军队“十一五”科技攻关课题(08G034)
- 作品数:7 被引量:17H指数:3
- 相关作者:张富强张文东张应国范泉水赵焕云更多>>
- 相关机构:成都军区疾病预防控制中心云南省动物疫病预防控制中心云南农业大学更多>>
- 发文基金:军队“十一五”科技攻关课题公益性行业(农业)科研专项云南省科技攻关计划更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生更多>>
- 云南境外禽流感H5N1亚型病毒神经氨酸酶基因进化及分子结构特征分析
- 2010年
- 目的:禽流感病毒神经氨酸酶(NA)是病毒粒子重要表面抗原之一,其抗原性差异决定病毒神经氨酸酶亚型(N1-N9)的划分。NA介导病毒对敏感细胞的侵染及协助子代病毒粒子的成熟和释放,与病毒的宿主嗜性及毒力有关。方法:对2003~2009年期间采集自云南境外家禽的H5N1亚型阳性样品中病毒NA基因进行测序,并与国内外已知代表毒株进行序列比对及系统发育分析。认识云南境外禽流感H5N1亚型病毒神经氨酸酶(NA)基因分子结构特征。结果:21份代表性病毒样品NA基因核苷酸和氨基酸序列同源性介于94.3%~99.3%、93.1%~99.3%。系统发育分析表明可划分为6个不同进化(亚)分支(1、7、9、2.4、2.3.2、2.3.4),其中进化亚分支2.3.4毒株已成为当前云南境外流行的优势毒株;所有云南境外毒株NA蛋白的49-68位氨基酸均存在缺失。结论:糖基化位点存在特有变异;云南境外毒株对Oseltam ivir(达菲)类抗病毒药物可能无耐药性。
- 董波张文东宋建领赵焕云叶丛华田建国吕粤岳亮邱薇冯子良张思东苑述友范泉水张应国张富强
- 关键词:禽流感病毒H5N1亚型神经氨酸酶系统发育分子特征
- 云南边境H5N1亚型禽流感病毒聚合酶基因分子结构特征分析
- 2010年
- 2004~2009年期间在云南边境采集境外禽类样品560份,经RT-PCR及多重RT-PCR检测,检出10份H5N1亚型禽流感病毒阳性样品,对其聚合酶基因进行扩增,克隆至pMD18-T载体中进行测序,并与国内外已知参考毒株序列进行比对及系统发育分析。结果显示:云南边境H5N1亚型禽流感病毒可划分为5个进化(亚)分支,分别与标准毒株遗传关系密切,聚合酶基因与血凝素基因的进化分支划分结果存在差异。表明目前聚合酶基因的进化除了自发突变作用影响基因进化,同时聚合酶的进化途径在时间特征和区域特征方面与血凝素基因的进化有一定的关系。2004~2009年期间云南境外H5N1亚型禽流感病毒间具有遗传差异,进化分枝2.3.4毒株已成为当地流行的优势毒株,不同进化分枝或同一进化分枝不同毒株聚合酶基因氨基酸结构和糖基化位点均有改变。
- 齐绣花石凤海张文东叶丛化张富强宋建领董波张应国
- 关键词:禽流感病毒H5N1亚型聚合酶分子特征
- 云南边境地区登革1型病毒非结构蛋白编码区序列测定及进化分析
- 2010年
- 登革病毒有4个血清型,可引起登革热和登革出血热/登革休克综合征。登革病毒包括5’和3’非编码区(UTR)及一个单一的开放阅读框(ORF),该ORF编码一个聚蛋白前体,经蛋白酶裂解加工成3种结构蛋白(C、PrM和E)和7种非结构蛋白(NS1、NS2A、NS2B、NS3、NS4A、NS4B和NS5)。我国云南省边境与登革热流行区的缅甸和泰国等东南亚国家接壤,自然生态环境又与东南亚地区相似,
- 苑述友蔡学敏张富强邱薇李刚山刘华尹革芬李作生郑颖王双印张海林范泉水
- 关键词:非结构蛋白编码区进化分析
- 云南地区2006~2009年狂犬病毒分离株P和M基因分子进化分析
- 2010年
