湖南省卫生厅重点课题(2001-Z05) 作品数:13 被引量:11 H指数:2 相关作者: 曾桥 肖建华 万志刚 张愉快 杨秋林 更多>> 相关机构: 南华大学 更多>> 发文基金: 湖南省卫生厅重点课题 湖南省教育厅重点项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
日本血吸虫7个基因全长cDNA的获取和分析 2004年 目的 从日本血吸虫成虫cDNA文库中分离、鉴定和分析全长cDNA序列 ,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点。方法 从构建日本血吸虫成虫cDNA文库中挑取重组阳性克隆进行 5’测序获取表达序列标签 (ExpressedSe quenceTag ,EST) ,在此基础上进行引物延伸法 (primerextension)测序 ,直至获取全长cDNA序列 ,将获取的基因登录Gen Bank ,并进行生物信息学分析。结果 获得 7个日本血吸虫全长cDNA序列 (GenBank登录号分别为AY336 4 93~AY336 4 99) ,其中 6个为日本血吸虫新基因 :类转录因子BTF3(similartotranscriptionfactorBTF3)、延长因子 1-α(elongationfactor 1-alpha ,EF1-α)、富含谷氨酰胺四联重复肽 (smallglutamine-richtetratricopeptide ,TRP)、鸟氨酸氨基转移酶 (ornithineaminotransferase,OA)、内皮差异相关因子 1(endothelialdifferentiation -relatedfactor 1,EDF - 1)和类基因转录增强因子 (similartotestisenhancedgenetranscriptprotein ,TEGT) ;另 1个是精氨酸酶 (arginase)基因 ,比原发现的基因序列长 4 5 6bp。生物信息学分析发现类基因转录增强因子为跨膜蛋白 ,具有 6个跨膜区 ;各基因与人、鼠、蟾和曼氏血吸虫等物种的基因有 37%~ 85 %的同源性 ; 曾桥 肖建华 万志刚 张愉快 廖力 刘传爱 杨秋林关键词:日本血吸虫 CDNA文库 基因 生物信息学 日本血吸虫睾丸增强转录蛋白样蛋白基因的获得和分析 2004年 目的 从日本血吸虫 (Schistosomajaponicum ,Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新的蛋白基因 ,为日本血吸虫病的防治提供侯选疫苗和药物靶点。 方法 构建日本血吸虫成虫cDNA文库 ,随机挑取重组阳性克隆进行测序 ,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA ,登录GenBank ,利用BLAST程序对同源性高的基因进行核苷酸和氨基酸水平的同源性比较 ;并利用 pcgene软件对其蛋白质结构进行初步分析。 结果 获得了 1个日本血吸虫新基因睾丸增强转录蛋白样蛋白 (testis -enhancedtranscriptprotein -likeprotein ,AY3 3 64 99) ,长 10 5 3bp ,编码 2 19个氨基酸 ,与睾丸增强转录蛋白样蛋白具有 5 5 %的同源性 ,编码蛋白的理论分子量为 7.2 198KDa ,等电点为 9.12 ;抗原表位可能位于cDNA序列 3 73~ 3 96处。 结论 步移法测序和生物信息学技术相结合有利于发现日本血吸虫新基因。 张愉快 肖建华 刘彦 曾桥 汪志刚 曾谷清关键词:日本血吸虫 CDNA文库 生物信息学 基因 日本血吸虫pcDNA3.1(-)/Sj20.8真核表达及其对小鼠保护性免疫作用 被引量:1 2006年 为检测日本血吸虫新基因Sj20.8作为核酸疫苗能否诱导小鼠产生保护性免疫作用,用PCR法扩增Sj20.8基因序列,构建重组质粒pcDNA3.1(-)/Sj20.8,肌肉注射免疫小鼠后检测发现,Sj20.8能在小鼠肌肉中短时间存在并有微弱表达,但未能诱导小鼠产生一定水平的保护性免疫。 