国家自然科学基金(30370071)
- 作品数:9 被引量:24H指数:3
- 相关作者:郭晓奎姜叙诚杨宏亮何平徐静更多>>
- 相关机构:上海第二医科大学上海交通大学中国医学科学院北京协和医学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 钩端螺旋体OmpL1抗原表位预测、克隆和表达被引量:3
- 2005年
- 目的 应用生物信息学方法预测钩体外膜蛋白OmpL1的表位 ,结合基因工程手段进行表位重组、表达和分离纯化。方法 用预测程序ProPred和ANTIGENIC预测OmpL1的表位 ,PCR合成重组表位基因片段 ,克隆PCR产物构建表达质粒 pGEX/Omp Omp ,测序验证。对含有该质粒的大肠杆菌BL2 1(DE3)进行诱导表达 ,表达产物westernblot分析并纯化融合蛋白。结果 预测到 2个既具有MHC结合肽特性又具有B细胞表位特征的肽段。重组表位基因序列与理论设计完全一致。IPTG诱导BL2 1(DE3)中高效表达Mr约 30 0 0 0的融合蛋白 ,纯化后蛋白纯度 >90 %。结论 成功构建原核表达质粒pGEX/Omp Omp ,并进行含重组表位的GST融合蛋白的分离纯化 ,为OmpL1的表位研究和应用于亚单位疫苗奠定了基础。
- 杨榆玲褚嘉祐郭晓奎石铁流黄小琴俞建昆
- 关键词:OMPL1抗原表位钩端螺旋体
- 问号钩端螺旋体基因组DNA芯片的研制
- 2006年
- 目的研制并初步评估问号钩端螺旋体(简称钩体)赖型赖株的基因组DNA芯片。方法利用Primegens引物设计软件筛选出问号钩体赖型赖株全基因组中的特异性基因进行引物设计。对成功设计出相应引物的3 290个基因用聚合酶链反应方法进行扩增,以纯化后的产物点样制备芯片。并用双色荧光杂交策略对芯片质量进行了初步平估。结果共获得3 290个基因产物用于点样。参考株自身杂交实验结果表明:该芯片有较高的点一致性、信噪比和较低的假阳性率。结论成功制备了包含问号钩体赖型赖株3 290个目的基因的基因组DNA芯片,并可用于基于该芯片的问号钩体比较基因组学的研究。
- 盛跃颖史耀舟何平杨杨胡宝瑜赵国屏郭晓奎
- 关键词:问号钩端螺旋体
- RNA介导的致病菌毒力基因表达调控
- 2006年
- 李萍秦金红郭晓奎
- 关键词:基因表达调控毒力因子致病菌人类疾病毒力基因
- 问号钩端螺旋体全基因组的更新注释被引量:3
- 2004年
- 目的对问号钩端螺旋体黄疸出血群赖型赖株全基因组数据库中未注释的基因进行重新注释,并寻找可能的新致病基因。方法将钩端螺旋体黄疸出血群赖型赖株全基因组数据库中功能未知的编码序列(CDSs)在BLASTP/NCBI数据库中比较,初步预测基因功能,对可能的致病基因及其编码产物运用多种生物学软件进行深入分析。结果未知CDSs中有82个与NCBI数据库中的编码蛋白序列有很高的同源性,其中LA0063和LA3291编码金属蛋白酶,可能与致病有关。结论通过钩端螺旋体黄疸出血群赖株全基因组数据库中功能未知的CDSs进行定期比对,可以不断完善该数据库的功能注释,同时可以发现新的致病基因,有助于钩端螺旋体病致病机理的最终阐明。
- 宋卫峰赵蔚郭晓奎
- 关键词:问号钩端螺旋体基因组皮肤破损染色体
- 钩端螺旋体基因组学研究进展被引量:5
- 2005年
- 郭晓奎
- 关键词:钩端螺旋体钩体病基因组学研究苍白密螺旋体自然疫源性疾病伯氏疏螺旋体
- 逆向疫苗学及其应用
- 2006年
- 钟怡何平杨宏亮郭晓奎
- 关键词:亚单位疫苗重组蛋白疫苗减毒活疫苗实验室环境牛痘疫苗病毒疫苗
- 钩端螺旋体致病机制的研究进展被引量:3
- 2006年
- 钩端螺旋体病是一种由致病性钩端螺旋体感染引起的人兽共患病。感染者有多种临床表现,其中重者表现为致死性肺弥漫性出血。目前,钩端螺旋体所引起出血的机制仍未被阐明。本文就近年来对钩体致病物质及其相关作用机制的研究状况作了概述。
- 徐静郭晓奎姜叙诚
- 关键词:钩端螺旋体致病机制人兽共患病
- 问号钩体(Leptospira interrogans)Ⅲ型分泌系统相关基因分析被引量:1
- 2006年
- 根据鼠疫耶尔森菌Ⅲ型分泌系统和大肠杆菌鞭毛系统中已知蛋白,以NCB I/B last软件搜索问号钩体全基因组中与之高度同源的蛋白;用TMHMM-2.0对所得蛋白跨膜区进行分析;用In terpro对所得蛋白结构域进行分析,初步整理出问号钩体Ⅲ型分泌系统组成,发现10个被注释为鞭毛系统的相关基因和Ⅲ型分泌系统有关,并和鼠疫耶尔森菌Ⅲ型分泌系统相关蛋白有较高同源性。6个为跨内膜蛋白,4个为胞内蛋白,并共同组成Ⅲ型分泌系统的内膜孔道,但没能发现组成外膜孔道的蛋白组分。问号钩体Ⅲ型分泌系统与鞭毛组装系统共用相同的部分组分,但钩体Ⅲ型分泌系统和经典Ⅲ型分泌系统有一定程度的差别:它缺乏外膜孔道结构,且分泌产物先进入胞周间隙。
- 丁希喆李文俊杨宏亮郭晓奎姜叙诚