浙江大学农业与生物技术学院水稻生物学国家重点实验室
- 作品数：21 被引量：146H指数：5
- 相关作者：吕意琳岳晓凤王华李丹阳更多>>
- 相关机构：中国科学院微生物研究所安徽农业大学农学系河北农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金公益性行业(农业)科研专项国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学文化科学医药卫生更多>>
- 基于RNA-Seq的稻瘟病菌Δznf1突变体的表达谱分析被引量：2
- 2016年
- 【目的】稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)引起的水稻稻瘟病是威胁全球水稻生产的重要病害之一,而该菌附着胞介导的侵染又是病害循环的重要环节。在前期的研究中发现一个编码C_2H_2锌指结构的转录因子基因ZNF1,参与稻瘟病菌附着胞形成、穿透和致病过程,论文旨在从转录水平上了解受Znf1调控的基因及其调控机理,为深入研究稻瘟病菌致病分子机理提供基础数据。【方法】利用RNA-Seq技术对稻瘟病菌野生型菌株Guy11和突变体Δznf1的营养菌丝体进行表达谱测序,采用FPKM法计算基因表达量,以FDR≤0.001且log2 ratio(Δznf1/Guy11)≥1为筛选标准,获得Δznf1中差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs);通过与Gene Ontology(GO)数据库和KEGG Pathway数据库比对,获得差异基因可能的生物学功能和参与的分子调控途径。为了更详细地研究受Znf1调控的基因,在同样的条件下,利用RNA-Seq技术对稻瘟病菌丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)编码基因PMK1的缺失突变体进行表达谱分析,通过对Δznf1和Δpmk1中的差异表达基因进行比较,筛选受Znf1和Pmk1共同调控的基因,并与前人的研究数据比较,分析获得在稻瘟病菌附着胞发育阶段上调表达但在Δznf1和Δpmk1中同时下调表达的基因。【结果】与野生型Guy11相比,Δznf1中共有709个差异表达基因,其中上调表达的有299个,下调表达的有410个;GO功能富集分析显示差异表达基因归类到生物学过程、细胞组分和分子功能上的基因数目分别有118、299和308个;KEGG Pathway富集分析显示,这些差异表达基因主要参与代谢途径、次生代谢物质生物合成、甘油磷脂代谢等。一些已知的稻瘟病菌致病相关基因,如LPP3、HOX7、PBS2、MPG1等,在Δznf1中表达水平下调。与Δpmk1中差异表达基因比较发现,Δznf1中约56%的差异表达基因同时也受Pmk1调控。其中,编码isotrichodermin C-15羟化�
- 岳晓凤阙亚伟王政逸
- 关键词：稻瘟病菌附着胞RNA-SEQ差异表达基因
- “一带一路”倡议下水稻生物学国家重点实验室国际化交流与合作被引量：1
- 2019年
- 水稻生物学国家重点实验室利用自身优势,切实加强与“一带一路”沿线国家的国际合作,重点推广杂交水稻育种、水稻高产栽培和病虫害防控等技术以及水稻种质资源服务,开展人才培养和技术培训,助力推动“一带一路”倡议实施,对有关国家在落实粮食安全、促进农业发展、保障社会稳定等方面发挥了积极作用,实现了合作共赢。
- 王亚琴肖建富
- 关键词：一带一路
- 日照对Bt水稻花粉中杀虫蛋白含量和活性的影响
- 2007年
