“十一五”国家科技支撑计划(2009BADB8B03)
- 作品数:2 被引量:9H指数:2
- 相关作者:康俊根朱琴丁云花康宗利简元才更多>>
- 相关机构:北京市农林科学院蔬菜研究中心沈阳农业大学西北师范大学更多>>
- 发文基金:北京市自然科学基金“十一五”国家科技支撑计划国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生更多>>
- 低表达甘蓝花药发育相关基因小体积荧光定量反应体系的建立和可靠性分析被引量:3
- 2011年
- 植物发育过程中很多重要基因拷贝数较低。为建立稳定可靠、适于低拷贝微量模板表达分析的实时qRT-PCR小体积反应体系,采用在甘蓝花药中表达量较少的AT-HOOK基因进行小反应体积荧光定量表达分析,研究小反应体积的扩增效率和可行性,并通过对其在甘蓝不同植物器官、不同花药组织和花药发育不同时期的表达特征的重复性和可靠性分析,最终建立了稳定可靠而且成本较低的10μL荧光定量分析体系,为进一步大规模深入研究甘蓝花药发育相关基因表达特征及发育调控基因功能分析奠定基础,同时也为其他低拷贝表达基因的研究提供参考。
- 王效维刘海霞杨颖丽康俊根
- 关键词:甘蓝实时荧光定量PCR
- 甘蓝细胞质雄性不育相关基因orf138的分子特性分析被引量:6
- 2012年
- 以甘蓝Ogura细胞质雄性不育系为材料,找出能够有效鉴定由orf138导致的甘蓝CMS的标记,并明确此基因在甘蓝OguCMS基因组中的位置。根据萝卜CMS相关基因orf138的序列信息,设计特异引物,并在甘蓝不同类型不育系和保持系中鉴定PCR产物的稳定性。随后利用Tail-PCR技术,扩增获得此基因的侧翼序列并进行了生物信息学分析。根据orf138的全长序列设计引物Bo138300BF/R,在甘蓝不育型材料中,能够稳定扩增出300bp左右的单一条带,而在其他细胞质不育类型和可育材料中均未扩出条带,经多次验证结果稳定可靠。甘蓝中orf138的上下游侧翼序列有效碱基1789bp,通过生物信息学分析,获得包括起始密码和终止密码的orf138的完整序列共417bp。同源性比对结果显示:与甘蓝型油菜、白菜和萝卜的orf138片段具有高度保守性。分析侧翼序列表明甘蓝orf138的3’端是由ORF83、trnfM、ORF125等基因片段构成的一个复杂序列。获得了甘蓝OguCMS特异的分子鉴定标记,明确了orf138在甘蓝线粒体中的位置,以上结果为甘蓝雄性不育的进一步研究奠定良好的基础。
- 朱琴康宗利简元才丁云花康俊根
- 关键词:甘蓝雄性不育ORF138