国家高技术研究发展计划(2006AA01A116) 作品数:22 被引量:65 H指数:4 相关作者: 迟学斌 郎显宇 胡永宏 陆忠华 徐晨 更多>> 相关机构: 中国科学院 深圳大学 中央财经大学 更多>> 发文基金: 国家高技术研究发展计划 广东省自然科学基金 国家自然科学基金 更多>> 相关领域: 自动化与计算机技术 经济管理 理学 电子电信 更多>>
InsPecT的千核并行及优化 2010年 蛋白质翻译后修饰(PTMs)在复杂的生命过程中起到极其重要的调控作用,对蛋白质翻译后修饰的研究是对蛋白质结构及其功能分析的深入,也是当前蛋白质组学的重要方向。InsPecT软件由于具备盲搜索功能,在蛋白质翻译后修饰鉴定领域备受关注,但极高的计算复杂度是阻碍其广泛应用的主要障碍。本文对InsPecT软件进行并行化,并在千核环境下进行测试;此外,还在负载平衡方面和GPU加速方面进行优化。结果显示,并行效率突出,加速效果显著。 涂强 郎显宇 陆忠华 迟学斌关键词:INSPECT 负载平衡 基于小波变换和自相关函数的基音频率检测算法 被引量:1 2009年 根据语音的基音频率较低这一特点,利用小波变换的滤波特性剔除了语音的高频部分,然后再利用计算速度较快的自相关函数法检测语音的基音频率,有效剔除了高频共振峰和噪音的影响,其估计基音频率准确性高,稳定性好,运算速度较快。实验结果表明,此方法是一种有效的基音频率检测算法。 李飞鹏 张维强 徐晨关键词:小波变换 自相关函数 基音频率 一种新的神经网络预失真器及其算法 2009年 针对高功率放大器(High Power Amplifier,HPA)的神经网络(Neural Network,NN)预失真器非直接学习方法中存在的预失真性能缺陷和直接学习方法中存在的计算复杂的弊端,本文基于非直接方法得到了HPA后逆滤波器的精确辨识,利用非线性算子的运算性质及一种近似方法分别推导出了新的NN预失真器学习结构及其相应的自适应算法。该算法由HPA的后逆滤波器辅助,直接产生HPA的前逆滤波器的输出。与直接学习方法相比,它大大简化了计算复杂度。仿真结果表明,本文提出的NN预失真器学习方法可以有效地改善非直接学习方法的预失真效果,进一步降低邻信道功率比约5dB。 崔华关键词:神经网络 预失真 超级计算环境计算配额系统设计和实现 被引量:6 2010年 在超级计算环境中,为避免计算资源滥用,确保每个用户有机会利用超级计算机求解生产、科研中的复杂问题,产出更多成果,在定期采集、解析作业日志的基础上,通过LSF API、shell编程,设计和实现了一套计算配额系统,用于对用户计算资源的配额、限制及使用情况统计分析。该系统已运行于中国科学院超级计算环境百万亿次超级计算机深腾7000中,效果良好。 牛铁 朱鹏 赵毅 曹宗雁关键词:LSF Mathematical Model for Amplitude distortion in Nonlinear HPA A piecewise mathematical expression with one parameter was proposed for the amplitude (AM) distortion in nonli... Hua Cui (School of Information Engineering关键词:HPA PREDISTORTER 分数阶Genesio系统的混沌同步 被引量:2 2008年 应用Pecora-Carroll(PC)方法和单向耦合方法研究了两个同一的分数阶Genesio系统的混沌同步问题.应用Laplace定理,得出了它们同步的充分条件,从理论上证明了这两个系统能够实现混沌同步;同时数值仿真验证了文中理论分析的有效性和可行性. 吴耿 丰建文 张维强关键词:分数阶 蛋白质序列及其翻译后修饰鉴定的盲搜索算法评价 2014年 蛋白质翻译后修饰鉴定是计算蛋白质科学的重要研究方向,研发速度快和精度高的鉴定算法及软件,是该方向的一个主要问题。本文回顾了蛋白质翻译后修饰鉴定的各类算法,并主要对蛋白质序列及其翻译后修饰鉴定的盲搜索算法和软件进行研究。通过对具有代表性的两个盲搜索软件InsPecT和SIMS,以及限定性搜索软件pFind的对比分析,对盲搜索算法在蛋白质序列及其翻译后修饰方面的瓶颈。 黄潘育 郎显宇 周纯葆 陆忠华关键词:蛋白质序列 翻译后修饰 沙尘暴数值预报模式CUACE-Dust的并行与优化 被引量:2 2010年 介绍了中国气象局成分中心发展的耦合于MM5的沙尘暴数值预报模式CUACE-Dust并行化及优化工作,该系统能减少运行时间,提高并行效率,确保了高分辨率业务预报的及时性.该系统目前已经通过了中国气象局业务化评估,用于气象局沙尘暴数值业务预报.同时,为了使用的便利性,通过编写脚本文件使多个程序实现了自动流程化运行.最后给出了一些测试结果,表明了工作的有效性. 姜金荣 张小曳 迟学斌 陆忠华关键词:沙尘暴 中尺度模式 高分辨率 TilingArray技术与应用研究进展 2008年 Tiling Array实验技术是从传统的微阵列(microarray)基因芯片技术发展而来,在Tiling Array新技术产生发展的5年间,它已经成为了全基因组生物信息挖掘的主要工具,其高密度、高通量的特性使人们可以从全基因组水平考察生命过程和探索生命奥秘.对Tiling Array技术和应用研究最新进展进行了较为详尽的描述,其中包括Tiling Array技术概述、Tiling Array应用研究、Tiling Array重要的实验和发现以及对这些发现做出所有可能性的预测和解释.除此之外,对Tiling Array表达信号识别算法进行了简明的概述,并对其中3种具有典型意义的算法给出了评价和比较. 郎显宇 王俊 迟学斌关键词:TILING ARRAY 生物信息学 高通量 信号识别 一种增强型的粒子群优化算法 被引量:2 2010年 针对粒子群优化算法在进化后期容易陷入局部最优的缺点,提出了一种增强型的粒子群优化算法,即当粒子陷入局部极值点时,从增强粒子的自我学习能力,增强种群中其他相关粒子探索新区域的能力和增强粒子之间的信息交流三个方面来增强算法的寻优能力。数值实验结果表明,新算法具有很好的寻优性能。 代军 李国 徐晨关键词:粒子群优化 群体智能 惯性权重 局部极值