- 基于探讨转Bt杀虫基因水稻花粉对家蚕的生态安全性问题,研究了不同日照时间处理的Bt水稻花粉中杀虫蛋白的含量和活性变化。结果表明,Bt水稻花粉中杀虫蛋白的相对含量起初明显下降,之后随着日照时间延长,呈现上升趋势;日照处理对花粉中可溶性蛋白含量无显著影响。就不同日照时间处理的Bt花粉对家蚕蚁蚕的生物测定结果表明,随处理时间延长,LC50值虽有增高趋势,但变化不明显。以上结果显示:日照对Bt水稻花粉中的杀虫蛋白含量及活性均无显著影响。
- 蒋彩英姚洪渭叶恭银胡萃
- 关键词：BT水稻花粉家蚕杀虫活性
- 植物内生细菌测定方法的研究进展被引量：9
- 2022年
- 伴随全功能体(holobiont)和全基因组(hologenome)概念的出现,植物微生物群落被看作植物全功能体的重要组成部分,其结构和功能逐渐得到研究和解析。内生细菌是植物微生物群落的成员之一,由于其定殖在组织内部而与宿主的接触更为紧密,因而其与植物的相互作用也更加直接、高效且不容易受到环境条件变化的影响。本文介绍了植物内生细菌的基本特点,并重点综述了植物内生细菌测定方法的国内外进展。了解内生细菌的基本特点并掌握其测定方法,将促进对内生细菌与植物互作机制的探索及对全功能体中内生细菌与宿主共生机理的解析,为植物的营养和抗病育种提供内生细菌角度的新策略。
- 陈丽莹陈丽莹方荣祥张莉莉
- 关键词：植物内生细菌
- 水稻黑条矮缩病发生流行规律、监测预警与防控关键技术被引量：38
- 2007年
- 黑条矮缩病为灰飞虱传播的一种毁灭性的水稻病毒病。经2000—2005年协作攻关研究,初步探明了该病害发生流行规律、再猖獗原因与危害损失,提出了合理的防治指标、预测方法与测报调查规范;开发了“3S”监测预警技术,组建带毒率估测模型,应用于中长期预测预报;提出了以推广抗病良种、改进育秧方式、扒蘖补丛等保健栽培为基础,治秧田保大田、治虫防病的药剂防治为重点的防治新策略;初步形成适合于长江下游稻区特点的水稻黑条矮缩病综合防治的技术体系,生产上大面积推广应用,有效地控制了水稻黑条矮缩病发生危害,取得了显著的社会经济效益。
- 王华弟祝增荣陈剑平汪恩国李宝福
- 关键词：黑条矮缩病监测预警
- 灰飞虱核心共生菌的鉴定
- 2022年
- 媒介昆虫的核心共生菌能被用作基因工程菌发挥抗病毒功能。灰飞虱是一种重要的农业害虫,其传播的水稻条纹病毒造成水稻的大面积减产甚至绝收。【目的】本研究对不同稻区及温室饲养的灰飞虱进行菌群组成分析并初步鉴定灰飞虱的核心共生菌。【方法】通过16S rDNA介导的二代测序技术,分析了2018–2020年间采集自云南昆明、河南开封、河南范县稻区以及温室的灰飞虱的菌群组成。【结果】所有37个灰飞虱测序样本均携带细胞内和细胞外共生菌,细胞内生菌沃尔巴克氏体属(Wolbachia)为灰飞虱最稳定的核心共生菌,在所有样本中存在,平均相对丰度51.96%,其代表性序列OTU45占据该属85条OTU序列总数的96.55%。除Wolbachia之外,其他常见核心菌均为胞外菌,其中4种平均相对丰度最高的常见核心菌分别为不动杆菌属、泛菌属、肠杆菌属和假单胞菌属,在10种常见核心菌中平均占比0.25%–2.97%。不同稻区的灰飞虱各有优势菌,昆明为立克次体属,范县为杀雄菌属和Cardinium,开封为醋杆菌属、泛菌属和Sulcia。这些田间的优势菌包括多种细胞内生菌。稻田灰飞虱在温室进行24 h蔗糖饲喂后,Wolbachia相对丰度显著升高,菌群结构与温室灰飞虱更加接近;继代培养后,除Wolbachia之外的细胞内生菌丢失或以低丰度存在于部分样本中。【结论】本研究初步阐明灰飞虱的菌群组成并鉴定了常见核心菌及3个中国稻区的优势共生菌,为通过核心菌进行抗病毒的研究提供了可选择的共生工程菌靶标。
- 孙红波姜军陈丽莹宋泽润刘达杨杰霍岩霍岩方荣祥
- 关键词：灰飞虱温室稻田
- 水稻革兰氏阳性细菌的主要种群结构及对纹枯病和恶苗病菌的拮抗性被引量：4
- 2006年
