国家西甜瓜产业技术体系建设专项(CARS-26-02)
- 作品数：25 被引量：207H指数：10
- 相关作者：栾非时高鹏朱子成王学征马鸿艳更多>>
- 相关机构：东北农业大学齐齐哈尔大学黑龙江省农业科学院更多>>
- 发文基金：国家西甜瓜产业技术体系建设专项国家自然科学基金引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 基于CAPS标记的西瓜果实与种子相关性状QTL分析被引量：11
- 2017年
- 【目的】基于西瓜全基因组重测序数据,挖掘SNP位点并将其转变为CAPS标记,构建遗传连锁图谱,对西瓜果实与种子相关性状进行QTL分析,为西瓜果实与种子相关性状主效基因精细定位及克隆奠定理论基础。【方法】以普通栽培西瓜品系(Citrullus lanatus ssp.vulgaris)‘W1-1’和黏籽西瓜品系(Citrullus lanatus ssp.mucosospermus)‘PI186490’为亲本杂交获得F_1代,以‘W1-1’为轮回亲本,构建BC_1P_1群体。采摘成熟果实,对每个西瓜果实中心及边缘可溶性固形物、中心及边缘果肉硬度、种子百粒重、种皮底色进行调查及数据分析。对亲本材料进行覆盖度约为20×的全基因组重测序,用BWA、SAMTOOLS及VCFTOOLS等软件比对并检测亲本材料在全基因组范围内的SNP位点。运用SNP2CAPS软件选择7种在西瓜基因组上具有丰富酶切位点的限制性内切酶,对包含SNP位点的序列进行酶切位点分析,转化CAPS标记。选取全基因组范围内均匀分布的450个CAPS分子标记,筛选多态性CAPS标记,对BC_1P_1群体内225株分别进行基因分型,使用QTL Ici Mapping及Windows QTL Cartographer V2.5等软件进行遗传图谱的构建和西瓜果实与种子相关性状的QTL分析。【结果】在两亲本间共获得SNP位点751 532个,根据7种限制性内切酶位点信息共开发了450个CAPS分子标记,筛选出其中具有多态性的200个CAPS标记,在225株BC1P1群体构建一张包含11个连锁群(分别对应11条染色体)的遗传连锁图谱,覆盖长度1 376.95 c M,标记间的平均遗传距离为6.88 c M。QTL分析定位到与果实与种子相关性状QTL位点15个,其中包括中心可溶性固形物含量相关位点3个(CTSS2.1、CTSS2.2、CTSS8.1);边缘可溶性固形物含量相关位点1个(ETSS2.1);中心果实硬度相关位点3个(CFF6.1、CFF6.2、CFF8.1);边缘果实硬度相关位点2个(EFF6.1、EFF6.2);种皮底色相关位点4个(SCC8.1、SCC8.2、SCC8.3、SCC8.4);种子百粒重相关位点2个(SH
- 迟莹莹高鹏朱子成栾非时李桂英于鹏
- 关键词：西瓜遗传连锁图谱CAPS
- 甜瓜白粉病抗性基因遗传及候选基因定位被引量：1
- 2019年
- 目的与意义:白粉病是甜瓜生产过程中的主要病害之一,在陆地和保护地均有发生,严重影响甜瓜的产量和品质,白粉病病原菌增殖快,传播迅速,防治困难.抗真菌药物不能完全抑制白粉病的发生,而且过多的施用会对环境造成危害.选育抗白粉病甜瓜品种是解决白粉病影响的重要方法.甜瓜白粉病存在多种病原真菌,并且存在多种生理小种,Podosphaera xanthii小种1是国内引发甜瓜白粉病的主要生理小种之一,明确Podosphaera xanthii小种1侵染条件下甜瓜白粉病抗病遗传机制、定位抗病基因,是进行甜瓜白粉病抗性分子标记辅助选择育种的重要研究基础.
- 崔浩楠高鹏(编译)李冰赵玉龙朱强龙张志鹏樊超樊超栾非时
- 关键词：甜瓜白粉病白粉病抗性基因定位基因遗传分子标记辅助选择育种生理小种
- 基于CAPS标记的西瓜遗传连锁图谱构建及3个性状定位分析
- 2019年
- 目的与意义:西瓜的果肉颜色、果皮条纹、果肉苦味是西瓜重要农艺性状,可直接影响消费者的选择.目前关于西瓜性状的QTL有很多,但对这3个性状的定位研究还不是很清晰.尤其是苦味性状,葫芦科(西瓜、甜瓜、苦瓜等)中苦味基因的分子标记和精细图谱的研究较少,相关研究报道较少或没有.因此笔者通过配制杂交组合,通过生物信息设计分析,建立了225株BC1分离株的遗传连锁图谱.通过对西瓜果肉颜色、果皮条纹、果肉苦味相关位点的数据挖掘,获得紧密连接的标记,希望为分子标记辅助育种提供理论依据.
