国家自然科学基金(s21175055)
- 作品数：2 被引量：4H指数：2
- 相关作者：杨静波王子健孙万春高祥刘宁更多>>
- 相关机构：吉林大学第二医院吉林大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金吉林省科技发展计划基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生理学更多>>
- 基于不同裂解液的蛋白质组样品制备方法的比较研究被引量：2
- 2015年
- 蛋白质组学研究所面临的首要问题就是蛋白质组的样品制备,而不同的样品制备方案针对细胞、组织等样品的裂解能力,以及对不同种类蛋白的溶解能力会有很大的差异。本研究以培养的293T细胞为对象,利用质谱分析鉴定蛋白的方法,比较了采用3种常用的蛋白质组样品制备方法(Triton X-100法、尿素法和TRIzol法)所提取蛋白种类的差异,并利用生物信息学工具对所得数据进行了分析。结果表明,Triton X-100法和尿素法所提取蛋白的鉴定数目接近,而TRIzol法所提取蛋白的鉴定数目比二者减少约8%。从所鉴定的蛋白种类来看,3种方法相差较大,仅约有32%的蛋白为3种方法所共有,生物学功能也不尽相同。本研究为评价各种蛋白质组样品制备方法提供了一种快速、有效、全面的研究方法。
- 孙宁宁王子健高祥程欣孙万春杨静波刘宁
- 关键词：蛋白质组尿素TRIZOL液相色谱-质谱联用
- A型流感病毒血凝素蛋白S-棕榈酰化修饰的质谱分析被引量：2
- 2016年
- 蛋白质S-棕榈酰化修饰是指棕榈酸分子通过硫酯键共价结合在蛋白质分子的半胱氨酸(S)的巯基侧链上,是蛋白质脂类修饰的重要形式之一,在细胞信号转导、代谢等过程中起着重要作用。本实验首先利用酰基-生物素置换反应,将A型流感病毒血凝素蛋白上的S-棕榈酸分子转换为含有生物素(Biotin)分子的标签。生物素标记蛋白经特异性富集、电泳分离纯化后,进行胶内水解。再利用质谱技术对水解混合物进行分析。结果表明,经酰基-生物素置换方法处理A型流感病毒裂解产物后,蛋白质耦联生物素的浓度(羟胺处理,+Hydroxylamine)与空白对照组(未加羟胺处理,-Hydroxylamine)的比值大于3;对经富集后的流感病毒血凝素蛋白进行了质谱分析,鉴定了A型的两个S-棕榈酰化修饰位点,分别位于蛋白羧基末端的Cys_(562)和Cys_(565)。本研究为大规模研究S-棕榈酰化修饰蛋白提供了一种特异、有效的分析方法。
- 王子健高祥杨静波孙万春吴东林彭其胜刘宁
- 关键词：流感病毒血凝素蛋白
