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国家自然科学基金(81371875)
作品数:
5
被引量:32
H指数:4
相关作者:
李敏
李天铭
何磊
秦娟秀
龙璐
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上海交通大学医学院附属仁济医院
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医药卫生
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上海交通大学...
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作者
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李敏
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李天铭
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何磊
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秦娟秀
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戴颖欣
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刘倩
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上海地区成人患者肺炎链球菌分子流行病学的分析
被引量:6
2015年
目的研究上海地区成人患者分离的肺炎链球菌耐药、克隆分型、血清分型、毒力因子携带及生物膜形成等分子特征,为感染控制及治疗提供临床流行病学信息。方法收集2011年1月至2013年12月上海华山医院37株来自门诊和住院成人患者感染分离的非重复肺炎链球菌,用K-B纸片法或E-test法测定对9种常用抗生素(青霉素、万古霉素、红霉素、克林霉素、左氧氟沙星、头孢丙烯、头孢曲松、头孢囔肟、利奈唑胺)的敏感性;用PCR与肺炎链球菌荚膜型血清凝集法确定血清型;采用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法分析不同血清型菌株的基因组特征;采用多位点序列分型(MLST)方法进行克隆分型;采用半定量生物膜形成试验分析其生物膜形成。PCR和凝胶电泳法检测10个主要肺炎链球菌的毒力基因(ebpA、pspA、cps2A、lytA、nanA、pavA、piaA、ply、psaA、spxB)。采用Stata统计软件用Fisher’Sexacttest进行相关性统计。结果37株肺炎链球菌主要血清型包括19F(13.5%),23F(13.5%),14(10.8%),19A(10.8%),青霉素耐药的肺炎链球菌(PRSP)占64.9%。血清型19F、19A、23F与青霉素耐药有明显相关(X2=5.89,P=0.015)并且都是多重耐药菌(MDR)。克隆分型呈多态性,ST81、ST271对包括青霉素在内的抗生素耐药率较高(X2=4.57,P=0.033)。生物膜阳性与血清型19A(x2=5.55,P=0.018)、克隆型ST320(x2=4.33,P=0.037)有明显相关,与青霉素耐药等没有明显相关(f=0.16,P=0.686)。毒力基因检测中lytA、pavA、ply、psaA、spxB均阳性。结论成人肺炎链球菌青霉素耐药率呈上升趋势。特定的血清型、流行克隆分型与抗生素耐药密切相关,为感染控制提供依据。毒力因子PspA等将是未来研制新型疫苗降低肺炎链球菌感染的新型靶标。
蒋浩琴
陈明亮
李天铭
田月如
朱元军
刘红
李敏
关键词:
肺炎链球菌
血清分型
脉冲场
分子流行病学
金黄色葡萄球菌蛋白酶FtsH底物的鉴定
金黄色葡萄球菌属于革兰氏阳性菌,可引起从皮肤和软组织感染到败血症,肺炎,心内膜炎,和中毒性休克综合征等危及生命的感染,是一种重要的人类病原细菌[1]。Fts H家族是ATP依赖的金属蛋白酶[2],在金黄色葡萄球菌中,Ft...
刘倩
胡墨
Lei He
Won-sik Yeo
Hoonsik Cho
Tianming Li
Yuanjun Zhu
亚楠
刘小云
李敏
Taeok Bae
关键词:
蛋白质组学
质谱
金黄色葡萄球菌
FTSH
底物
文献传递
耐氟康唑白假丝酵母耐药相关基因表达研究
研究背景 由于器官移植、肿瘤化疗,大量广谱抗菌药物滥用以及糖皮质激素、免疫抑制剂的广泛应用等,临床真菌感染问题日趋严重,其中白假丝酵母感染率最高。目前治疗真菌感染的一线药物主要是氟康唑等三唑类药物,多种机制共同作用导致白...
戴颖欣
李敏
关键词:
白假丝酵母
氟康唑
耐药性
相关基因
过表达
MALDI-TOF MS 指纹图谱技术在病原微生物分型中的应用前景
被引量:11
2015年
对同一种属病原微生物进行准确、快速、灵敏地分型对追踪分子溯源、明确传播途径、了解菌株和临床表现之间的关系、探索致病机制和指导临床用药等具有非常重要的意义。近年来基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱( MALDI-TOF MS)以其快速、准确、重复性好、高通量等特点在微生物的鉴定、耐药性和毒力的监测中发挥越来越重要的作用。新的微生物分型方法MALDI-TOF MS指纹图谱分型法也随之诞生。该分型方法具有高通量、快速、易于标准化、费用低廉等特点,在病原微生物流行病学分析、医院感染控制、生物标志物研发等方面有广阔的应用前景。(中华检验医学杂志,2015,38:367-369)
秦娟秀
李敏
关键词:
蛋白质组学
微生物学技术
结核杆菌GpsI蛋白调控吡嗪酰胺耐药的分子机制研究
目的结核杆菌GpsI蛋白是本课题组通过连有吡嗪酰胺(PZA)活性形式——吡嗪酸(POA)的亲和色谱柱初筛到的PZA靶标,因此我们进一步通过对结核杆菌gpsI/Rv2783c基因进行药敏实验、临床突变筛选和体外蛋白活性监测...