- 于1998～2004年对采自浙江、江苏、福建和云南省的756份稻株和稻种样本进行了革兰氏阳性细菌的分离、鉴定研究。被分离的1015个菌株经致病性测定、菌落形态及部分细菌学特征（革兰氏染色、KMB培养基上的荧光色素及芽孢的染色镜检等）测定后，选出代表菌株74个连同5个对照菌株用Biolog及脂肪酸分析法（FAME）进行测试，鉴定出Bacillus属5个种及其他3属的革兰氏阳性细菌，并发现枯草芽孢杆菌和巨大芽孢杆菌菌株具有很好的纹枯病和恶苗病拮抗能力，但来自短小芽孢杆菌和巨大芽孢杆菌的极少数菌株在条件适宜时能与其他病原菌一起引起水稻褐斑，从这些种筛选生防菌株时应充分考虑其风险。
- 李斌谢关林吕意琳郝晓娟罗金燕刘波李雯
- 关键词：细菌种群纹枯病恶苗病
- 水稻根围和人体洋葱伯克氏菌的基因型比较被引量：5
- 2007年
- 洋葱伯克氏菌是一组表型相似但基因型不同的细菌群(Burkholderia cepaciacomplex,简称Bcc),它存在于水稻生境和医院中,了解水稻根围Bcc菌株基因型的地位对水稻微生物安全性具有重要的意义。以recA基因的HaeⅢ-RFLP技术和基因型特异性PCR扩增为主要方法对来自水稻根围的78株和来自医院的9株Bcc菌株进行了基因型分析。研究表明水稻根围存在Bcc菌株Ⅰ、ⅢB和Ⅴ基因型,其中Ⅴ型为优势菌;而在医院来源的Bcc菌株中,存在Ⅰ、ⅢA和ⅢB型,以ⅢA型菌株最多。这表明我国水稻根围和医院中的洋葱伯克氏菌基因型构成存在差异。同时研究发现水稻根围的Bcc菌群具有明显的遗传多态性,且存在致病力强的Ⅲ型菌株。
- 张立新宋幼良罗远婵李斌谢关林
- 关键词：基因型多样性生物安全
- 两种果蝇对不同成熟期草莓果实及其挥发物的趋性行为分析被引量：1
- 2023年
- 黑腹果蝇Drosophila melanogaster和斑翅果蝇D.suzukii能够为害包括草莓Fragaria×ananassa在内的多种浆果类经济水果,造成巨大经济损失。本研究通过分析这两种果蝇对不同成熟期草莓及其挥发物组分的趋性行为,旨在为果蝇引诱剂的研发筛选有应用价值的挥发物组分。双选择陷阱试验结果表明,相较于琼脂凝胶,各个成熟期的草莓对两种果蝇雌成虫均有显著的吸引效果。两种果蝇对不同成熟期草莓的选择偏好依次为腐坏草莓,红熟草莓和白熟草莓;红熟期和白熟期的草莓对果蝇的吸引效果无显著差异。通过HS-SPME和GC-MS收集分析了不同成熟期草莓的挥发物,发现红熟期和腐坏期草莓挥发物组分差异显著。在5种测试的化合物中,仅乙酸乙酯对两种果蝇雌虫有显著吸引效果,效应浓度为0.005%~0.05%(v/v)。
- 张璇毕亚銮方琦汪芳叶恭银
- 关键词：黑腹果蝇草莓挥发物
- 水稻上两类人体条件致病细菌的鉴别与检测被引量：3
- 2006年
- 洋葱伯克氏菌(Burkholderiacepacia,Bc)和铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,Pa)既是农业上的生防菌又是医院的人体条件致病菌,了解它们的特征及在水稻上的分布情况是有效管理和利用这类原核生物的关键。在过去的9年中,利用常规细菌学、致病性测定、Biolog和脂肪酸分析(FAME)对采自平原、丘陵和山区稻区的631份稻谷样本和117份稻株样本进行了两类人体条件致病细菌的鉴定和检测研究。Bc菌和Pa菌可通过培养性状和常规细菌学方法作初步鉴别,Biolog和FAME能把它们鉴定到种,但Bc菌的基因型难以区分。Bc菌和Pa菌主要存在于水稻的根部;Bc菌和Pa菌在浙江的平原稻区分布最广,分别达6.1%和16.1%;在山区稻区最低,分别为1.0%和7.8%。
- 郝晓娟谢关林吕意琳罗远婵张立新罗金燕赵丽涵刘少颖
- 关键词：洋葱伯克氏菌铜绿假单胞菌生物安全
