广东省自然科学基金(04020050)
- 作品数：14 被引量：126H指数：8
- 相关作者：石磊肖增璜苏健裕陈洵李心晖更多>>
- 相关机构：华南理工大学暨南大学附属第一医院四川大学更多>>
- 发文基金：广东省自然科学基金广州市科技计划项目教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学农业科学轻工技术与工程更多>>
- 不同地区铜绿假单胞菌第一类整合子和整合子相关基因盒的分布被引量：18
- 2006年
- 目的对石家庄、昆明两地分离的铜绿假单胞菌临床菌株进行第一类整合子的分布及整合子相关基因盒携带率的比较分析,探讨第一类整合子在两地菌株分布的差别。方法采用PCR方法筛选检测64株石家庄、昆明两地临床分离的铜绿假单胞菌第一类整合子和及其所携带的整合子相关基因盒。结果64株铜绿假单胞菌临床菌中共有43株为第一类整合子阳性菌(阳性率67.2%);其中石家庄菌株和昆明菌株阳性率分别为71.4%和64.3%,两地铜绿假单胞菌第一类整合子阳性率无显著性差异。第一类整合子阳性铜绿假单胞菌中,石家庄菌株和昆明菌株携带一类整合子相关基因盒的阳性率分别为80.0%和38.%,两地第一类整合子阳性菌中整合子相关基因盒的携带率具有显著性差异(P<0.01);两地菌株携带的基因盒大小不同。结论第一类整合子在铜绿假单胞菌临床菌株中广泛分布,环境的选择压力影响细菌整合子相关基因盒的分布。
- 杨维青石磊尹晓琳李心晖谢轶程曦曾蔚殷长甫贾文祥
- 关键词：铜绿假单胞菌
- 多重耐药临床菌株中整合子结构的检测与分析被引量：26
- 2007年
- 目的研究广州暨南大学附属第一医院2004年部分临床菌株样本的整合子及其基因盒的分布特性。方法多重PCR检测与细菌耐药关系密切的1、2、3类整合酶基因,进一步对阳性样本可变区的基因盒序列鉴定分析。结果随机抽取109株临床菌株,整合酶阳性检出率为97.2%(106/109),其中1类整合酶阳性菌100株(91.7%),2类整合酶阳性菌1株(0.92%),此外有5株(4.6%)同时检出1、2类整合酶,没有检测到3类整合酶;基因盒鉴定结果显示,插入基因盒以dfrA(甲氧苄氨嘧啶耐药相关)和aadA(氨基糖苷类耐药相关)基因家族为主,也在少数菌株中发现了aacA4、cmlA1、catB3以及sat1基因盒。其中又以dfrA12、orfF和aadA2组合最为常见,耐药基因盒PCR扩增片段为1913bp(64.6%);此外,还发现了同时存在两种整合子结构的菌株。结论整合子普遍存在于临床菌株中,可通过基因水平转移在不同菌属间传播,提示各医药单位必须加强耐药监测及合理选择抗菌药物,以减少多重耐药细菌的发生和发展。
- 石磊陈洵肖增璜
- 关键词：整合子整合酶细菌耐药临床分离株
- 定量分析铜绿假单胞菌第一类整合酶基因的表达被引量：6
- 2006年
- 目的整合子是具有整合和表达外来耐药性基因盒能力的基因元件,在细菌耐药性基因的积累和传递中起重要作用。本研究通过定量分析第一类整合子整合酶基因(intI1)在细菌不同生存状态的表达水平,探讨整合子的作用机制。方法培养和提取两株第一类整合子阳性铜绿假单胞菌的液相培养菌、生物被膜菌、被膜脱落菌等三种生长状态的总RNA,采用竞争RTP-CR方法定量检测菌体在以上三种状态下intI1m RNA的表达水平。