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国家自然科学基金(31270697)

作品数:21 被引量:138H指数:6
相关作者:詹亚光王海燕梁楠松于磊赵兴堂更多>>
相关机构:东北林业大学北京林业大学中国林业科学研究院资源信息研究所更多>>
发文基金:国家自然科学基金国家科技支撑计划国家林业公益性行业科研专项更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 21篇期刊文章
  • 1篇学位论文
  • 1篇会议论文

领域

  • 22篇农业科学
  • 3篇生物学

主题

  • 13篇水曲柳
  • 13篇曲柳
  • 9篇基因
  • 6篇生物信息
  • 5篇生物信息学
  • 4篇生物信息学分...
  • 4篇转录
  • 4篇转录因子
  • 4篇克隆
  • 3篇土壤
  • 3篇土壤因子
  • 3篇胁迫
  • 3篇节律
  • 3篇基因表达
  • 3篇基因克隆
  • 2篇同源性
  • 2篇同源性分析
  • 2篇启动子
  • 2篇净初级生产力
  • 2篇激素

机构

  • 13篇东北林业大学
  • 5篇北京林业大学
  • 2篇中国林业科学...
  • 1篇国家林业局
  • 1篇吉林省和龙林...

作者

  • 11篇詹亚光
  • 5篇梁楠松
  • 5篇王海燕
  • 5篇于磊
  • 4篇王岳
  • 4篇曾凡锁
  • 4篇赵兴堂
  • 3篇李旭
  • 3篇何之龙
  • 3篇何丽鸿
  • 3篇刘春浩
  • 2篇王璇
  • 2篇雷相东
  • 2篇何利明
  • 2篇刘颖
  • 2篇孙爽
  • 1篇刘玲
  • 1篇曾伟生
  • 1篇李卫松
  • 1篇朱珠

传媒

  • 3篇北京林业大学...
  • 3篇安徽农业科学
  • 3篇植物研究
  • 2篇Journa...
  • 2篇植物生理学报
  • 1篇林业科技
  • 1篇东北林业大学...
  • 1篇世界林业研究
  • 1篇广西植物
  • 1篇应用生态学报
  • 1篇林业科学研究
  • 1篇核农学报
  • 1篇福建农林大学...

