云南省应用基础研究计划面上项目(2006C0034M)
- 作品数：42 被引量：238H指数：11
- 相关作者：苗永旺霍金龙袁峰刘丽仙钱林东更多>>
- 相关机构：云南农业大学云南大学云南农业职业技术学院更多>>
- 发文基金：云南省应用基础研究基金云南省应用基础研究计划面上项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学理学更多>>
- 牛α_(S1)酪蛋白基因变异及其与生产性状的关系被引量：6
- 2009年
- αS1酪蛋白是牛乳中含量最高的蛋白,其基因的多态类型会影响奶牛的产奶性状和牛乳的一些加工特性,人们已经对其进行了广泛研究。牛αS1酪蛋白基因编码区全长17 508 bp(不计启动子序列),由19个外显子和18个内含子构成,外显子与内含子长度比例为1∶14.4。尽管其编码区突变率较高,但侧翼序列比较保守。到目前为止,牛αS1酪蛋白共发现有9种变异体,由核苷酸非同义替换、插入或缺失及外显子跳跃造成。牛αS1酪蛋白蛋白质序列及DNA序列的高度差异性揭示其编码基因可能是一个高速进化的基因家族。αS1酪蛋白基因与泌乳性状之间的关联性可以用基因调控区,特别是转录因子结合位点存在突变位点来解释。但是,有关牛αS1酪蛋白基因变异体还存在一些未探明的结果,因此,阐明其基因的结构特点并进一步揭示它们与生产性状之间的关系是非常必要的。
- 祁宏苗永旺
- 关键词：变异体多态性生产性状
- 利用微卫星DNA标记分析槟榔江水牛群体遗传特征被引量：6
- 2011年
- 槟榔江水牛是近年在我国云南西部发现的第一个本土河流型水牛。为了揭示其群体遗传多样性、群体遗传组成、其与河流型和沼泽型水牛的遗传关系及沼泽型水牛对该水牛的基因渗入等重要遗传背景信息,本研究采用30个微卫星DNA标记对141份槟榔江水牛样品和对照群体24份河流型水牛(摩拉水牛)样品、41份沼泽型水牛(滇东南水牛)样品进行了检测分析。结果,在槟榔江水牛群体中共检测到253个等位基因,其中,54个为3个群体所共享的等位基因,58个为只在槟榔江水牛与摩拉水牛间共享的等位基因,73个为只在槟榔江水牛与滇东南水牛间共享的等位基因,其余68个等位基因为该群体所独有。槟榔江水牛平均等位基因数、平均表观杂合度、平均期望杂合度和多态信息含量等参数均显著高于对照组群体,分别为8.433 3、0.640 5、0.600 9和0.594 7。该水牛群体近交系数FIS值为0.061 9。槟榔江水牛与摩拉水牛间的DA遗传距离为最小(0.114 4),在NJ树上聚为一支;而滇东南水牛与槟榔江水牛和摩拉水牛间的遗传距离较大(分别为0.382 9和0.555 3),其在NJ树上单独聚为一支。群体遗传结构分析显示,槟榔江水牛遗传组分为河流型与沼泽型2种类型水牛混合的模式(当K=2时),整个群体中有相当数量的个体存在沼泽型水牛的遗传渗入(群体中沼泽型水牛遗传组分为0.067 2)。结果揭示,槟榔江水牛遗传资源独特,群体遗传多样性丰富,但该群体杂合子缺乏,且存在一定沼泽型水牛的基因渗入。
- 刘伟苗永旺李大林唐贺张慧芳章纯熙
- 关键词：槟榔江水牛微卫星DNA标记基因渗入
- 奶牛乳腺炎抗性候选基因多态性研究进展被引量：2
- 2011年
- 奶牛的乳腺炎是一种极其复杂的疾病,是影响奶牛产业发展的一个重要因素。对奶牛乳腺炎抗性的研究有助于选育出有高抗性的奶牛群体,提高奶产品的数量和质量,并且可以减少抗生素的使用。近年来,随着生物信息学、分子育种技术和基因组学的发展,为奶牛的乳腺炎抗病育种提供的新的前景。本文主要介绍了牛锌指蛋白313基因、前脑锌指蛋白基因、TLR4基因、TLR2基因、乳铁蛋白基因、趋化因子受体基因、热休克蛋白70的研究现状。
