江西省自然科学基金(2010GQN0032)
- 作品数：2 被引量：4H指数：2
- 相关作者：雷建军王恒肖旭峰王义林黄敏更多>>
- 相关机构：华南农业大学江西农业大学江西生物科技职业学院更多>>
- 发文基金：江西省自然科学基金博士科研启动基金江西省教育厅青年科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 菜薹抽薹相关基因BrcuDFR-like/BrcuAXS的克隆与表达特性分析被引量：2
- 2012年
- 为了预测抽薹相关基因BrcuDFR-like/BrcuAXS的功能,通过PCR和RACE的方法克隆了菜薹BrcuDFR-like/BrcuAXS基因的cDNA和gDNA全长序列。结果表明:该基因编码区全长1332bp,编码312个氨基酸残基。对应的gDNA全长为2460bp,含有8个外显子和7个内含子,内含子总长为1042bp,其中第3个内含子最长,为401bp。内含子中含有多个基本转录元件和顺式作用元件,如光应答元件、赤霉素响应元件、参与抗性和胁迫应答元件、热响应元件、WRKY转录因子的结合位点及干旱胁迫元件MYB转录因子结合位点等。利用半定量RT-PCR分析表达模式,发现BrcuDFR-like/BrcuAXS随菜薹花芽形态逐步建成直至抽薹开花,其表达量逐渐增强,与其它物种DFR-like基因的表达模式更吻合,由此预测该基因在菜薹生长发育阶段编码DFR-like酶的可能性大于编码AXS的可能性,其功能可能与菜薹营养分生组织向花分生组织转变有关。
- 肖旭峰王恒王义林曹必好雷建军
- 关键词：菜薹抽薹基因结构
- 菜心cDNA-AFLP分析体系的优化与建立被引量：2
- 2013年
- 以菜心的顶端分生组织为试材,对影响菜心cDNA-AFLP体系的关键因子进行了探讨,以期建立适于菜心转录组差异表达的cDNA-AFLP分析体系。结果表明:Trizol法适用于菜心总RNA提取;SMART双链cDNA合成法效率较高,其中第二链cDNA合成的最佳循环数为24个;Taq I/Ase I分步各酶切3 h可使双链cDNA酶切完全;预扩增体系以模板稀释20倍,27个循环扩增效果较好,退火温度对扩增结果影响不大,但Mg2+对PCR扩增影响较大,经比较加入2.5μL Mg2+(25 mmoL/L)的预扩及选扩电泳的效果均最佳;预扩产物稀释20倍用于选择性扩增,其PAGE电泳可以获得丰富且重复性好的带型。cDNA-AFLP分析体系的优化与建立为菜心抽薹开花分子机理进一步研究奠定了基础。
- 肖旭峰王恒黄敏雷建军
- 关键词：菜心CDNA-AFLP
