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新疆畜牧科学院生物技术研究所: 作品数：88 被引量：125H指数：6; 相关作者：李晓林更多>>; 相关机构：新疆农业大学石河子大学新疆畜牧科学院更多>>; 发文基金：国家自然科学基金新疆维吾尔自治区重点实验室开放课题基金国家科技重大专项更多>>; 相关领域：农业科学生物学轻工技术与工程自动化与计算机技术更多>>

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特克塞尔×哈萨克羊微卫星标记位点多态性与生产性状的关联分析: 2020年; 【目的】利用微卫星标记分析特克塞尔×哈萨克羊群体的遗传多样性,并与生产性状进行关联分析,为该品种的遗传育种和性状改良提供分子标记。【方法】选取11个微卫星标记,采用PCR扩增和毛细管电泳技术检测108只特克塞尔×哈萨克羊杂交群体的遗传多样性,并对各位点不同基因型与生产性状进行关联分析。【结果】11个标记位点在该群体中共检测到91个等位基因,平均等位基因数为8.273,平均观测杂合度为0.428,平均期望杂合度为0.815,平均多态信息含量为0.789。关联分析发现如下位点与相应性状之间呈极显著或显著相关:AMEL、ETH152、INRA006和INRA023与初生重、断奶重、宰前重和胴体重;CSRD247与胴体长、腿垂直长;INRA005、MAF214和MCM527与腿会斜长、腿耻斜长和踝骨宽;INRA172和OARFCB20位点与臀宽、胸宽和肩宽;INRA063与胸深。【结论】11个微卫星标记位点在该群体中具有较丰富的遗传多态性,且与生产性状均有不同程度的关联性,可以为特克塞尔×哈萨克羊性状改良和育种工作提供分子标记。; 李彬李志强韩冰比拉力·艾山张宁刘明军贺三刚依明·苏来曼; 关键词：微卫星标记生产性状

一种以RNA介导的特异性敲除双基因获得基因编辑绵羊的方法及其专用sgRNA: 本发明公开了一种以RNA介导的特异性敲除双基因获得基因编辑绵羊的方法及其专用sgRNA。本发明的sgRNA组合由sgRNA<Sub>MSTN</Sub>‑1和sgRNA<Sub>FGF5</Sub>‑1组成；sgRNA<...; 刘明军张雪梅彭新荣吴阳升林嘉鹏刘晨曦贺三刚李文蓉; 文献传递

碱基编辑系统研究最新进展及应用被引量：4: 2021年; CRISPR系统能够在基因组DNA中完成精准编辑,但依赖于细胞内的同源重组(Homologydirected recombination,HDR)修复途径,且效率极低。基于CRISPR/Cas9系统开发的碱基编辑技术(Base editing)通过将失去切割活性的核酸酶与不同碱基脱氨基酶融合,构建了两套碱基编辑系统(Baseeditors,BE):胞嘧啶碱基编辑器(Cytosine base editor,CBE)和腺嘌呤碱基编辑器(Adenine base editor,ABE)。这两类编辑器分别能够在不产生DNA双链断裂的前提下在基因靶位点完成C>T (G>A)或A>G (T>C)的替换,最终实现精准的碱基编辑。目前碱基编辑技术已经广泛应用于基因治疗、动物模型构建、精准动物育种和基因功能分析等领域,为基础和应用研究提供了强大的技术工具。文中概括了碱基编辑技术的研发过程、技术优势、应用现状、存在问题及改进策略,以期为相关领域的科研人员了解和使用碱基编辑系统提供参考。; 徐鑫刘明军

绵羊TGFβ2基因及其剪切体的克隆与生物信息学分析被引量：1: 2018年; 旨在克隆绵羊TGFβ2(Transforming growth factor-β2)基因CDS,解析其序列及编码蛋白的生物学特性,为绵羊生产利用提供理论基础。采用PCR技术克隆获得TGFβ2基因的CDS,并进行生物信息学分析。结果表明:绵羊TGFβ2基因的CDS长度为1 329bp,编码442个氨基酸;其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2由于CDS部分缺失分别编码331和414个氨基酸。绵羊TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2编码蛋白的理论等电点分别为8.74、7.60和8.82,均存在1个信号肽和1个跨膜结构域,由α-螺旋、β-折叠、延伸及无规则卷曲构成;序列同源性分析发现,绵羊TGFβ2基因编码区的核苷酸和氨基酸序列与其他哺乳动物同源性较高,进化树分析表明,绵羊TGFβ2氨基酸序列与人类的进化关系较近,与斑马鱼较远;细胞定位分析表明TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2主要在细胞外基质中发挥作用,调控下游靶基因的表达。获得绵羊TGFβ2及其可变剪切体TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2完整的CDS,与TGFβ2转录本相比,TGFβ2-AS1和TGFβ2-AS2分别缺失111和28个氨基酸序列,其可能通过与TGFβ2转录本不同的分子调控机制发挥重要的生物学作用。; 陈磊倪文浩李雯雯李欣毅李文蓉; 关键词：绵羊 TGFΒ2 克隆编码区生物信息学