- 魏伟苗永旺
- 关键词：奶牛乳腺炎抗性候选基因多态性
- 利用微卫星DNA标记进行黄牛的亲子鉴定被引量：13
- 2010年
- 亲子鉴定在畜牧业生产中具有重要实际应用价值,常见其用于建立准确的系谱档案和家畜归属的诉讼案件。其中标准的三联体(即在母子关系是已知的情况下,鉴定假设父亲与子畜是否有亲生关系)和单亲[即父子(女)或母子(女)亲生关系的确定]两种情况下的亲子鉴定在畜牧生产中具有普遍意义。以云南文山黄牛为试验材料,采用10对常染色体微卫星DNA标记对这两种情况下的亲子关系进行了检测分析。结果表明,常染色体微卫星DNA标记在标准的三联体和单亲两种情况下都能用来进行亲子鉴定,结果较准确,但标准三联体情况下的亲子鉴定更准确。确定的不同模式下亲子鉴定的方法,可为家养动物亲子鉴定标准方法和流程的建立提供依据。
- 钱林东张自芳田应华袁峰钱坤苗永旺
- 关键词：DNA标记微卫星DNA亲子鉴定
- 牛科物种FSHβ基因外显子1和外显子2遗传特征分析被引量：3
- 2013年
- 促卵泡素(follicle-stimulating hormone,FSH)对刺激动物卵泡发育和促进精子生成具有重要作用,但有关牛科物种FSH基因的群体遗传特征还不十分清楚。本文针对FSHβ基因外显子1和外显子2,采用PCR-SS-CP结合PCR产物直接测序技术对353头水牛(来自11个水牛群体)、30头牦牛和30头大额牛样品进行了群体变异检测,并结合NCBI数据库中已发表的普通牛、山羊和绵羊等物种同源序列进行了群体遗传和生物信息学分析。在FSHβ基因外显子1中,水牛中发现1个核苷酸替换和1个缺失,即c.-49A>G和c.-31delG;其中,SNP-49在河流型和沼泽型水牛中均存在,等位基因c.-49A为优势等位基因,而c.-31delG只存在于沼泽型水牛中,且为杂合状态,基因频率为0.077。在牦牛外显子1中检测到c.-37G>A和c.-12T>C替换,且为连锁遗传的,而在大额牛外显子1中未检测到SNP位点。在FSHβ基因外显子2中,水牛中发现c.132G>A替换,该位点在河流型和沼泽型水牛均存在,但等位基因频率在两类水牛间不一致。在牦牛外显子2中检测到c.9C>T和c.21C>T替换,该替换也存在于普通牛中;大额牛外显子2为单态,未见SNP位点。生物信息学分析显示,在一些牛科物种FSHβ基因外显子2中发现的SNP位点均为同义替换,揭示了其序列的高度保守性。在牛科物种中,山羊和绵羊FSHβ基因第36位密码子编码氨基酸与其他物种不同,可作为区分它们的遗传标记。
- 哈福李大林袁跃云吴志勇袁峰霍金龙苗永旺
- 关键词：促卵泡激素PCR-SSCP
- 华坪乌骨鸡遗传资源调查与种质特性评价被引量：6
- 2012年
- 华坪乌骨鸡主要分布在云南省华坪县,是在金沙江河谷南亚热带燥热气候条件下,经过当地居民长期选育形成的地方优良鸡种,属西南山地乌骨鸡类型,肉蛋兼用。本次遗传资源调查和种质特性测定表明,该鸡体格较大,单冠、常羽,以皮、肉、骨"三乌"为其主要特征。在农户散养的条件下,具有较好的产肉性能,肌肉营养丰富,蛋品质和产蛋性能较好。该鸡对当地生态环境有良好的适应性,具有耐粗饲、抗病性强等优良特性。但该鸡群体中羽色类型较多,各观测指标整齐度差。本文结果揭示华坪乌骨鸡具有优良的种质特征,但其选育程度不高,属地方原始鸡种。