- 孙蕾王学征(编译)张志鹏张亚楠邱果孙宇姣朱子成栾非时
- 关键词：CAPS标记遗传连锁图谱农艺性状西瓜分子标记辅助育种果肉颜色
- 黑龙江省瓜类白粉病菌IGS-RFLP分析被引量：2
- 2011年
- 应用通用引物对采自黑龙江省不同地区的甜瓜、黄瓜、南瓜和西瓜等16份瓜类白粉病菌进行转录基因间隔区(IGS)分析,结果表明不同菌株的IGS区存在长度异质性和数量多态性。应用MspⅠ、AsuⅠ、Hinp1Ⅰ3个限制性内切酶对IGS扩增产物进行酶切(IGS-RFLP),不同菌株的酶切位点不同,电泳后产生多样性丰富的图谱,成为菌株特有的DNA指纹。利用NTSYS-PC软件对IGS1-RFLP酶切图谱进行数据分析,各菌株之间遗传相似系数的变化幅度为0.4600～0.8000,表明白粉病菌间有丰富的遗传多样性,以遗传相似系数0.60为阈值,供试菌株可区分为3个类群。初步确定葫芦科白粉病菌致病性与DNA多态性不形成对应关系,菌株的遗传多样性与菌株地理来源、寄主来源及设施类型亦无明显的直接关系。
- 魏尊苗王学征高鹏栾非时
- 关键词：限制性内切酶
- 葫芦科作物线粒体和叶绿体基因组研究进展被引量：4
- 2016年
- 线粒体和叶绿体均是植物细胞生命活动中十分重要的细胞器,其基因组独立于核基因组,表现为半自主遗传特性。葫芦科作物线粒体是目前已知植物线粒体基因组中最大、最复杂的,而叶绿体基因组却相对保守。本文使用葫芦科作物中目前已测序的线粒体和叶绿体基因组序列,通过对葫芦科作物线粒体和叶绿体基因组的结构特点、基因含量、内含子、RNA编辑、重复序列、水平基因转移等方面比较分析,重点介绍了葫芦科甜瓜属线粒体基因组父系遗传研究进展和叶绿体基因组在葫芦科作物系统发育中的应用等热点问题,以期为更好地解析葫芦科作物线粒体和叶绿体基因组的进化、遗传方式差异等科学问题奠定基础。
- 朱强龙朱子成王鹏飞吕慧玲崔浩楠栾非时
- 关键词：葫芦科作物线粒体基因组叶绿体基因组
- 西瓜果实总糖含量QTL分析被引量：10
- 2013年
- 【目的】为了探讨西瓜果实中总糖含量的遗传规律并找到与总糖含量相关的QTL位点,【方法】以高糖品系‘花园母本’为母本,低糖品系‘LSW-177’为父本,配制杂交组合,构建含有180个单株的F2代群体,分别测量成熟西瓜果实中心和边缘部分果糖、蔗糖和葡萄糖含量,并将3者之和相加作为总糖含量进行遗传图谱构建及QTL分析。【结果】构建的遗传连锁图谱共包含45个SSR标记,分属于13个连锁群,覆盖基因组长度为547.3 cM,标记间平均距离为12.44 cM,检测到与中心和边缘总糖含量相关的QTL位点各一个,均为加性遗传效应,贡献率分别为6.56%、7.90%,分布在第3、12连锁群上,LOD值分别为3.1、3.29,找到与中心和边缘总糖含量紧密连锁的标记4个(MU8184-3、MCPI-12、TJ116、MU8558-3),该研究结果为进一步开展西瓜糖含量相关基因定位和克隆研究提供理论依据。【结论】西瓜果实总糖含量为数量性状遗传,由多基因共同控制,中心部分总糖含量QTL位点表现为正向加性效应,边缘部分总糖含量QTL位点表现为负向加性效应。
- 刘识王学征栾非时朱子成
- 关键词：西瓜总糖含量SSR标记QTL分析
- 甜瓜结实花初花节位QTL分析被引量：13
- 2011年