结果铜绿假单胞菌的液相培养菌、生物被膜菌和被膜脱落菌都有intI1m RNA表达;两株菌在三种状态下intI1m RNA的表达量不同,其中生物被膜菌表达最高,被膜脱落菌次之,液相培养菌最低;生物被膜菌intI1m RNA的量较液相培养物高约15倍,较被膜脱落菌高约4倍。结论铜绿假单胞菌intI1在生物被膜中m RNA表达上调,随着菌体从被膜脱落以及菌体持续的液相培养intI1表达下调。提示整合子在生物被膜菌中可进行活跃的基因盒的捕获、移动和积累,有利于细菌耐药性的提高及扩散。
- 杨维青石磊谢轶苏建裕李心晖寇亚丽程曦曾蔚贾文祥
- 关键词：铜绿假单胞菌生物被膜整合子整合酶
- 铜绿假单胞菌基因型与生物被膜形成能力的分析被引量：2
- 2006年
- 通过改良的组织平板培养法及ERIC-PCR方法对48株PA生物被膜的形成进行定量分析并绘制其指纹图谱。结果发现48株PA菌株生物被膜形成能力不同,且在17%相似水平上分为A、B、C、D、E五个基因型,其中生物被膜形成能力较弱的菌株大多属于前三个基因型,而D和E基因型则包含了大部分生物被膜形成能力较强的菌株,这表明不同生物被膜形成能力的PA在5个基因型中的分布并非随机的,菌株生物被膜形成能力和基因型之间具有一定的相关性。
- 石磊寇娅丽
- 关键词：铜绿假单胞菌生物被膜基因型
- 致病菌耐药因子分布及特征分析被引量：1
- 2006年
- 目的对临床菌株中的整合子分布及其携带耐药基因盒的结构特征进行分析。方法应用多重PCR方法检测55株临床菌株中的3类整合酶基因intI,并对intI阳性菌株耐药基因盒进行测序及序列分析。结果55株临床菌株均为第1类整合酶基因阳性(100%)。耐药基因盒特异PCR扩增发现,27株革兰阳性菌株和22株革兰阴性菌株均得到1 913 bp的扩增产物,携带基因盒为dhfro、rfF和aadA 2;6株革兰阴性菌得到1 664 bp的产物,携带基因盒为aadA 5和dfr 17。aadA 2和aadA 5均为编码对氨基糖苷类抗生素产生耐药的基因盒,dhfr和dfr 17均为编码对磺胺类药物甲氧苄氨嘧啶产生耐药的基因盒;orfF为未知功能的开放阅读框。结论临床致病革兰阳性菌和革兰阴性菌株均广泛存在着整合子结构,应加强对耐药基因在细菌种属间水平转移的监测工作。
- 苏健裕石磊杨连生肖增璜邱春嫦付强郑美萍冯洁
- 关键词：整合子整合酶耐药基因盒
- PCR技术在金黄色葡萄球菌中的研究进展被引量：11
- 2008年
- 金黄色葡萄球菌是造成人类食物中毒的常见致病菌之一,对其进行检测与鉴定显得尤为重要。随着PCR技术的发展,金葡菌也得以深入研究。本文主要就应用于金黄色葡萄球菌的PCR技术进行简要综述。
- 张凤笑石磊
- 关键词：金黄色葡萄球菌PCR技术
- 沙门氏菌ERIC指纹分析被引量：7
- 2007年
- 在研究了沙门菌携带的第一类整合子的基因结构的基础上,采用ERIC-PCR方法对第一类整合子的阳性菌株进行基因指纹图谱分析。采用肠杆菌基因间重复一致序列PCR扩增的方法对两种不同血清型、整合子阴性与整合子阳性菌株研究基因指纹图谱,利用遗传距离矩阵,采用非加权配对法UPGMA法做遗传分析的树状图,进行指纹图谱分析。运用ERIC-PCR方法,可以将第一类整合子阴性、第一类整合子阳性菌株及其结构进行初步鉴定,同时对于两种不同的血清型也可以得到区分。ERIC可以作为第一类整合子阳性菌株及其相关血清型进行尝试性的鉴定方法,这对于研究整合子介导细菌耐药机制的特性具有重要意义。
