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苹果SnRK2基因家族的鉴定和生物信息学分析被引量：8: 2013年; SnRK2是植物特有的一类Ser/Thr类蛋白激酶,在植物逆境生理过程中扮演了重要的角色。利用隐马可夫模型搜索和系统建树的方法,在苹果基因组中鉴定出了16个SnRK2基因家族成员,然后从系统发生、理化性质、二级结构、motif、C末端序列和EST等方面对其进行了预测和分析。结果表明,苹果SnRK2家族为亲水性蛋白,二级结构主要以α-螺旋和不规则卷曲为主;在系谱发生上与拟南芥、水稻、玉米所有的SnRK2蛋白一起分成了3个亚族;motif和C末端序列分析显示,苹果SnRK2蛋白激酶家族具有较高的保守性;EST表达分析显示,16个MdSnRK2在不同组织中呈不均匀分布,具有组织特异性。本研究为苹果SnRK2基因家族生物学功能的研究奠定了生物信息基础。; 陈娜娜刘金义蔡斌王刚王敏程宗明; 关键词：苹果蛋白激酶基因组

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江苏高校优势学科建设工程资助项目(130809001)