒液
- 文献传递
- 蓖麻毒素与单链抗体分子识别理论研究
- 毒素的单链抗体免疫检测是一种高效且安全的检测方法。我们应用分子模拟技术，采用同源模建及分子动力学方法，构建并优化实验获得的新型蓖麻毒素单链抗体Scfv-16三维结构，结合Profile-3D和拉氏图方法，评价单链抗体三维...
- 丁俊杰高川丁晓琴李大禹潘里童朝阳
- 关键词：蓖麻毒素单链抗体分子识别分子模拟
- 一种槲寄生多肽的一级结构分析和抗肿瘤活性被引量：23
- 2004年
- 目的 研究槲寄生枝叶中肽类抗肿瘤活性成分并阐明其结构。方法 应用阳离子交换、凝胶过滤及高效液相等色谱方法进行分离纯化,基质辅助激光解吸飞行时间质谱用于测定质量数。采用Edman降解结合酶解法确定多肽的完整序列。对多肽用MTT法进行体外抗肿瘤活性评价。结果 从槲寄生中纯化出一种新的多肽,命名为槲寄生毒素B2(viscotoxin B2),其一级结构为KSCCKNTTGRNIYNTCRFAGGSRERCAKLSGCKIISASTCPSDYPK。Viscotoxin B2对体外培养的大鼠成骨样肉瘤细胞的IC50为1.6 mg·L～1。结论 Viscotoxin B2与白果槲寄生中的槲寄生毒素有很高的同源性,并具有较强的抗肿瘤活性。
- 孔景临杜秀宝范崇旭徐建富郑晓军
- 关键词：槲寄生抗肿瘤活性
- 有机化合物或药物热分解稳定性理论预测
- 有机化合物的热分解稳定性与化合物或药物的储存期密切相关,通常分子的稳定性由热分析方法(TG,DTG,TGA,DSC等)实验测定。由于计算机技术和理论有机化学的发展,越来越多的化学工作者,利用量子理论计算或理论与实验相结合...
- 丁晓琴丁俊杰李大禹孙杨陈冀胜
- 关键词：QSPR
