国家海洋局近岸海域生态环境重点实验室开放基金(200504)
- 作品数：2 被引量：9H指数：2
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- 相关机构：国家海洋环境监测中心大连水产学院更多>>
- 发文基金：国家海洋局近岸海域生态环境重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 基于ITS序列分析的赤潮异弯藻(Heterosigma akashiwo)分子鉴别被引量：7
- 2008年
- 对五株赤潮异弯藻核糖体转录单元内间隔区(ITS区)进行了PCR扩增和序列测定,并结合GenBank中收录的所有赤潮异弯藻ITS序列信息,比较了它们的遗传距离和相似系数,同时结合GenBank中发布的针胞藻纲其他三个属的代表种ITS序列信息,采用邻接法(neighbour-joining,NJ)和最小进化法(minimum evolution,ME)构建系统发育树。结果表明,五株赤潮异弯藻ITS全序列总长度及碱基组成完全一致,均为538 bp,与GenBank中收录的四株赤潮异弯藻仅有一个碱基不同,遗传距离和相似系数分别为0.002和0.980,而与其他赤潮异弯藻ITS序列完全相同,遗传距离和相似系数分别为0.000和1.000。用两种方法构建的系统发育树结构完全一致,赤潮异弯藻属与海洋卡盾藻属亲缘关系较近,而与另外两属的亲缘关系较远。
- 梁斌陈斌洛昊郭皓
- 关键词：赤潮异弯藻ITS分子鉴定
- 应用荧光原位杂交方法检测赤潮异弯藻被引量：2
- 2009年
- 根据对赤潮异弯藻(Heterosigma akashiwo)核糖体大亚基(LSU)和核糖体转录单元内间隔区(ITS)序列信息的分析,设计了以胞质rRNA和胞核rDNA为靶序列的特异性探针,建立了赤潮异弯藻的全细胞和细胞核荧光原位杂交快速检测方法。结果表明,探针能分别使整个细胞质和细胞核呈现强烈的绿色荧光;探针是特异性的,不与其他受试藻进行交叉反应。同时,用该方法成功的从模拟自然海区混合样品中检测出赤潮异弯藻。该研究方法可以适用于对实验室和自然海区赤潮异弯藻样品的快速、准确、特异和半定量检测。
- 陈斌梁斌郭皓
- 关键词：赤潮异弯藻荧光原位杂交
