国家人类基因组北方研究中心
- 作品数:161 被引量:687H指数:12
- 相关作者:姚志建顾朱勤冯秀丽高鹏谢淑更多>>
- 相关机构:中国人民解放军总医院首都医科大学宣武医院北京大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学机械工程农业科学更多>>
- 人类新基因RNF122的克隆、表达和亚细胞定位被引量:2
- 2006年
- 目的:克隆了一个未知功能的人类新基因RNF122,分析了它的表达谱和细胞定位,为其功能研究提供基础。方法:利用Refseq数据库的序列资料,从人混合组织文库中通过PCR和DNA测序克隆了全长的RNF122,通过生物信息学分析RNF122的结构特性。用Northernblot,RTPCR等方法研究了RNF122在正常组织、肿瘤组织、细胞系中的表达情况。应用共聚焦显微镜分析了它在细胞中的亚细胞定位。结果:获得RNF122全长编码区序列,并构建了绿色荧光蛋白表达质粒。生物信息学分析显示RNF122编码的蛋白中有一个典型的RING结构域。Northernblot和RTPCR证明RNF122在多种正常组织、肿瘤组织和细胞系中都有表达。激光共聚焦显微镜提示RNF122编码蛋白在细胞中定位于高尔基体和内质网。结论:RNF122是一个新的编码含有RING结构域的新基因,它广泛表达于多种组织和细胞系,它编码的蛋白产物定位于高尔基体和内质网中,其可能参与了细胞内蛋白的降解过程。
- 汪立石太平王兰于传飞曾令娥王京王露
- 关键词:基因计算生物学基因表达谱
- ESR1基因多态性能影响慢性乙型肝炎的发病风险
- 2004年
- 周钢桥
- 关键词:发病风险慢性乙型肝炎慢性化ESR核心家系
- 散发感音神经性聋患者中GJB2基因突变检测的临床意义被引量:1
- 2008年
- 目的探讨散发感音神经性聋患者中GJB2基因突变检测的临床指导意义。方法运用聚合酶链反应对解放军总医院听力诊断中心收集的242例散发感音神经性聋患者(135例语前聋患者,107例语后聋患者)的GJB2基因编码区进行扩增,扩增产物纯化后直接测序分析。结果135例语前聋患者中GJB2基因致病突变的复合杂合和纯合个体有26例,占语前聋个体的19.26%;107例语后聋患者中未发现复合杂合和纯合致病突变,仅发现3例235delC杂合突变携带者、1例176del16杂合突变携带者。结论语前聋者GJB2基因致病突变阳性率明显高于语后聋患者,语前聋患者常规进行GJB2基因检测可从基因水平明确诊断,并为耳聋患者提供重要遗传信息。
- 韩明鲲韩东一兰兰王大勇赵翠刘晓雯王秋菊
- 关键词:听觉丧失感音神经性GJB2基因突变
- 遗传性听力损失基因组学研究现状与挑战被引量:1
- 2006年
- 在21世纪生命科学飞速发展的今天,医学已经进入一个基因组医学时代,人们对健康和疾病的认识在前所未有的分子水平上得到详尽的分析和理解。此时,不寻常的机遇和挑战摆在了我们这些维护生命健康和从事临床实践的医师面前。纵观十余年遗传性听力损失的发展历史,毋庸置疑的是,由于基因组学的快速发展和伟大成就才使得我们在一个研究手段有限、研究范围极为狭窄的专业领域中产生了快速的突破。同时,也使我们不得不思考,我们如何面对这样的机遇和挑战?
- 韩东一王秋菊
- 运用蛋白质组学技术对Sa抗原的研究
- 自Mcnard等于1994年提出Sa抗原/抗体系统以来,已经证实了抗Sa抗体对于类风湿关节炎(RA)的诊断价值(敏感度约37%,特异度94%~99%),但是Western印迹法检测抗Sa抗体难度大而不易推广。多年来Sa抗...
