国家公益性行业科研专项(201205021)
- 作品数：1 被引量：4H指数：1
- 相关作者：康骊王佩熊钢王晓清周先文更多>>
- 相关机构：福建省水产研究所湖南生物机电职业技术学院湖南农业大学更多>>
- 发文基金：湖南省教育厅科研基金湖南省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 泥东风螺EST-SSR开发及其群体遗传多样性分析被引量：4
- 2020年
- 本研究采用MISA软件分析泥东风螺(Babylonia lutosa)转录组中微卫星信息。结果显示,从转录组中共获得16324个SSR,共有181种重复基元;泥东风螺转录组中不同类型微卫星的重复基元具有不同的分布特征,其中,二核苷酸重复基元中AC/GT(70.58%)重复基元以重复6次出现频率占优;长度为12~20 bp的SSR占63.95%,长度为21~25 bp的SSR占9.14%,总体的平均长度为18.4 bp。随机选取其中50条序列设计引物,通过对福建野生泥东风螺群体(WP)DNA样本进行PCR扩增和分型,结果获得23个多态性位点,等位基因数目为2~7个不等,期望杂合度(Ne)为0.190~0.937,观察杂合度(No)为0.065~0.936,多态性信息含量(PIC)为0.061~0.777,有4个位点显著偏离哈迪温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)(P<0.05)。对野生群体和养殖群体(BP)遗传多样性分析显示,野生群体和养殖群体的平均Ne分别为0.491和0.544,平均No分别为0.477和0.564,平均PIC分别为0.541和0.407。Fis结果显示,野生群体和养殖群体分别有13个和9个位点杂合子过剩。群体间遗传分化指数(Fst)为0.001~0.655,平均值为0.053(0.05
- 熊钢王晓清王佩陈贞年周先文康骊康骊
- 关键词：泥东风螺转录组EST-SSR