何磊
刘倩
李天铭
王亚楠
洪旭芬
秦娟秀
戴颖欣
李敏
文献传递
探究金黄色葡萄球菌蛋白A在ST239持续性感染中的促进作用
目的 研究金黄色葡萄球菌蛋白A (SPA)在医院获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(HA-MRSA)ST239菌株的持续性感染中所起的促进作用的机制。方法 对临床常见的两种类型菌株HA-MRSA ST239和CAMRSA S...
洪旭芬
刘倩
王亚楠
李敏
关键词:
SPA
高通量测序技术用于肠道菌群结构与大肠癌发生关系的研究
被引量:5
2014年
大肠癌是威胁人类的第三大恶性肿瘤。除了遗传因素外,肠道菌群在大肠癌发生中也起着重要作用,并逐渐成为研究热点。高通量测序技术的发展解析了在大肠癌发生中肠道菌群结构变化的规律并找到潜在致病菌。本文总结了特定肠道细菌在大肠癌发展中可能的作用及其机制,解析了肠道菌群介导大肠癌的两种发病模型,并探讨了肠道菌群的高通量测序技术用于大肠癌疾病监测的可能性。
何磊
李敏
关键词:
结直肠肿瘤
胃肠道
微生物群
基于Pre—NAT全自动核酸提取平台的高敏HBVDNA检测性能评价
被引量:7
2015年
目的评价基于Pre—NAT全自动核酸提取系统的高敏HBV核酸定量试剂的检测性能。方法方法学性能验证。于2014年5月和7至9月分别在北京大学医学部病原生物学系实验室和上海交通大学医学院附属仁济医院检验科进行实验,采用HBVWHO标准品验证正确度与检测下限,A、B、c、D型标准血浆(6个浓度)重复检测验证精密度,高浓度HBV假病毒颗粒梯度稀释验证线性范围,以及144份临床血清评价与罗氏系统的相关性。结果正确度方面,该试剂在5个浓度水平的实测值与标准品理论值偏差均小于±0.35lgIU/ml(-0.17~0.32lgIU/ml)。精密度方面,A、B、C、D型标准血浆的检测重复性(CV)分别为:3.87%~6.32%、0.45%-14.68%、0.16%~8.36%、0.64%-13.01%;中间精密度(CV)分别为:5.67%-9.69%、1.28%~15.68%、0.36%~9.05%、1.69%-13.65%。线性范围评价显示在20~1×10^10IU/ml范围内呈良好的线性关系(r=0.998,P〈0.001)。检测下限验证结果,20IU/ml浓度水平检出率5/5。临床标本检测中,与国际通用Roche试剂符合率为100%(144/144);104份阳性标本两者数据显著相关(r=0.984,P〈0.0001)。结论该高敏HBVDNA检测的正确度、精密度、检测下限和线性范围均表现良好,并与Roche试剂有良好相关性,有一定临床应用价值。
陈小颖
龙璐
李琼
高见
李天铭
黄向博
何磊
陈香梅
李敏
沈弢
关键词:
DNA病毒
实时聚合酶链反应
感染性疾病患者白假丝酵母菌分子特征分析和生物膜表型研究
被引量:3
2016年
目的探讨感染性疾病患者白假丝酵母菌分子分型和系统进化,并进行菌株生物膜表型分析。方法选择2006至2011年上海市公共卫生临床中心92例感染性疾病患者(病毒性肝炎、结核、HIV感染者)血液、穿刺液和黏膜等部位分离鉴定的104株白假丝酵母菌菌株,采用国际通用的多位点序列分型(MLST)进行克隆株的鉴定分型和进化研究。选用甲基四氮盐代谢实验(XTF)筛选强生物膜形成能力菌株。实验结果选用Kruskal—Wallistest非参数检验统计分析。结果104株白假丝酵母菌菌株共检测出63个二倍体基因型(DST),其中41(65.1%)个DST型在MIST数据库中未曾报道,同时发现8个新等位基因型。在这104株菌中,94.2%的菌株聚集在全球MLST数据库18个已知的进化枝中的14个分枝上,进化枝1中包含最多数量的菌株,占26.9%。41个新的DST型菌株中86%的菌株聚集在18个已知的进化枝中的11个进化枝上。生物膜形成能力试验共筛选出16株高生物膜形成能力菌株,菌株的生物膜形成能力在不同的生理解剖部位差异有统计学意义(H=18.23,P=0.0326),导管分离的菌株生物膜形成能力明显高于血液分离的菌株(Z=-72.20,P〈0.001)。白假丝酵母菌的分子分型与菌株的生物膜形成能力有相关性(H=10.01,P=0.0185)。结论遗传和表型分析结果显示感染性疾病患者白假丝酵母菌呈分散性分布,无明显的克隆传播流行的特点。菌株的分离部位、基因型与高生物膜表型相关。
胡绿荫
邱建萍
张蓓
胡香南
宰淑蓓
郑江花
李敏
关键词:
念珠菌
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