- 张宏梅石磊李琳
- 关键词：ERIC整合酶沙门菌
- 大肠埃希菌中新的耐药基因盒aadA23的变异被引量：2
- 2005年
- 目的基于整合子-细菌耐药系统在细菌耐药机制中的重要作用,对成人腹泻患者的大肠埃希菌Ⅰ类整合子阳性菌株携带的耐药基因盒的基因特征进行分析。方法应用聚合酶链反应(PCR)检测Ⅰ类整合酶基因intI阳性菌株并对其整合的耐药基因进行测序及用生物信息软件对序列进行分析。结果5株Ⅰ类整合酶基因阳性菌株的耐药基因盒PCR扩增得到1009 bp的产物。序列分析结果表明,1009 bp序列含有780 bp的开放阅读框,与已知的aadA23和aadA21分别有99.6%和99.5%的相似性,与aadA5只有66.4%相似,为对氨基糖苷类抗菌药物壮观霉素、链霉素产生耐药的基因盒,建议命名为aadA23b。结论随着选择环境不同,整合子整合的基因盒会发生变异,提示我们要用分子生物学的手段从基因水平分析耐药基因的遗传与变异。
- 苏健裕石磊杨连生陈洵张婷寇娅丽
- 关键词：大肠埃希菌整合子类耐药基因盒
- 细菌耐药整合子intI分类的多重PCR方法的建立及应用被引量：15
- 2005年
- 目的建立快速筛选细菌耐药整合子的分类方法,并对21株来自临床的菌株进行整合子筛选和分类。方法根据G enB ank/EM BL内的第一、第二和第三类的整合酶序列,通过软件C lustalW的多重比对分析设计出各类整合子的特异性引物,用对照菌株建立多重PCR方法并对21株临床菌株进行PCR扩增,通过其PCR扩增产物片段大小的不同进行整合子分类。结果对照菌株实验结果显示,21株临床分离菌株中,15株在565bp处有扩增片段,即为含有第一类整合酶基因;4株在403bp处有扩增片段,即含有第二类整合酶基因;1株在565bp和403bp处均有扩增片段,提示其同时含有第一、二类整合酶基因;1株没有得到任何扩增片段,即不含有这三类整合酶基因;在被测菌株中未发现第三类整合酶基因的阳性菌株。结论本文报道的筛选细菌耐药整合酶基因分类的多重PCR方法效果良好,具有可行性,为更加全面细致研究整合子类型以及整合子介导的细菌耐药机制提供了一种简单易行、快捷有效的方法。
- 冯洁石磊肖增璜李琳陈洵苏健裕李心晖郑美萍邱春嫦付强
- 关键词：多重PCR整合子整合酶基因
- 整合子及相关基因盒在临床分离铜绿假单胞菌中的分布被引量：11
- 2006年
- 目的检测Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类整合子及Ⅰ类整合子相关基因盒在铜绿假单胞菌临床分离株中的分布,分析整合子对细菌耐药性的影响。方法用纸片法对62株临床分离铜绿假单胞菌进行药敏试验;应用多重PCR法检测62株铜绿假单胞菌Ⅰ类、Ⅱ类和Ⅲ类整合子;对Ⅰ类整合子阳性菌进行整合子相关基因盒检测。结果62株菌中有40株(64.5%)含有Ⅰ类整合子,1株(1.6%)含有Ⅱ类整合子;没有检测到Ⅲ类整合子阳性菌。在Ⅰ类整合子阳性菌中,有26株携带Ⅰ类整合子相关基因盒(65.0%);分离自同一科室的部分菌株携带大小相同的基因盒;Ⅰ类整合子阳性菌株的耐药率高于整合子阴性的菌株。结论Ⅰ类整合子及整合子相关基因盒在铜绿假单胞菌临床菌株中分布广泛,整合子在细菌耐药中发挥作用。
- 杨维青殷长甫石磊张永红谢立新高燕郝玉英杨丽军
- 关键词：铜绿假单胞菌整合子
