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丙型肝炎病毒高变区1氨基酸序列差异与丙型肝炎患者生化指标间的相关性分析: 2013年; 目的研究丙型肝炎高变区1(HCV HVR1)氨基酸序列间的差异性以及此差异与生化指标间的相关性。方法以81例丙型肝炎患者氨基酸序列为材料,按照序列同源性进行分组,利用序列对比方法分析氨基酸的变异规律,同时利用生物信息学的手段分析氨基酸序列与丙型肝炎生化指标间的相关性。结果 HCV HVR1氨基酸序列保守性差,其中aa17、aa21的芳香氨基酸丰度高;各个生化指标与序列差异具有一定的相关性,在各组中相关性不尽相同。结论在病理变化过程中,生化指标的改变不可作为患者体内丙型肝炎病毒氨基酸序列发生变异的标志指标。; 迟淑萍由莉越张诗龙刘军吴素体孙杰周婷婷杜丽程云; 关键词：氨基酸序列丙型肝炎病毒生化指标

丙型肝炎病毒高变区1模拟表位7肽对LPS刺激RAW264.7细胞炎症因子影响的研究被引量：2: 2013年; 目的观察丙型肝炎病毒(HCV)高变区1(HVR1)模拟表位7肽(7P)对内毒素/脂多糖(LPS)诱导的小鼠单核/巨噬细胞株(RAW264.7)细胞释放细胞因子的影响。方法体外培养小鼠RAW264.7细胞,用LPS刺激小鼠RAW264.7细胞分泌TNF-α、IL-6,用不同浓度(5.0、10.0、20.0、40.0、80.0、160.0μg/mL)的7P进行干预,应用单溶液细胞增殖(MTS)法检测7P对细胞活力的影响,应用酶联免疫吸附实验(ELISA)法检测细胞培养上清中促炎细胞因子的含量。结果 7P可抑制LPS刺激小鼠RAW264.7细胞释放TNF-α和IL-6,并呈一定的量效关系,其影响细胞因子释放作用与细胞毒作用无关。结论 7P呈浓度依赖性地抑制LPS刺激小鼠RAW264.7细胞释放TNF-α和IL-6。; 迟淑萍张诗龙陈红鸽刘军孙杰由莉越杜丽程云; 关键词：模拟表位肿瘤坏死因子Α 白细胞介素-6

基于数据挖掘的丙型肝炎患者氨基酸序列与TNF-α间的规律性研究被引量：1: 2012年; 目的研究丙型肝炎患者的丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)高度可变区1(hypervariable region 1,HVR1)各位点氨基酸(amino acid,AA)的极性及带电情况与TNF-α表达量之间的规律性。方法根据样本聚类结果,以HCV的HVR1区域各位点氨基酸的极性及带电情况作为属性,对数据集进行规则挖掘。结果当aa5为极性不带电氨基酸时,TNF-α表达量下调;当aa5为非极性氨基酸,aa16为极性不带电氨基酸时,TNF-α上调。当aa5和aa16为非极性氨基酸,aa10为极性不带电氨基酸时,TNF-α上调。当aa5、aa16和aa10为非极性氨基酸时,aa19不带电,则TNF-α下调;aa19带电则TNF-α上调。结论丙型肝炎患者HCV的HVR1区域氨基酸的极性及带电情况与TNF-α的表达量之间具有一定的规律性。; 由莉越周婷婷迟淑萍孙杰陈红鸽赵庆国刘军程云; 关键词：数据挖掘丙型肝炎 TNF-Α 氨基酸序列

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国家科技重大专项(2009ZX09102-001)