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国家自然科学基金(3090119)

作品数:2 被引量:2H指数:1
相关作者:李君文赵宏谌志强曲鹏尹静更多>>
相关机构:军事医学科学院天津出入境检验检疫局动植物与食品检测中心更多>>
发文基金:天津市科技计划国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
相关领域:轻工技术与工程生物学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学
  • 1篇轻工技术与工...

主题

  • 2篇食品
  • 2篇埃希氏菌
  • 2篇大肠埃希氏菌
  • 1篇单核
  • 1篇单核苷酸
  • 1篇单核苷酸多态
  • 1篇单核苷酸多态...
  • 1篇地理
  • 1篇地理来源
  • 1篇多态
  • 1篇多态性
  • 1篇多位点序列分...
  • 1篇核苷
  • 1篇核苷酸
  • 1篇分子
  • 1篇分子分型
  • 1篇MLST

机构

  • 2篇军事医学科学...
  • 1篇天津出入境检...

作者

  • 2篇赵宏
  • 2篇李君文
  • 1篇谌志强
  • 1篇尹静
  • 1篇曲鹏

传媒

  • 2篇解放军预防医...

年份

  • 2篇2012
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
不同地理来源的食品中大肠埃希氏菌eBURST分析被引量:2
2012年
目的研究不同地理来源的食品中大肠埃希氏菌的群体进化关系,为流行病学调查及有效控制食源性大肠埃希氏菌导致的食品安全事件提供理论支持。方法按照大肠埃希氏菌多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)规则,根据地理溯源研究中遴选的4个持家基因测序数据,利用数据库查询每株食品分离株的序列类型(sequence types,ST),再对所有食品分离株进行eBURST(enhanced based upon related sequence types)分析。结果得到了食品中大肠埃希氏菌分离株群体的遗传关系。eBURST分析显示不同地理来源菌株存在相同起源株,不仅在同一大洲相邻国家或地区之间,而且在不同大洲非相邻国家或地区之间都存在着同质性的克隆株复合体。结论大肠埃希氏菌在具有相同起源的基础上存在丰富的遗传多样性;eBURST分析更擅于揭示不同地理来源大肠埃希氏菌株之间的进化关系。
赵宏谌志强李君文
关键词:大肠埃希氏菌食品
应用单核苷酸多态性技术对食品中大肠埃希氏菌的地理溯源
2012年
目的利用大肠埃希氏菌持家基因中高分辨力单核苷酸多态性(SNP)位点对不同地理来源食品中的大肠埃希氏菌进行地理溯源,为追溯、控制食源性感染提供技术保障。方法根据大肠埃希氏菌多位点基因序列分型(MLST)数据库中序列信息,利用SNP分析软件Minimum SNPs测算得到大肠埃希氏菌4个持家基因中的12个高分辨力SNP位点。利用这些位点组合对来源于12个国家或地区的食品中分离出的253株大肠埃希氏菌进行分析。结果得到了大肠埃希氏菌特异性的地理标记;盲样分析证明洲际溯源准确率为80%,国家或地区溯源准确率为60%。结论持家基因中的高分辨力SNP位点组合具有对不同地理来源大肠埃希氏菌进行追溯的能力。
赵宏尹静曲鹏李君文
关键词:大肠埃希氏菌单核苷酸多态性食品分子分型
共1页<1>
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