伊犁不同地区绵羊消化道线虫和球虫感染的季节动态调查被引量：1: 2022年; 为了解伊犁不同地区绵羊消化道线虫和球虫季节性感染情况,在2019年的春、夏、秋、冬4个季节采集伊犁昭苏和尼勒克地区7337份粪便样本,采用饱和盐水漂浮法鉴定感染种类,采用改良麦克马斯特法定量检测,计算感染率及感染强度。结果表明:伊犁两个地区绵羊消化道线虫和球虫的感染率较高,消化道线虫呈中度感染,球虫呈轻度感染,初步鉴定出9种消化道线虫和12种绵羊艾美尔属(Eimeria spp.)球虫;昭苏地区绵羊消化道线虫平均感染强度极显著高于尼勒克地区(P<0.01),尼勒克地区球虫感染率和平均感染强度极显著高于昭苏地区(P<0.01);两个地区绵羊消化道线虫和球虫平均感染强度呈现出春季最高、夏季次之、冬季最低的流行规律;春季和冬季,昭苏地区绵羊消化道线虫平均感染强度极显著高于尼勒克地区(P<0.01);除了冬季,其他季节尼勒克地区球虫平均感染强度极显著高于昭苏地区(P<0.01);使用驱虫药伊维菌素和阿苯达唑后,绵羊消化道线虫和球虫的平均感染强度均显著降低(P<0.01),但消化道线虫虫卵转阴率、减少率均高于球虫。可见伊犁两个地区因气候温度等的不同,对绵羊消化道线虫和球虫感染情况有一定的影响。; 阎晓菲阎晓菲童婷童婷邓海峰王培明吐来力江热西旦刘明军王钰琪; 关键词：绵羊消化道线虫球虫

绵羊基质Gla蛋白基因克隆、表达谱及其在卵巢组织的定位: 2024年; 本研究旨在克隆绵羊基质Gla蛋白(MGP)基因的蛋白质编码序列(CDS),制备特异抗体,并检测该基因在绵羊卵巢组织中的表达分布。以卵泡总cDNA为模板,扩增获得绵羊MGP基因CDS区全长序列;合成绵羊MGP蛋白C末端15个氨基酸长度的多肽,免疫小鼠,制备抗血清;利用实时荧光定量PCR(qPCR)和免疫印迹技术分析其在不同组织和不同大小的卵泡中的表达水平;通过免疫组织化学方法分析其在卵巢组织中的表达分布特征。结果表明,成功获得绵羊MGP基因的CDS区全长片段(467 bp),编码103个氨基酸,理论相对分子量为12230.96,等电点为9.27;N末端19个氨基酸序列被预测为信号肽序列,成熟肽有84个氨基酸,为外泌性蛋白质,无胞内区;MGP总蛋白质氨基酸序列与山羊、牛的同源蛋白质相似性分别为100.0%、99.0%,与人、小鼠的相似性均为85.4%。MGP mRNA和蛋白质在绵羊心、肝、脾、肺、肾等组织中的相对表达量较低,在卵巢、输卵管、子宫等生殖系统或组织中的相对表达量较高,在黄体中的相对表达量也较高;MGP在卵巢组织颗粒细胞、卵丘细胞中均有表达,但在闭锁卵泡中不表达。本研究结果可为进一步研究MGP在卵巢组织中的生物学功能提供参考。; 张欣如古丽米热·阿不都热依木陈莹马秀玲林嘉鹏汪立芹黄俊成吴阳升; 关键词：基质GLA蛋白绵羊卵巢颗粒细胞