曾桥 肖建华 万志刚 廖力 张愉快 刘传爱 杨秋林关键词:日本血吸虫 CDNA文库 日本血吸虫肌动蛋白轻链基因的获得和分析 被引量:2 2004年 目的运用表达序列标签(expressedsequencetag,EST)技术,从日本血吸虫成虫cDNA文库中筛选和鉴定日本血吸虫新基因,为寻找日本血吸虫新的候选疫苗奠定基础。方法转化日本血吸虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,获得EST;用NCBI站点的GenBank对所获得的新基因序列进行同源性检索;利用BLAST程序对同源性高的基因进行核苷酸和氨基酸水平的同源性比较;并利用pcgene软件对其蛋白质结构进行初步分析。结果发现xzw00081克隆的cDNA序列为日本血吸虫新基因并获得GenBank登录号(AY225851)。该cDNA序列与曼氏血吸虫肌动蛋白轻链基因高度同源,核苷酸水平的同源性为84%;氨基酸水平的同源性为86%;编码蛋白的理论相对分子质量为1053888,等电点为696;抗原表位可能位于氨基酸序列158~184处。结论用EST寻找日本血吸虫新基因是一种可行的方法,所筛选到的日本血吸虫新基因长374bp,编码88个氨基酸,与曼氏血吸虫肌动蛋白轻链基因高度同源,为进一步研究该基因的全序列及功能作准备。 刘彦 肖建华 廖力 曾桥 张愉快 曾谷清关键词:日本血吸虫 表达序列标签 日本血吸虫乳酸脱氢酶基因的获得和序列分析 被引量:2 2004年 目的 从日本血吸虫 (Schistosomajaponicum ,Sj)成虫cDNA文库中筛选日本血吸虫新基因 ,为日本血吸虫病的诊断或防治提供靶抗原。 方法 筛选日本血吸虫成虫cDNA文库 ,随机挑取重组阳性克隆进行DNA测序 ,再对新基因序列进行步移法测序获取全长cDNA ,并利用生物信息学技术对其进行分析。 结果 获得了 1个新基因 ,其cDNA全长 12 5 1bp(AY2 2 5 190 ) ,编码 3 3 1个氨基酸 ,编码蛋白与人类或螈、蟾蜍、鸡、鼠及猪等其它生物的乳酸脱氢酶高度同源。 结论 利用表达序列标签法、步移法测序和生物信息学技术三者相结合 ,成功获得了编码日本血吸虫乳酸脱氢酶基因的cDNA全长序列。 刘传爱 肖建华 梁瑜 曾桥 万志刚 杨秋林关键词:日本血吸虫 乳酸脱氢酶 表达序列标签 生物信息学 日本血吸虫表达序列标签的获取和分析 被引量:2 2004年 目的 运用表达序列标签 (expressedsequencetag,EST)技术 ,从日本血吸虫成虫cDNA文库中分离、鉴定和分析表达基因序列 ,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点。方法 构建日本血吸虫成虫cDNA文库 ,随机挑取重组阳性克隆进行测序 ,将获取的EST登录GenBank ,并进行生物信息学分析。结果 随机挑取 382个阳性克隆进行测序 ,获得 1 49个EST(登录号分别为 :CA747382~CA747391 ,BU91 70 5 5~BU91 70 5 8,CA30 5 30 7~CA30 5 30 9,BU5 81 980 ,BU5 82 4 0 0~BU5 82 4 0 3,BU66690 6和CA9465 4 8~CA946666) ,同源性比较发现 ,部分序列与血吸虫的生活史的不同阶段和不同性别序列有一定的同源性。结论 EST技术有助于快速、经济地获取和研究日本血吸虫表达基因。 曾桥 肖建华 万志刚 张愉快 刘传爱 杨秋林关键词:CDNA文库 表达序列标签 日本血吸虫核苷二磷酸激酶基因的获得和序列分析 2004年 目的 从日本血吸虫 (Schistosomajaponicum ,Sj)成虫cDNA文库中筛选日本血吸虫新基因 ,为日本血吸虫病的防治提供药物靶标或候选疫苗。