- 2006-2009年自云南曲靖(YNQJ07、YNQJ08)、昭通(YNZT07、YNZT09)、楚雄(YNMD06)、保山(YNTC06)、红河(YNHH09)、怒江(YNNJ08)分离获得8株狂犬病毒,对其P和M基因进行克隆、测序,并与已知国内外代表毒株进行比对及系统发育分析。结果:云南狂犬病毒P基因核苷酸与氨基酸序列同源性分别为84.8%-99.4%和90.6%-99.3%;M基因核苷酸与氨基酸序列同源性分别为88.7%-99.5%和94.3%-100%;它们均属于基因Ⅰ型毒株,存在2个进化亚组群(Ⅰ、Ⅲ);YNTC06与泰国和YN0601H、YN0701H毒株遗传关系密切,属于亚组群Ⅲ毒株;其余地州分离毒株均属于亚组群Ⅰ毒株,进一步可划分为2个不同进化亚分支,YNMD06属于分支Ⅰ,与近年江苏、安徽毒株遗传关系密切;分支Ⅱ包括YNQJ07、YNZT07、YNQJ08、YNNJ08、YNZT09、YNHH09,与湖南、贵州毒株遗传关系密切。亚组群Ⅰ毒株已成为当前我国狂犬病流行的优势毒株,亚组群Ⅰ的第Ⅱ分支毒株在云南省广泛分布。
- 程万明张文东赵焕云张应国张念祖范泉水苑述友张富强
- 关键词:狂犬病毒M基因P基因
- 云南省边境地区禽流感H5N1亚型病毒遗传多样性分析被引量:5
- 2012年
- 目的了解云南省边境地区禽流感H5N1亚型病毒遗传多样性。方法2009—2011年7月在云南省边境地区采集境外家禽和野生鸟类棉拭子样品,经H5/N1亚型特异性多重RT-PCR检测,阳性样品进行病毒HA基因扩增,克隆至pMDl8-T载体测序,并与已知参考毒株进行序列比对及系统发育分析。结果36份阳性样品病毒HA基因测序获得15种HA序列,存在2个不同进化分支(2.3.2、2.3.4),2.3.2进一步可划分为3个进化小分支(Ⅱ-1。Ⅱ-3),2.3.4进一步可划分为2个进化小分支(Ⅰ-1和Ⅰ-2)。2.3.2Ⅱ-1、Ⅱ-2毒株是新出现的H5N1亚型病毒变异株。结论2009—2011年7月云南省边境地区H5N1亚型病毒具有遗传多样性,病毒经历了多分支(2.3.2、2-3.4)至单一支(2.3.2)的进化过程。
- 张武林张文东赵焕云齐绣花胡挺松吕粤岳亮邱薇冯子良郑颖范泉水张应国贾杏林张富强
- 关键词:禽流感病毒H5N1亚型血凝素
- 2009甲型H1N1亚型流感病毒抗原性及遗传特性研究被引量:5
- 2009年
- 张文东张富强范泉水张应国邱薇冯子良郑颖王双印李刚山
- 关键词:甲型流感病毒H1N1亚型抗原性
- 云南省2006-2010年狂犬病病毒N和G基因分子结构特征分析被引量:7
- 2011年
- 目的了解云南省狂犬病毒的流行情况以及街毒株N、G基因结构特征,为有效控制狂犬病疫情提供初步科学依据。方法对云南省2006-2010年10株狂犬病街毒株N、G基因进行全基因克隆、测序,并与已知国内外代表毒株核苷酸及推导氨基酸进行序列比对及系统发育分析。结果序列分析表明所研究的10个云南毒株与Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅵ、Ⅶ型代表毒株N、G基因核苷酸序列同源性分别为72.1%~78.5%、58.4%~71.0%,与基因Ⅰ型毒株序列同源性为85.2%~90.1%、82.7~99.6%,云南毒株之间核苷酸序列同源性为89.3%~99.2%、86.0~99.6%。云南10个毒株均为基因Ⅰ型和血清1型毒株,分为2个进化分支,除YNTC06与GXN119和HM88单独属于分支Ⅲ外,其余云南毒株均分布在分支Ⅰ上,且进一步分为3个小亚分支。遗传进化分析表明,各毒株氨基酸位点均存在不同程度的变异,其中YNTC06在360、369、375等多个NP抗原位点存在变异;云南毒株在GP330、333位毒力决定位点未发生变异,均为强毒株。结论云南狂犬病毒属于基因Ⅰ型,存在2个分支;云南狂犬病毒NP和GP存在特异性氨基酸变异位点,其基因结构及变异、亚组群划分与地理位置无相关性。
- 张文东赵焕云吕粤程万明岳亮张应国张富强
- 关键词:狂犬病毒