年份

  • 1篇2021
  • 3篇2019
  • 2篇2018
  • 2篇2017
  • 4篇2016
  • 6篇2015
  • 4篇2014
  • 1篇2013
21 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
水曲柳结构域重新甲基化酶DRM基因片段的克隆及同源性分析被引量:1
2013年
[目的]克隆并分析水曲柳结构域重新甲基化酶(DRM)基因片段。[方法]根据GenBank上已发表的DRM氨基酸序列,采取CODEHOP方法设计合成1对简并引物,采用RT-PCR技术对水曲柳DRM基因进行扩增,将PCR产物与pMD 18-T连接后转化至E.coli JM109感受态细胞,检测阳性克隆,测序并进行序列分析。[结果]克隆得到的DRM基因cDNA序列长802 bp,由267个氨基酸残基组成,命名为FmadrmA。序列比对表明FmadrmA与参考的12个物种的DRM在氨基酸水平上表现出较高的同源性,其与山葡萄、番茄、黄瓜、野草莓、大豆、苜蓿、玉米、烟草、拟南芥、毛果杨、水稻和乌拉尔图小麦的DRM同源性分别为61%、54%、51%、50%、60%、48%、43%、44%、37%、42%、42%和39%。系统进化树分析表明同源的DRM蛋白可大致聚为3类,而水曲柳与其他植物的亲缘关系较远。[结论]该试验成功获得了水曲柳FmadrmA基因片段,并对其进行了同源性分析,为进一步研究结构域重新甲基化酶基因及分析其表达特性奠定了基础。
曾凡锁梁楠松王璇詹亚光
关键词:水曲柳
Molecular cloning and expression under abiotic stresses and hormones of the ethylene response factor Ⅶ gene FmRAP2.12 from Fraxinus mandshurica被引量:3
2019年
RELATED TO AP2.12(RAP2.12)is one of the Ethylene Response Factors(ERF)transcription factor and plays a key role in controlling plant root bending and responding to multiple abiotic stresses including hypoxia stress.In this study,FmRAP2.12 gene was isolated and characterized from Fraxinus mandshurica Rupr.The open reading frame(ORF)of FmRAP2.12 was 1170 bp and encoded a protein of 389 amino acids.The conserved domains,three-dimensional phylogenetic relationship of FmRAP2.12 was also investigated.Quantitative real-time(qRT-PCR)analyzed the expression of FmRAP2.12 in different tissues.The expression level of FmRAP2.12 was highest in roots followed by leaves,and lowest in male flowers.Abiotic stress and hormone signal-induced expression was established using qRT-PCR.Salt stress induced FmRAP2.12 to a double peak pattern:the first peak value was at 6 h and the second at 72 h.Drought stress also induced FmRAP2.12 to a double peak pattern:the first at6 h and the second at 48 h.FmRAP2.12 was up-regulated after initiation of gibberellic acid(GA3)treatment,with a one peak pattern at 24 h.FmRAP2.12 may not respond to cold stress and Abscisic acid(ABA)treatment.The transient overexpression of FmRAP2.12 caused the up-expression of downstream key genes of abiotic stress response and gibberellin pathway.Our research reveals the molecular characteristic and expression patterns under abiotic stress and hormone condition of FmRAP2.12,providing support for the genetic improvement of F.mandshurica at a molecular level.
Nansong LiangLei YuChunhao LiuZiqing WangXingtang ZhaoYaguang Zhan
关键词:GENECLONEGENEFRAXINUS
水曲柳SnRK2B基因和启动子的克隆及分析被引量:4
2016年
为了研究水曲柳中同源SnRK2转录因子的功能,在水曲柳干旱响应转录组中寻得SnRK2B的同源序列并克隆得到SnRK2B转录因子基因全长,将其命名为FmSnRK2B。使用SiteFinding-PCR法扩增获得SnRK2B启动子序列,并对FmSnRK2B基因编码区及其启动子进行生物信息学分析和启动子顺式调控元件分析。结果表明,克隆得到的全长序列包含完整的开放阅读框1074bp,编码357个氨基酸。启动子顺式作用元件分析结果表明,其启动子区包含脱落酸应答元件ABRE及胁迫相关元件HSE、MBS等。干旱胁迫下,FmSnRK2B基因的表达随胁迫时间的延长先增加后降低,表明其参与植株的抗逆过程。本研究对进一步揭示水曲柳的抗逆机制具有重要意义。
张秋博何之龙詹亚光梁楠松曹羊
关键词:生物信息学分析水曲柳
水曲柳CBF1基因的克隆及表达分析被引量:2
2015年
