国家自然科学基金(30771903)
- 作品数:6 被引量:19H指数:3
- 相关作者:卢亦愚冯燕钟淑玲徐昌平徐琦更多>>
- 相关机构:浙江省疾病预防控制中心浙江大学宁波市疾病预防控制中心更多>>
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- 浙江省2007年至2014年麻疹发病率的地理-人口因素分析
- 2017年
- 随着麻疹疫苗接种率的提高,麻疹发病率迅速下降。2000年美国宣布消除麻疹,但2013年仍然发现187例麻疹病例,2014年骤增至667例。2015年我国麻疹发病数为42361例,发病率为31.019/1000000,这与WH0制定的消除麻疹的目标相距甚远。麻疹的流行与否直接取决于当地的麻疹疫苗接种率。有研究显示,在麻疹疫苗覆盖率为80%~90%时,一个群落的人口规模与麻疹发病率之间呈正相关,
- 胡浙芳何立莫世华卢亦愚
- 关键词:麻疹病例发病率人口因素疫苗接种率地理人口规模
- 浙江省1999-2008年麻疹病毒流行株磷蛋白基因变异研究被引量:1
- 2010年
- 目的 了解浙江省麻疹病毒流行株磷蛋白(P)基因变异规律.方法 采用RT-PCR方法扩增1999-2008年浙江省麻疹病毒流行株P基因全序列,进行序列测定,并与疫苗株Shanghai191及其他麻疹流行株进行比较.结果 1999-2008年浙江省各流行株与疫苗株Shahghai191之间存在59~75个核苷酸的变异(变异率3.9%~4.9%),导致36~42个氨基酸变异(变异率7.1%~8.3%),它们在二级结构上也存在一定的差异.P基因系统进化树显示,其基因分型结果与WHO推荐的核蛋白(N)基因分型结果基本一致.P蛋白氨基酸的平均变异率要大于主要抗原基因N和H基因.结论 1999-2008年浙江省麻疹病毒流行株与疫苗株Shanghai191的P基因存在较大差异.
- 钟淑玲冯燕徐昌平徐琦卢亦愚
- 关键词:麻疹病毒磷蛋白核酸序列
- 浙江省1999-2011年麻疹流行株全基因组序列分析被引量:5
- 2012年
- 目的从全基因组层面探讨浙江省1999—2011年麻疹病毒的变异及其与疫苗株S191之间的差异。方法选取浙江省不同年份分离的麻疹病毒流行株9株,采用RT-PCR方法扩增全基因组序列,并与疫苗株S191及国外主要流行基因型毒株进行全序列比较分析。结果1999--2011年浙江麻疹流行株间的氨基酸同源性为98.77%~99.89%,麻疹病毒尚未受到明显的正向压力,各基因的变异仍属随机漂移。与疫苗株S191相比,两者间氨基酸的同源性仅为96.63%~98.16%,分别存在135—159个氨基酸的改变,其中共同的氨基酸变异位点113个,导致5个糖基化位点的变异。在核苷酸水平上,N基因的平均变异率最大(5.5%);而在氨基酸水平上,P蛋白的平均变异率最大(7.7%)。此外,在全基因组序列上,浙江流行株与各国疫苗株的遗传距离均大于D4、B3基凶型流行株与各国疫苗组的遗传距离(t=-9.76,P〈0.05;t=-12.39,P〈0.05)。结论浙江麻疹流行株与疫苗株S191在各基因上均产生了较大的差异,现行疫苗株与H基因型流行株之间的差异远大于疫苗株与国外优势流行株(D4、B3基因型)之间的差异,应密切关注这一变化趋势,及早研究后备麻疹免疫株。
- 金青青冯燕徐昌平卢亦愚钟淑玲莫世华
- 关键词:麻疹病毒全基因组疫苗
- 2005年浙江麻疹流行株与疫苗株基因组比较分析被引量:2
- 2009年