方法 筛选日本血吸虫成虫cDNA文库 ,随机挑取重组阳性克隆进行DNA测序 ,再对新基因序列进行步移法测序获取全长cDNA ,并利用生物信息学技术对其进行分析。结果 获得了 1个编码日本血吸虫核苷二磷酸激酶新基因的cDNA序列(AY2 2 6980 ) ,全长 5 94bp ,编码 1 5 7个氨基酸 ,编码蛋白与人类或鸽、鸡、鼠及果蝇的核苷二磷酸激酶高度同源。结论 利用表达序列标签法、步移法测序和生物信息学技术三者相结合 ,成功获得了编码日本血吸虫核苷二磷酸激酶基因的cDNA序列。 张愉快 肖建华 梁瑜 曾桥 万志刚 廖力关键词:日本血吸虫 二磷酸核苷激酶 CDNA文库 表达序列标签 生物信息学 日本血吸虫大陆株泛蛋白缀合酶E(SjUCEE)基因的A-T克隆 2004年 目的 日本血吸虫中国大陆株泛蛋白缀合酶 E (ubiquitin- conjugating enzyme E ,Sj UCEE)的基因克隆和鉴定。方法 特定寡核苷酸引物 PCR扩增目的基因 ;应用分子克隆常规操作方法将扩增产物克隆至载体 pu Cm - T中。结果 PCR特异性扩增出 Sj UCEE编码区基因序列 ,其片段大小为 75 7bp;经酶切、PCR及测序鉴定表明所构建的质粒 pu Cm - T/Sj UCEE中含有所扩增的基因序列。结论 PCR扩增的 Sj U CEE抗原编码区基因序列与预期长度相符合 ,成功构建了含目的基因的原核质粒 pu Cm- T/Sj U 廖力 肖建华 刘彦 曾桥 万志刚 曾谷清关键词:日本血吸虫 PCR 基因克隆 日本血吸虫新基因BBC1的获得和分析 2004年 目的 从日本血吸虫 (Schistosomajaponicum ,Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新的蛋白基因 ,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点。方法 构建日本血吸虫成虫cDNA文库 ,挑取重组阳性克隆进行测序 ,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA ,并进行生物信息学分析和登录。结果 获得了 1个日本血吸虫新基因 -BBC1基因 (AY2 2 0 747) ,长 62 3bp ,编码 1 84个氨基酸 ,其编码蛋白的理论分子量为 60 .8kDa ,等电点为 5 .1 3。结论 步移法测序和生物信息学技术相结合有利于发现日本血吸虫新基因。 万志刚 肖建华 曾桥 杨秋林 张愉快 杨胜关键词:日本血吸虫 CDNA文库 生物信息学 日本血吸虫普遍性结合酶E基因的获得和分析 被引量:1 2004年 目的 从日本血吸虫 (Schistosoma japonicum)成虫 c DN A文库中获得并分析日本血吸虫新基因 ,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点。方法 构建日本血吸虫成虫 c DN A文库 ,随机挑取重组阳性克隆进行测序 ,对部分序列进行步移法测序获取全长 c DN A,登录 Gen Bank,利用 BL AST程序对同源性高的基因进行核苷酸和氨基酸水平的同源性比较 ;并利用 pcgene软件对其蛋白质结构进行初步分析。结果 获得了 1个日本血吸虫新基因普遍性结合酶 E基因(ubiquitin- conjugating enzyme E,AY2 5 16 0 8) ,长 85 4 bp,编码 14 9个氨基酸 ,与人类普遍性结合酶 E具有 5 5的同源性 ,编码蛋白的理论分子量为 7.14 98k Da,等电点为 8.0 1;抗原表位可能位于氨基酸序列 373~ 396处。结论 步移法测序和生物信息学技术相结合有利于发现日本血吸虫新基因。 廖力 肖建华 刘彦 曾桥 万志刚 曾谷清关键词:日本血吸虫 CDNA文库 生物信息学 基因