国家自然科学基金(31170007) 作品数:18 被引量:67 H指数:4 相关作者: 潘渠 苏森森 王海娟 代富英 高小洁 更多>> 相关机构: 成都医学院 成都军区昆明总医院 成都军区总医院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 轻工技术与工程 更多>>
益生菌对宿主心理健康及脑功能的积极影响及其机制 被引量:13 2017年 肠道中的益生菌不仅对胃肠道发挥着益生作用,而且还调节着体内的激素水平和炎症平衡。通过免疫、内分泌和迷走神经途径,益生菌与大脑形成一个称之为脑—肠轴的反馈回路,深刻影响着大脑的认知功能及人体的情绪反应,促进宿主的心理健康。 苏森森 潘渠关键词:益生菌 肠道菌群 脑功能 心理健康 粪便乳杆菌新种在中国的再发现 被引量:1 2015年 目的分离鉴定白鹭粪便中的乳杆菌。方法使用乳杆菌PCR快速检出技术检出白鹭粪便样品中的乳杆菌。将乳杆菌的保守基因16S r DNA、rpo A和rec A克隆测序,并进行序列分析。使用细菌微量生化管和常规生化试验测定乳杆菌糖发酵产酸等生化特征。结果从白鹭粪便样品得到1株乳杆菌菌株FZB1,其16S r DNA基因和粪便乳杆菌AFL13-2的16S r DNA基因最相似,相似性为99.2%。Rpo A的氨基酸残基序列比对结果表明:该菌株和姬鼠乳杆菌、动物乳杆菌、鼠乳杆菌的亲缘关系最近,其相似性分别达到了97.1%、97.1%和96.7%。该菌株的Rec A氨基酸残基序列和粪便乳杆菌完全相同,和姬鼠乳杆菌、动物乳杆菌、鼠乳杆菌的Rec A氨基酸残基序列有较高的相似性,分别为91.9%、91.5%和91.5%。生化鉴定结果表明:该菌株符合乳杆菌属和粪便乳杆菌的生化特征。结论我们从中国的白鹭粪便中分离鉴定到了一株粪便乳杆菌,这是2013年在南非发现的新种。粪便乳杆菌在中国的再次发现充实了乳杆菌种质资源库,证明了粪便乳杆菌的广泛分布。 戴雨珂 王海娟 余小平 许颖 苏森森 代富英 潘渠关键词:RDNA RECA 益生菌 全基因组测序后质粒的组装与鉴定研究进展 被引量:1 2022年 全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)从1977年发展至今,已成为一种快速、低成本获取生物体全基因组的方法[1]。WGS可发现基因组变异,在微生物的分类鉴定中应用广泛[2]。WGS经历了三代技术革新,二代测序和三代测序的结合已成为目前最广泛的杂交测序方法[3-4]。杂交测序一方面使用长读长跨越重复序列或缺口,另一方面使用短读长纠正测序中错误的碱基[5]。GenBank数据库中完成WGS的菌株越来越多,用传统的DNA文库或PCR扩增的方法无法获得的质粒可由WGS数据进行组装,但组装质粒的正确性和完整性需要进一步鉴定和分析。 苟秋凤 代富英 曹康 谢拥军 潘渠关键词:全基因组测序 基因组 质粒 魏斯氏菌的研究现状 被引量:19 2014年 魏斯氏菌(Weissella)属于乳酸菌(lactic acid bacteria),其在微生物学、医药学、发酵、工业及食品加工等方面的作用近年来开始受到研究者的关注。本文主要对魏斯氏菌中的质粒、β-葡糖苷酶、噬菌体及其益生作用等作一综述。1魏斯氏菌的主要特征目前GenBank数据库中(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)魏斯氏菌属已命名的有15个种。 王海娟 戴雨珂 潘渠关键词:质粒 Β-葡糖苷酶 Theta复制A类质粒的研究进展 被引量:1 2020年 质粒主要存在于古细菌、细菌和真核细菌等领域[1-3],其通过重组或转座来整合和传递基因,促进细菌种群的遗传交换。质粒携带的基因赋予宿主细菌新的表型,让细菌更好地适应生存环境[4]。环状质粒有theta复制、滚环复制与链替换复制3种复制机制。过去观点认为,滚环复制的质粒更多出现在革兰阳性菌中,theta复制的质粒更多出现在革兰阴性菌中。随着测序和质粒提取技术的发展,在革兰阳性菌中不断发现theta复制的质粒。质粒的复制起点可决定其生物学特性[5-7]。质粒大小方面,滚环复制的质粒较小,theta复制的质粒较大;宿主范围方面,具有ColE1类质粒复制起点的质粒,其宿主范围较窄,具有RK2质粒复制起点的质粒,其宿主范围较宽;质粒的拷贝数受复制起点中串联重复序列的重复次数控制。Theta复制质粒的传统分类方法是参考Rep蛋白的氨基酸序列同源性分类[8],也可根据复制起点的共有序列,分为pUCL287[9]家族、pUCL22家族[10]等;但越来越多的theta复制质粒难以分类,如pLP60、pB21AG02等。目前最新的方法是根据复制机制进行分类[11]。