国家高技术研究发展计划(2011AA100104)
- 作品数:1 被引量:4H指数:1
- 相关作者:包曙光王锐王俊斌丁博李明更多>>
- 相关机构:天津农学院更多>>
- 发文基金:天津市应用基础与前沿技术研究计划项目国家高技术研究发展计划国家科技重大专项更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 小麦磷脂酶Dα的基因克隆及其编码序列的生物信息学分析被引量:4
- 2013年
- 为获得更多小麦抗逆基因资源,利用RT-PCR方法克隆了磷脂酶D基因(PLD),命名为TaPLDα,并对基因及其蛋白进行了生物信息学分析。结果表明,TaPLDα开放阅读框为2 394 bp,编码812个氨基酸残基,等电点5.30,分子量为92 kDa。序列分析显示,TaPLDα基因编码的氨基酸序列含有N端C2结构域及2个保守的活性中心。预测TaPLDα蛋白是一个亲水性稳定蛋白且定位于细胞质,其二级结构含28.82%的α-螺旋、20.07%的延伸链、6.03%的β-转角和45.07%的不规则卷曲。该蛋白不存在信号肽,无跨膜区。TaPLDα与水稻、玉米和拟南芥的PLDα氨基酸序列之间具有高度的保守性,进化分析显示,小麦PLDα序列与毒麦、水稻和玉米PLD序列亲缘关系密切。
- 王俊斌李明丁博包曙光王锐谢晓东
- 关键词:小麦基因克隆生物信息学