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中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2-SW-233)

作品数：1 被引量：4H指数：1
相关作者：谭光明周幼英徐琳孙凝晖冯圣中更多>>
相关机构：中国科学院浙江大学中国科学院研究生院更多>>
发文基金：中国科学院知识创新工程重要方向项目国家自然科学基金更多>>
相关领域：自动化与计算机技术更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇自动化与计算...

主题

  • 1篇曙光4000...
  • 1篇批处理
  • 1篇集群
  • 1篇BLAST

机构

  • 1篇浙江大学
  • 1篇中国科学院
  • 1篇中国科学院研...

作者

  • 1篇冯圣中
  • 1篇孙凝晖
  • 1篇徐琳
  • 1篇周幼英
  • 1篇谭光明

传媒

  • 1篇计算机工程

年份

  • 1篇2006
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
基于曙光4000A的BLAST并行算法被引量：4
2006年
对BLAST启发式算法的实现做了优化:引入批处理的概念、并对整个库文件建立哈希表,实现了I/O延迟掩藏,提高了整个比对过程的速度,同时降低了内存消耗。优化的算法有利于并行化的实现:在并行系统中,将库文件广播到各个计算节点,由节点在局部分别建立哈希表。然后将查询文件分割发送到各个计算节点并行比对,计算结果可以在节点直接输出,不需要主结点收集,减少了通信开销。
谭光明徐琳周幼英冯圣中孙凝晖
关键词：BLAST批处理集群曙光4000A
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