本综述将依据最新分类方法,重点讨论theta复制A类质粒的研究进展,包括复制起点、Rep蛋白、复制机制、拷贝数调控及分类。 姚芳 代富英 曹康 谢拥军 潘渠关键词:质粒 粪便乳杆菌FZB1菌株的益生特性研究 被引量:1 2016年 目的 研究粪便乳杆菌FZB1菌株的益生特性。方法 采用API 50CH乳酸菌鉴定试剂条测定碳源利用能力。通过生长实验测定粪便乳杆菌FZB1菌株的耐酸性和对不同胆盐的耐受性。用荧光标记法,以人结肠癌细胞HT-29作为体外模型,研究粪便乳杆菌FZB1菌株的黏附性能及对病原菌大肠杆菌E_(57)黏附抑制性能。结果 试验结果显示,粪便乳杆菌FZB1菌株可利用多种碳源和乳糖,耐受pH 3.0的酸度,可在0.4%牛磺石胆酸钠、0.08%胆酸钠、0.15%禽胆盐、0.15%脱氧胆酸钠、0.15%牛磺鹅脱氧胆酸钠和0.06%牛胆盐环境中生长。粪便乳杆菌FZB1菌株对HT-29细胞的黏附率可达88.7%,能通过竞争、排斥、置换作用阻止大肠杆菌E_(57)的黏附,黏附率分别为86.4%、79.5%和47.8%。结论 粪便乳杆菌FZB1菌株具有降解乳糖、耐酸、耐胆盐和在肠道定植黏附的能力,适合在鸡、鸭、鹅等家禽肠道中发挥益生作用。 苏森森 郑悦 高小洁 潘渠关键词:益生菌 乳杆菌 益生特性 部分牙膏抑菌效果调查及牙膏抑菌剂比较 被引量:1 2014年 目的调查10种牙膏和6种牙膏抑菌剂的抑菌效果。方法以大肠埃希菌、耐氨苄青霉素大肠埃希菌、表皮葡萄球菌和枯草芽胞杆菌为测试菌株,采用纸片扩散法观察抑菌效果,以抑菌圈的直径作为评价标准。结果 9种牙膏对大肠埃希菌无抑制作用。1种牙膏(含三氯生)对4种菌株均有抑菌作用,而且对4种菌株的抑菌圈都是最大的。6种牙膏抑菌剂中只有三氯生和度米芬对4种菌株均有抑制作用,但度米芬的抑菌圈远小于三氯生的抑菌圈。结论三氯生是目前较好的牙膏抑菌剂,应加强安全高效牙膏抑菌剂的研发。 刘淑萍 金波 李桢 李培 蒲锗遐 潘渠关键词:牙膏 抑菌效果 三氯生 原发性肝淋巴瘤的影像学表现研究 被引量:7 2018年 目的探讨原发性肝淋巴瘤的CT、MRI、PET综合影像学表现。方法收集解放军西部战区总医院和解放军昆明总医院2008年3月至2017年12月经病理证实的21例原发性肝淋巴瘤患者资料,回顾分析其CT、MRI、PET影像学表现,归纳其影像学特点。结果 21例患者中,单发病灶13例,2个病灶6例,≥3个病灶2例;病灶大多位于肝右叶,肝左叶和尾状叶未见病灶生长;病灶多呈圆形,最大者直径约13.7cm,最小者约2.3cm,平均直径约(5.6±1.3)cm。CT平扫示肝内低密度或稍低密度影,边界清楚,内部密度均匀;增强扫描病灶边缘明显强化,病灶内部轻度强化,14例病灶可见"血管漂浮征"。MRI平扫示病灶T1加权呈低信号,T2加权呈高信号,DWI病灶内部呈高信号,增强扫描病灶强化表现与CT强化相似。18 FDG-PET/CT显像检查见全部肝脏病灶均见放射性异常浓聚,SUV最大值19.3,最小值4.4,平均值12.6;延迟1h显像示所有肝脏病灶SUV值均不同程度升高。结论原发性肝淋巴瘤CT、MRI、PET检查表现具有一定的共性特征,其联合运用可提高肝脏淋巴瘤的诊断水平。 关静 杜飞舟 魏萌 彭艳梅 陈翼关键词:淋巴瘤 计算机断层扫描 核磁共振成像 正电子发射计算机断层显像 革兰阳性菌质粒提取方法的改良和质粒pLP60的序列分析 植物乳杆菌是乳酸菌中环境适应性最强的菌株之一,是乳酸菌研究的模式菌株。它携带的天然质粒对植物乳杆菌的生存具有重要意义。通过对植物乳杆菌天然质粒的研究能够促进植物乳杆菌的研究和运用。由于植物乳杆菌是革兰阳性菌,其细胞壁相对... 姚芳关键词:植物乳杆菌 质粒 溶菌酶 文献传递 泡菜中乳杆菌的快速检出和乳杆菌质粒资源的初步调查 被引量:4 2013年 乳杆菌(Lactobacillus)的质粒不仅决定了乳杆菌的某些性状,还应用于乳杆菌克隆表达载体的构建,是一种珍贵的遗传信息资源。为了调查中国泡菜中的乳杆菌质粒资源,采集了52份中国泡菜样品,采用乳杆菌PCR快速检出技术检出其中的乳杆菌,并用16s rDNA测序验证检出结果,然后提取检出乳杆菌菌株的质粒。结果检出1株清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei)和18株植物乳杆菌(Lactobacillus plantarum),乳杆菌检出率为36.5%。检出含质粒的乳杆菌菌株11株,琼脂糖电泳显示有9种质粒谱型,乳杆菌质粒检出率为21.2%,质粒谱型检出率为17.3%。调查结果提示,中国泡菜中蕴藏丰富的乳杆菌质粒资源,值得进行更大规模的调查和研究。 杨四佳 王颖 李宇婷 李晨 张进 刘锐 潘渠关键词:中国泡菜 乳杆菌 质粒 快速检出 PCR