特克赛尔羊×阿勒泰羊F2代部分肉质性状的全基因组关联分析被引量：1: 2023年; 本研究测定了462只特克赛尔羊×阿勒泰羊杂交F2代羊背最长肌的肉质性状,利用全基因组关联分析(GWAS)方法初步筛选肉质性状(熟肉率、失水率)的候选基因,并通过QQ-plot图对群体层化效应进行了检测。结果表明,以上肉质性状群体层化分析没有发现明显的整体系统偏差,也不存在明显群体层化效应。关联分析结果表明共有16个SNP位点达到基因组显著水平,其中与熟肉率显著相关的位点8个,与失水率显著相关的位点8个。根据基因注释和文献检索结果,推测DOCK4、AOAH和CREB5基因可作为影响绵羊熟肉率的候选基因,所筛选出的候选基因主要通过调控肌纤维类型、参与肌肉生长过程等途径影响熟肉率;推测PRKCE和PRKG1基因可作为影响绵羊失水率的候选基因,筛选出的候选基因主要通过调控细胞分化、肌肉收缩、脂肪生成及参与肌动蛋白细胞骨架等作用而影响失水率。本研究结果将为改良绵羊肉质嫩度、多汁性提供候选分子标记,为地方品种绵羊标记辅助选择提供新的思路。; 赵义龙赵义龙黄金凤刘明军; 关键词：全基因组关联分析肉质性状

猪miR-199a-3p对mTOR基因表达的调控被引量：1: 2019年; 通过生物信息学预测miR-199a-3p与mTOR-3′UTR的结合位点,人工合成猪mTOR-3′UTR及突变型片段克隆至双荧光素酶载体上,构建野生型(psiCHECK-2-W-mTOR-3′-UTR)和突变型(psiCHECK-2-M-mTOR-3′-UTR)双荧光素酶报告质粒。给PK-15细胞分别转染miR-199a-3p mimics、negative control和mTOR-3′-UTR野生型/突变型双荧光素酶报告载体,用双荧光素酶试剂盒检测荧光素酶活性,分别采用RT-qPCR和Western blot检测mTOR基因的mRNA和蛋白表达水平。结果表明,将含mTOR-3′-UTR的野生型和突变型双荧光素酶报告质粒与miR-199a-3p mimic共转染PK-15细胞,野生型报告质粒表达的荧光素酶活性显著低于其阴性对照组(P<0.05);转染miR-199a-3p mimics能显著下调mTOR基因mRNA和蛋白的表达(P<0.05),而转染miR-199a-3p Inhibitor组和Inhibitor-NC组相比,mTOR基因蛋白表达差异不显著(P>0.05)。成功构建了猪野生型及突变型mTOR-3′-UTR双荧光素酶报告质粒,通过双荧光素酶试验、RT-qPCR及Western blot证实miR-199a-3p与猪mTOR-3′-UTR存在靶向调控关系。; 邱梅玉黄涛李涛孙敬礼

基于CRISPR/Cas9获得不同毛色绵羊的方法及靶向ASIP基因的sgRNA: 本发明公开了一种基于CRISPR/Cas9获得不同毛色绵羊的方法及靶向ASIP基因的sgRNA。本发明提供了一种能够特异的靶向修饰绵羊ASIP基因的sgRNA(ASIP‑sgRNA)，为序列表的序列4自5’末端第3至22...; 刘明军张雪梅贺三刚李文蓉刘晨曦彭新荣林嘉鹏陈磊; 文献传递

选择信号分析及其对绵羊功能基因的挖掘进展被引量：1: 2023年; 绵羊经过长期自然和人工选择,形成了丰富多样的品种资源,并为人类提供肉、奶、毛、皮等生活物资。选择发生时伴随着选择信号的产生,常见的选择信号有群体分化、基因组多样性下降且存在高频等位基因的区域及被选择区域长范围扩展单倍型纯合等。针对不同类型的选择信号衍生出了相应的分析方法,如基于群体分化分析、基于基因组杂合度分析、基于单倍型和连锁不平衡分析和基于等位基因频率谱分析等。近年来,随着高通量测序技术的发展,研究人员通过对绵羊进行选择信号分析,挖掘出大量与经济性状相关的功能基因,为绵羊分子育种提供了更多的遗传信息。作者对选择信号的分类与检测方法及其对绵羊功能基因的筛选进行了介绍,并对选择信号分析的应用方向和研究前景进行了展望,旨在为选择信号分析在绵羊遗传育种中的应用提供借鉴。; 张彦威于丽娟徐新明阿米妮古丽·阿不来孜谢梦婉唐丽苹郑培宇狄江; 关键词：绵羊功能基因

新疆畜牧科学院生物技术研究所

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