- 陈华唐福林姚志建
- 文献传递
- 中国西北地区线粒体DNA12SrRNAA1555G和GJB2基因突变被引量:48
- 2006年
- 目的研究mtDNA 12SrRNA A1555G突变和GJB2突变在西北地区非综合征型感音神经性聋患者中的流行情况,探讨GJB2基因与mtDNA A1555G点突变的关系。方法收集本地区221例非综合征感音神经性聋患者的基因组DNA,多聚酶链反应扩增线粒体DNA和GJB2基因目的片断,Alw26 I限制性内切酶检测A1555G点突变,对酶切阳性病例和全部的GJB2基因的PCR产物进行DNA测序。结果21例患者检出mtDNA 12SrRNA A1555G突变;发现GJB2基因11种序列改变,有44例患者检出GJB2致病突变,235 delC占携带致病突变患者的54.54%;在21例A1555G突变患者中,11例为GJB2基因多态改变,9例未检出GJB2基因序列改变,1例为109G→A(V371)突变。结论mDNA 12SrRNAA1555G在这一地区人群中有较高的发生频率,235delC是本地区GJB2基因突变的主要形式,GJB2基因突变不是mtDNA A1555G突变致聋的主要修饰因素。
- 郭玉芬徐百成韩东一关静兰兰赵翠陈之慧袁虎王秋菊
- 关键词:听力障碍基因突变
- 中国散发耳聋患者GJB6基因的突变筛查被引量:9
- 2006年
- 目的研究中国散发耳聋患者与缝隙连接蛋白beta-6基因(gap junction protein beta 6 gene,GJB6)突变的相关性。方法分别设计扩增GJB6基因编码区和大片缺失后产物的引物各1对,应用PCR产物直接测序方法对各种感音神经性耳聋患者214例、正常听力者86例进行GJB6基因的突变检测及鉴定。结果没有发现在欧美耳聋人群中常见的GJB6大片段缺失,在214例患者中仅发现GJB6基因一种杂合错义突变,为一个新的突变形式233(C→A),进一步的各物种多种连接蛋白氨基酸序列进化分析证实该突变位点位于C×30高度保守的第二跨膜区。86例正常对照组中未发现同样突变。结论通过研究发现GJB6突变不是中国散发耳聋患者中的常见致病因素,为下一步开展耳聋相关基因和临床基因诊断研究打下了基础。
- 韩东一李庆忠兰兰赵亚丽袁虎李丽娜刘穹王秋菊
- 关键词:基因突变听力障碍
- KCNN4及KPTN基因在中国DFNA4型耳聋中的突变检测
- 2006年
- 目的应用位置候选基因法了解中国DFNA4型耳聋家系定位区域内的两个基因KCNN4、KPTN与该家系耳聋表型的相关性。方法对一个6代相传、全基因组扫描连锁分析定位于DFNA4座位的常染色体显性遗传性耳聋中国家系成员,针对候选基因KCNN4、KPTN的全部编码序列设计引物,应用PCR扩增反应、产物纯化后直接测序的方法进行突变或多态性位点的检测与鉴定。结果两种基因的各对引物均有较好的扩增效果,直接测序结果与标准序列比对分析显示在KCNN4基因的所有编码区未检测到突变;在KPTN基因外显子10的编码区鉴定出一处同义突变(2154G/A,P302P),该突变不与家系的耳聋表型共分离,为已报道的单核苷酸多态性(SNP)位点(rs2293424)。结论该中国DFNA4家系的耳聋表型不是由其定位区域内的KCNN4、KPTN基因编码区的突变所导致,但这两个基因仍是极好的耳聋候选基因,其与遗传性耳聋的相关性有待进一步研究。
- 纵亮韩东一兰兰郭维维赵亚丽袁虎王秋菊
- 关键词:基因突变
- 先天性内耳畸形家系致病基因的定位克隆被引量:4
- 2006年
- 目的应用分子遗传学的方法揭示一个X-连锁遗传先天性内耳畸形家系的分子病理机制。方法利用X染色体上的微卫星标记进行基因组扫描,通过连锁分析的方法进行致病基因的定位;在定位区域内选取候选基因进行突变筛查。结果①家系所有患者成员均为男性,表型特征为先天性极重度耳聋,颞骨CT扫描发现内耳道扩大,其基底部骨质缺损,蜗轴发育不全,遗传特点符合X-连锁遗传模式;②通过连锁分析在DXS990处得出的最大LOD值为3.27(θ=0.0),将该家系定位在Xq13.1-23之间的区域内;③对定位区域内的基因进行分析后将POU3F4基因作为候选基因对家系成员进行突变检测,发现了与家系中患者成员内耳畸形表型共分离的POU3F4基因新的突变形式(925T→C),该突变位于POU同源结构域中的保守位点,导致编码蛋白氨基酸第309位的丝氨酸突变成脯氨酸(Ser309Pro),110例正常对照者中没有发现同样的突变。结论POU3F4基因一种新的突变形式是导致中国先天性内耳畸形家系中患者的分子病理机制。
- 李庆忠王秋菊赵亚丽袁虎李丽娜韩东一
- 关键词:迷路疾病畸形基因突变定位克隆
- 时钟基因在胚胎干细胞分化为神经元过程中的表达特征被引量:2
- 2007年
- 目的检测小鼠胚胎干细胞(ES)体外向神经元诱导分化过程中,7种重要时钟基因的表达情况。方法小鼠胚胎十细胞(ES),经过5个阶段诱导分化为神经元。各阶段细胞的总 RNA反转录为 cDNA,利用7种时钟基因的特异引物进行 PCR 反应,以明确其随分化表达的情况。结果各个时钟基因无非特异扩增,BMAL1、CLOCK、CRY1和 CRY2、PER1、PER3基因在各个分化阶段中都表达,而 PER2基因只在终末阶段被检测到。结论时钟基因的转录在 ES 细胞向神经元分化的过程中并不一致,提示在成体动物存在的时钟基因环路,在 ES 细胞向神经元分化过程中还没有建立。PER2 仅在分化终末期——大量停止分裂的神经元和胶质细胞出现的时期才转录,提示其可能在细胞增殖过程中发挥某种作用。
- 谢淑蔡彦宁关云谦武文琪徐艳玲张愚陈彪
- 关键词:胚胎干细胞细胞分化神经元节律基因