江西省教育厅科技计划项目(GJJ11646)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 相关作者：施绍萍邱建丁黄淑云更多>>
- 相关机构：南昌大学萍乡学院中国人民解放军南昌陆军学院更多>>
- 发文基金：江西省教育厅科技计划项目国家自然科学基金教育部“新世纪优秀人才支持计划”更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术更多>>
- 基于小波支持向量机预测蛋白质亚细胞定位研究
- 随着多物种基因组计划的实施,对基因序列表达产物的功能分析日益重要。蛋白质是基因功能的主要执行者,蕴含在基因序列中的密码往往通过蛋白质演绎出来。不同的蛋白质通常分布在细胞的不同部位,其功能与其空间定位密切相关,新合成的蛋白...
- 黄淑云孙兴玉梁汝萍邱建丁
- 关键词：SUBCELLULARWAVELETTRANSFORMVECTOR
- 基于信息熵和残基电荷性的酪氨酸硝基化位点预测
- 2012年
- 采用氨基酸残基信息熵优化窗口,结合氨基酸的电荷性构建了蛋白质酪氨酸硝基化位点的预测模型。基于10-倍交叉验证,该模型的预测准确率和马氏相关系数分别达到了84.80%和69.69%。同时,对信息熵优化窗口和传统连续窗口进行了探讨,结果表明,信息熵窗口能够有效捕获酪氨酸硝基化肽段上的重要位点,克服短肽序列易丢失信息而单纯增大肽段长度又会引入冗余信息的矛盾,并最终提高模型的预测性能。特征分析揭示酪氨酸残基的局部静电环境、邻近的进化保守位点和长程位点对酪氨酸硝基化均有重要影响。
- 施绍萍揭志勇邱建丁
- 关键词：信息熵
- 基于多特征融合预测蛋白甲基化位点的研究
- 蛋白质的甲基化是一种主要发生在赖氨酸或精氨酸侧链氨基上的重要翻译后修饰。在蛋白甲基转移酶催化下,赖氨酸残基能分别被单甲基化(me1)、双甲基化(me2)和三甲基化(me3),而精氨酸残基能够N~G-单甲基化、ω-N~GN...
- 施绍萍孙兴玉邱建丁
- 关键词：METHYLATIONPOSITIONWEIGHTAMINOVECTOR
- Tau蛋白丝氨酸磷酸化修饰位点的特征分析与识别被引量：2
- 2013年
- 基于信息熵,融合氨基酸的物理化学性质、蛋白质的二级结构和残基的无序信息构建了Tau蛋白丝氨酸磷酸化修饰位点预测的新模型。分别探讨了每种特征对Tau蛋白丝氨酸磷酸化修饰位点的影响,特征分析结果表明,氨基酸的序列模体、卷曲结构和无序区域均有助于识别丝氨酸磷酸化修饰位点。通过10倍交叉验证,丝氨酸磷酸化修饰位点预测的准确率和马氏相关系数分别达到83.7%和65.1%,表明本文构建的模型可用于对Tau蛋白丝氨酸磷酸化修饰位点的有效预测。
- 黄淑云施绍萍邱建丁
- 关键词：TAU蛋白丝氨酸磷酸化信息熵