- 目的通过对麻疹暴发疫情中分离的麻疹流行株MVi/Zhejiang.CHN/7.05/4与麻疹疫苗株沪191全基因组比较,分析当代麻疹流行株与疫苗株的基因差异。方法通过测定从2005年浙江省麻疹暴发疫情中分离到的麻疹流行株MVi/Zhejiang.CHN/7.05/4的全基因组序列,采用MEGA3.1软件对流行株与疫苗株的全基因组序列进行比对和分析,并结合流行病学资料对毒株的变异进行分析。结果流行株与疫苗株相比全基因组共发生822个碱基突变(变异率为5.17%),含161个异义突变,其中有3个变异位点导致了病毒糖基化位点的变异;用毒株制备抗血清进行交叉中和试验,流行株与疫苗株抗原比相差5.66倍。结论浙江省2005年麻疹暴发疫情分离的流行株MVi/Zhejiang.CHN/7.05/4和中国现行使用的麻疹疫苗株沪191在全基因组层面已存在一定的差异,疫苗对免疫人群的保护作用需做进一步追踪探讨。
- 徐昌平严菊英冯燕茅海燕卢亦愚
- 关键词:麻疹病毒基因组抗原变异
- 含内质控多重荧光RT-PCR同时检测麻疹病毒和风疹病毒的研究被引量:7
- 2010年
- 由于从临床症状上难以区分麻疹病毒或风疹病毒引起的人群急性发热出疹性传染病,故而分别设计针对麻疹病毒和风疹病毒的特异性引物和荧光标记探针,建立含内质控的多重荧光RT-PCR以同时检测麻疹病毒和风疹病毒的核酸。结果表明:建立的多重荧光RT-PCR方法特异性好,试验验证没有出现假阳性和假阴性现象;该方法的灵敏度高,对麻疹病毒和风疹病毒的最低检出限分别达到0.1TCID50/mL和1TCID50/mL,可从疑似患者咽拭子等标本中直接检测到病毒核酸;同时该方法具有良好的稳定性,当分别用0.1~103TCID50/mL麻疹和风疹病毒的样本进行重复试验时,其CT值变异系数均在0.9%以下。此外,以人核糖核酸酶P(RNaseP)作为内质控,可以有效监控临床标本的采样质量及因操作失误等所致的假阴性结果出现。本方法尤其适用于疑似麻疹或风疹暴发疫情的临床快速诊断。
- 余蓓蓓冯燕徐昌平卢亦愚钱景
- 关键词:麻疹病毒风疹病毒RNASEP
- 现行麻疹病毒流行株在非洲绿猴肾细胞上连续传代后的性状研究被引量:6
- 2010年
- 目的研究现行麻疹病毒流行株连续传代后,对非洲绿猴肾细胞(Vero细胞)感染能力的改变,并从基因层面分析引起麻疹病毒与细胞受体结合位点改变的可能原因。方法将现行麻疹病毒流行株Ningbo(宁波)05-2在Vero细胞上连续传代,观察并记录致细胞病变效应(Cytopathic Effect,CPE);采用荧光定量逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)对原始株Ningbo05-2与第18代传代株Ningbo05-2/P18进行病毒鉴定后,通过血细胞凝集(Hemagglutination,HA)试验测定Ningbo05-2/P18的HA活性,并利用RT-PCR扩增其血凝素(Hemagglutinin,H)和核蛋白(Nucleoprotein,N)基因全序列。结果现行麻疹病毒流行株Ningbo05-2连续传代17次(P18),至第13代开始观察到在Vero细胞上融合样CPE;荧光定量RT-PCR鉴定传代株为麻疹病毒,但仍无对猴红细胞的凝集活性。与Ningbo05-2比较,传代株Ningbo05-2/P18在H蛋白上存在三个位点(312aa、314aa、546aa)的氨基酸突变,导致二级结构上311位的β折叠,以及312~316位的β转角转变为α螺旋。在H基因进化树上,传代株与原始株位于同一分支,仍属于H1b基因亚型。而在N蛋白核苷酸和氨基酸水平,传代株与原始株序列完全一致。结论现行麻疹病毒流行株在Vero细胞上连续传代后,H蛋白上个别氨基酸的突变可能导致与细胞结合位点的改变,从而影响病毒对细胞的感染能力。
- 傅燕冯燕董红军徐琦钟淑玲卢亦愚
- 关键词:麻疹病毒流行株基因突变