- 以WI998为母本（纯雌株、厚皮网纹甜瓜品系）,TopMark为父本（雄全同株纯合品系）,配置杂交组合,利用单粒传得到171个株系的重组自交系（F2S4）群体构建甜瓜SSR分子标记遗传连锁图谱。该连锁图谱包含19个连锁群,覆盖基因组长度为1414.2cM,标记间平均距离为10.2cM。对结实花初花节位开展QTL分析,共检测到9个QTL,分别分布在第1、9、10、11连锁群上,各QTL的LOD值在2.89~9.42之间,4个QTL贡献率超过10%。位于第9连锁群的QTLFp9.4贡献率最大,为18.57%（2010秋季LOD=9.17）;位于第9连锁群的Fp9.3（2010春季8.64%,LOD=6.44;2010秋季17.99%,LOD=9.42）,位于第10连锁群的Fp10.1（2010春季3.59%,LOD=2.89;2010秋季6.20%,LOD=3.43）在两季的位置都很稳定。获得与结实花初花节位紧密连锁（〈10cM）的8个特异标记（SSR01737、MU141991、TJ105、GCM206、SSR04910、MU173563、NR52、MU146331）,为进一步开展QTL精细定位提供参考。
- 朱子成高美玲高鹏栾非时
- 关键词：甜瓜SSR标记QTL
- 基于SSR标记的甜瓜品种(系)DNA指纹图谱库的构建被引量：61
- 2012年
- 【目的】建立甜瓜品种的DNA指纹图谱数据库,实现对甜瓜品种进行快速、准确的鉴定。【方法】应用SSR分子标记技术,首先利用20份具有代表性的甜瓜品种(系)筛选SSR引物,然后对105份不同甜瓜品种(系)进行指纹图谱的构建。【结果】从1 219对SSR引物中筛选出18对引物为105份材料形成了多态性的指纹图谱,其中每对引物可以检测到4—14条数目不等的多态性条带,平均为9条;多态性信息含量(PIC)平均为0.68,变化范围为0.55—0.82。105份材料间的相似系数为0.70—0.99。利用这18对SSR核心引物构建的指纹图谱库能够有效区分所有供试材料,并且为每份材料建立了一份独特的指纹图谱。【结论】SSR标记适于构建甜瓜品种(系)的DNA指纹图谱库,可为甜瓜品种鉴定提供依据。
- 宋海斌崔喜波马鸿艳朱子成栾非时
- 关键词：甜瓜指纹图谱SSR标记核心引物
- 西瓜遗传图谱的构建及果形指数QTL分析被引量：5
- 2013年
- 以圆球形西瓜品系花园母本为母本,椭圆形西瓜品系LSW-177为父本,配制杂交组合,构建由180个单株组成的F2群体,测量成熟西瓜的果实纵径、果实横径,并且通过果实的纵径与横径的比值得到果形指数,进行遗传图谱的构建及相关性状QTL分析。构建的连锁遗传图谱共含有45个SSR标记,分属13个连锁群。覆盖基因组长度为547.3cM,标记间平均距离为12.44cM,检测到与果形指数密切相关的QTL1个,并在遗传连锁图谱中将之命名为Fsi3.1,位于第三连锁群,位于标记MCPI-12和CMN05_69之间,贡献率为2.8%,加性效应负值,对减小果形指数表现为增效加性效应。
- 王兆吉高鹏栾非时刘识
- 关键词：西瓜果形指数SSR标记QTL分析
- 甜瓜果实相关性状QTL分析被引量：16
- 2017年
- 以美国厚皮甜瓜品系ms-5为母本,中国薄皮甜瓜品系HM-1为父本,配置杂交组合,构建含有189个单株的F2:3群体,对两亲本高通量重测序开发CAPS标记,构建包含159个标记、12个连锁群的遗传连锁图谱,该图谱覆盖基因组长度为1 771.53 cM,标记间平均距离为11.35 cM。应用复合区间作图法对甜瓜果实单果重、果实长、宽、果形指数、果肉厚度作QTL分析,共检测到与果实性状相关QTL位点18个,分布在第2、4、5、6和7染色体上,LOD值为2.82~18.78,可解释2.68%~79.40%表型变异率。检测到7个与果形指数相关QTL位点,分别为FS2.1、FS4.1、FS6.1、FS6.2、FS7.1、FS7.2、FS7.3,果形指数QTL位点FS6.1位于B0610和E0623两个标记之间,两标记间遗传距离为0.27 cM,LOD值为6.14,解释5.72%表型变异率,通过基因序列比对QTL FS6.1位于甜瓜基因组scaffold00027上,基因注释结果发现,该区域有26个候选基因。
- 栾非时矫士琦盛云燕朱子成
- 关键词：甜瓜果实性状CAPS遗传连锁图谱