- 杨永军段国军田仁明倪有崇李其原杨洪孙国庆苗永旺
- 关键词：遗传资源种质特性
- 云南中甸牦牛的遗传多样性研究被引量：11
- 2009年
- 中旬牦牛是产于滇西北高原的地方品种，为了从分子水平阐明其种质特性，以对其有效保护提供遗传学依据，本研究利用分布在黄牛15条染色体上的15个微卫星标记对中旬牦牛45个样品进行了群体遗传变异分析。共检测到62个等位基因，每个座位的等位基因数从2到6不等，有效等位基因数在1．8243～4．4800，平均每个座位等位基因数4．1333±0．8338个，有效等位基因数3．3645±0．7474个，群体平均表观杂合度、期望杂合度及平均多态信息含量分别为0．9599±0．0973、0．6852±0．0879和0．6311±0．1057。结果表明，中旬牦牛群体遗传变异丰富。
- 田应华钱林东凌军刘丽仙霍金龙祁宏苗永旺
- 关键词：中甸牦牛微卫星标记杂合度多态信息含量
- 福安水牛线粒体DNA D-loop区遗传多样性分析被引量：11
- 2010年
- 采用PCR产物直接测序的方法对20头福安水牛的线粒体DNA(mtDNA)D-LOOP区全序列进行了测定,并对所得数据进行了比对和分析。结果共检测到16种单倍型,48个核苷酸多态位点,其中单一变异位点9个,简约信息位点39个。在所分析的序列中,T,C,A和G的平均含量分别为27.9%,25.6%,31.9%和14.6%,核苷酸多样度为0.019 46±0.002 88,单倍型多样度为0.957±0.032,序列间平均核苷酸差异数是17.238,结果显示福安水牛线粒体DNA遗传多样性丰富。系统发育和遗传距离分析显示:福安水牛与河流型水牛存在较大差异,其自身聚为支持率极高的两大支,即世系A和世系B,揭示福安水牛存在两个母系血统来源。
- 张瑞光梁建平陈云林斌陈诚苗永旺
- 关键词：福安水牛MTDNAD-LOOP遗传多态性遗传分化
- 利用细胞色素b(Cyt b)基因分析绿孔雀和蓝孔雀的遗传分化被引量：1
- 2009年
- 采用PCR产物直接测序法测定了10只绿孔雀和5只蓝孔雀的mtDNA细胞色素b基因516 bp序列,结合已发表的孔雀细胞色素b基因序列数据进行了序列比较分析;以雉鸡和家鸡的同源序列为外群,采用NJ法和ME构建了系统发育树。结果表明蓝孔雀群体内遗传差异程度低于绿孔雀,绿孔雀和蓝孔雀之间的核苷酸差异的平均数为21.417,净遗传距离为0.039±0.01,推断出绿孔雀与蓝孔雀的分化时间至少为2.96百万年,从而在分子水平揭示出绿孔雀和蓝孔雀属于两个不同的物种。重建的系统树将所有序列聚为支持率较高的绿孔雀与蓝孔雀2大类群,显示云南的绿孔雀至少存在两种类型,且这两种类型可能达到了亚种分化水平,而白孔雀和杂色孔雀在分类上则属于蓝孔雀类群。
- 欧阳依娜杨泽宇李大林霍金龙钱坤苗永旺
- 关键词：绿孔雀蓝孔雀遗传分化细胞色素B基因系统进化
- 动物溶菌酶基因的研究进展被引量：6
- 2012年
- 溶菌酶[Lysozyme(EC3.2.1.17),LYZ]是机体先天免疫系统中一个重要的效应分子,参与机体多种免疫反应,在溶菌过程中形成一个水解体系,破坏和消除侵入动物体内的病原,从而实现机体的免疫防御。它可以有效抑制葡萄球菌、大肠杆菌等一系列病原菌,是重要的奶牛乳房炎抗性因子之一。本文综述了溶菌酶基因的研究进展,包括其结构与进化、变异及应用前景等。
- 孙国庆哈福苗永旺李大林
- 关键词：溶菌酶基因多态性乳房炎