[目的]探讨水曲柳CBF基因的表达及与生物钟调控的关系。[方法]利用c DNA末端快速克隆(RACE)技术克隆水曲柳CBF1基因的全长序列,并对三年生水曲柳幼苗叶片中Fm CBF1基因的时间表达特征进行初步研究。[结果]利用RNA末端快速扩增(RACE)的方法从水曲柳中克隆得到1个CBF基因家族成员Fm CBF1(Gen Bank:KJ541508.1),该基因ORF 669bp,推测编码蛋白质含有222个氨基酸残基,相对分子质量24.5 k D,理论等电点为5.11,在DNA序列内不含内含子。氨基酸序列同源性比较发现,水曲柳Fm CBF1基因与白桦Bp CBF1同源性最高,相似性达79.4%,在系统进化树中处于同一分支上。实时荧光定量PCR表达特性分析显示,Fm CBF1基因的表达具有一个大约以24 h为周期的节律性,最大值约出现在9:00,而夜间却处于较低的表达水平。在4℃低温处理1、3、6、12、24、72和120 h后Fm CBF1的qRT-PCR分析表明,该基因受到低温诱导,并在4℃条件下随低温时间的延长,该基因的诱导表达特性呈先升后降的趋势,最大值出现在12h时,达对照的25.5倍。[结论]为进一步研究水曲柳抗旱耐寒性及分子育种奠定基础。
何之龙詹亚光曾凡锁
关键词:水曲柳基因克隆CBF昼夜节律
水曲柳丙二烯氧化物合成酶基因FmAOS序列与表达模式分析被引量:4
2018年
茉莉酸(jasmonic acid,JA)作为一种重要的信号分子参与了植物的生长发育过程,JA生物合成途径中的关键酶为丙二烯氧化物合成酶(allene oxide synthase,AOS)。本研究克隆了水曲柳(Fraxinus mandschurica)AOS基因,命名为Fm AOS。生物信息学分析表明该基因全长1 605 bp,具有完整的开放阅读框,编码534个氨基酸。Fm AOS为两性不稳定性蛋白,不存在信号肽,具有跨膜能力,亚细胞定位预测其存在于叶绿体中。三维建模分析表明该蛋白属于混和型。Fm AOS表达模式分析表明,其响应了寒冷、Na Cl、干旱等非生物胁迫及脱落酸(ABA)、赤霉素(GA3)等植物激素信号,但表达模式各不相同,说明Fm AOS参与了植物的生长发育和逆境胁迫的平衡。本文为Fm AOS功能的深入研究提供参考。
刘春浩梁楠松于磊于磊曹羊赵兴堂
关键词:水曲柳AOS生物信息学分析
水曲柳节律基因LHY启动子的克隆和功能分析被引量:4
2014年
以水曲柳基因组DNA为模板,用Site Finding-PCR法扩增得到节律基因LHY(late elongated hypocotyl)启动子序列,长度为1 360 bp。PLACE启动子预测工具分析表明,序列中含有转录必备的TATA box、CAAT box以及一些非生物胁迫和激素响应元件等。构建植物GFP瞬时表达载体p PXGFP-P-LHY,农杆菌介导转化烟草叶片和白桦悬浮细胞,GFP检测结果表明,LHY启动子能够启动GFP基因在烟草和白桦细胞中表达,且对非生物胁迫(低温、高温、盐)产生响应;构建植物GUS报告基因整合表达载体p PCXGUS-P-LHY,农杆菌介导法瞬时转化烟草,GUS染色结果表明,LHY启动子的活性具有不同程度的时空特性。
王璇曾凡锁詹亚光何之龙
关键词:LHY启动子克隆
水曲柳TCP4转录因子克隆及胁迫和激素下的表达分析被引量:21
2017年
TCP转录因子家族是植物特异的一类调控生长发育和逆境胁迫的重要转录因子。本文揭示了水曲柳FmTCP4在非生物胁迫及激素信号诱导调控的表达特征,为该基因在水曲柳中调控生长发育以及逆境胁迫响应功能的研究奠定基础。通过前期研究克隆获得了水曲柳TCP4基因序列,并命名为FmTCP4,应用生物信息学软件对水曲柳FmTCP4基因的分子结构特征进行了分析,利用4℃低温、盐(Na Cl)以及干旱(PEG6000)进行非生物胁迫处理,利用脱落酸(ABA)和赤霉素(GA3)进行激素信号诱导,分析FmTCP4基因的表达特征。生物信息学分析表明该基因全长1 251 bp,具有完整的开放阅读框,编码416个氨基酸。FmTCP4具有螺旋-环-螺旋结构,为亲水性的不稳定蛋白,不存在信号肽,具有跨膜能力,亚细胞定位预测存在于细胞核中,并在细胞质到细胞核的调控中起作用。同源序列比对结果表明,FmTCP4与芝麻、烟草等物种的同源蛋白序列相比具有很高的同源性。非生物胁迫处理后,FmTCP4的表达量随处理时间而改变,但其变化趋势不同,表明FmTCP4明显响应了这3种非生物胁迫。激素信号诱导结果表明,外源植物激素调控了FmTCP4基因的表达,基因表达量相对于对照组具有显著性差异。非生物胁迫和激素信号诱导下的基因表达分析表明,FmTCP4响应了寒冷、盐、干旱等非生物胁迫以及激素信号,说明其参与了植物的生长发育和逆境胁迫的平衡。
刘春浩梁楠松于磊赵兴堂刘颖孙爽王紫晴詹亚光
关键词:水曲柳生物信息分析
土壤养分因子对蒙古栎林优势木生长的影响被引量:5
2015年
为研究土壤因子对优势木生长的影响,以60块蒙古栎林样地为研究对象,运用6种曲线模型和多元线性回归的方法建立了以表层土壤养分因子为自变量,以样地内优势木树高、胸径、材积为因变量的优势木生长模型。结果表明,优势木平均胸径和树高间相关关系不显著,而与土壤因子中的p H值、有效磷、全钾质量分数显著相关,并得到优势木平均胸径与土壤因子的3个曲线方程。运用多元逐步回归方法,仅土壤有效磷质量分数进入模型。综合曲线模型和线性回归模型发现,胸径生长与土壤养分质量分数相关关系呈现分段趋势;当胸径大于27cm时,土壤有效磷对胸径的影响明显减小。
王岳王海燕李旭何丽鸿李卫松
关键词:优势木土壤因子蒙古栎林
水曲柳节律相关GIGANTEA基因的克隆及同源性比对分析
2014年
[目的]对水曲柳节律相关GIGANTEA基因的克隆及同源性进行比对分析。[方法]根据GenBank中GI基因保守结构域设计简并引物,进行PCR分析,并与其他物种的氨基酸序列进行同源性比对分析。[结果]获得了编码区780 bp的部分序列,可以编码260个氨基酸,获得的GI基因命名为FmGI,与多个物种GI基因有着较高的同源性,其中与葡萄、大豆、苜蓿、毛果杨、蓖麻、黄瓜、菊花、大麦、玉米、小麦、拟南芥、黑麦草、洋葱和云杉等多个物种具有较高一致性。系统发育树分析结果表明,GI基因按照单子叶植物、双子叶植物和裸子植物的进化关系聚为3类,明确了水曲柳GI基因的系统进化关系。[结论]该方法对水曲柳生物节律钟GI基因编码区进行了克隆,并对获得的部分GI蛋白序列进行了同源性比对分析,建立了系统进化树,为进一步获得水曲柳GI基因全长及研究其功能起到一定参考作用。
苏秋钰方传雷曹羊李明莉曾凡锁
关键词:生物节律光周期同源性分析系统进化树
土壤因子对立地生产力的影响定量研究进展
2015年
地位指数法是目前应用最广泛的评价立地生产力的方法,但对它与土壤因子的关系研究得较少。将土壤因子定量引入基于地位指数的生长模型,可直观地反映土壤对树木生长的影响。文中对国内外基于地位指数表达的立地生产力与土壤因子的关系研究所涉及的模型和方法进行了总结归纳,以期为立地生产力评价和土壤管理提供借鉴。
王岳王海燕李旭
关键词:土壤因子立地生产力
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