国家自然科学基金(10801025)
- 作品数:7 被引量:15H指数:3
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- 相关机构:大连理工大学大连水产学院更多>>
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- 相关领域:理学生物学医药卫生更多>>
- 钙调蛋白抑制剂预测模型研究
- 2009年
- 选用30个结构多样的CaM抑制剂分子作为数据集,采用多元线性回归(MLR)方法及主成分回归分析(PCA)方法对每个化合物的194个分子参数进行回归分析,分别建立了各自的最优预测模型.结果表明:多元线性回归分析方法所建模型与主成分回归所建模型相对比,发现逐步筛选法为最优建模方法.该方法所建模型统计结果良好(R2=0.952,SEE为0.289),应用于检验集时结果也比较令人满意(R2=0.941,SEP为0.295),模型表现出较强的可靠性和预测性.
- 高峰王永华李燕张述伟
- 关键词:钙调蛋白抑制剂多元线性回归分析主成分回归分析
- 紫杉烷二萜类化合物的定量构效关系研究被引量:4
- 2010年
- 紫杉醇是从紫杉或红豆杉树中提取的一种天然抗癌原料药,具有独特的抗癌机理。由于紫杉醇的种种限制,开发具有更高抗癌活性的类紫杉醇药物具有广阔的前景。紫杉烷二萜是以紫杉醇为母体,通过对其结构的不断修饰得到的一些二代紫杉醇类化合物。本文选用30个结构多样的紫杉烷二帖类化合物作为数据集,随机选取其中24个作为训练集,其它分子作为检验集,采用多元线性回归法(MLR)及主成分回归分析法(PCA)对每个化合物的195个分子参数进行回归分析,分别建立了定量构效关系的最优预测模型;并用检验集检验了所建模型的预测能力。结果表明,多元线性回归法所建模型与主成分回归法所建模型相对比,发现逐步筛选法为最优建模方法。该方法所建模型统计结果良好(R=0.782,SEE=0.202),应用于检验集时结果也比较令人满意(R=0.764,SEP=0.114),模型表现出较强的可靠性和预测性。模型的建立和主要影响因素的确定有助于指导新型紫杉醇类似物药物的筛选和研发。
- 李燕高峰王永华张述伟
- 关键词:多元线性回归分析主成分回归
- EP1受体抗拮剂定量构效关系
- 2012年
- 为辅助开发高活性EP1受体抗拮剂,探讨和研究EP1受体拮抗活性的关键影响因素,选取103个EP1受体抗拮剂分子作为数据集,采用多元线性回归(MLR)法和主成分分析(PCA)法分析每个分子的254个参数进行模拟建模.结果表明,应用MLR和PCA方法都得到了具有良好预测能力的定量构效关系模型.MLR法所建模型结果为:训练集R2=0.77,SEE=0.83,检验集R2=0.74,SEP=0.33.PCA所建模型为:训练集R2=0.72,SEE=0.45,检验集R2=0.71,SEP=0.38.两种方法相比,MLR法所建模型较优,可靠性及预测性强.这些模型及其确定的活性影响参数有助于辅助研发和筛选新型EP1受体抗拮剂.
- 闫玉莲李燕杨银凤卢晓伟张述伟
- 关键词:定量构效关系多元线性回归主成分分析
- 有机小分子偶极矩影响因素研究被引量:5
- 2015年
- 分子内部电荷分布不均使分子具有极性,分子的极性又影响了分子间的氢键、范德华力等相互作用力,进而影响宏观物质的化学特性,如化合物的溶解性、正辛醇,水分配系数和液相色谱保留行为等。化学特性的本质来源于其分子微观电荷状态,而偶极矩正是反映分子内电荷分布情况的重要物理量,因此估测分子的偶极矩十分重要。文中选取8种结构类型共107个分子,用Dragon软件计算出每个分子的929个分子参数,用多元线性回归法和主成分分析法分析参数对偶极矩值的影响。分析结果表明,相比主成分分析法,多元线性回归的stepwise法为最优建模方法。该模型统计结果良好(R^2=0.878,SEC=0.330,F=65.697),预测结果良好(R^2=0.792,SEP=0.665)。结果表明分子的平均原子电负性、距离矩阵参数、分子的组成、相邻原子的对称性、价键连接指数和分子的电性拓扑指数是影响偶极矩的主要因素。建立的最优回归模型对有机小分子的偶极矩具有很好的预测能力,对研究物质的宏观化学特性有一定的帮助作用。
- 付新梅李燕王景辉
- 关键词:偶极矩主成分分析法
- 紫杉醇类似物定量构效关系(QSAR)的研究被引量:4
- 2010年
- 紫杉醇是从紫杉或称红豆杉中提取的1种天然抗癌物质,具有独特的抗癌机理。由于紫杉醇的种种限制,开发具有更高抗癌活性的紫杉醇类似物药物具有广阔的前景。本文选用36个结构多样的紫杉醇类似物分子作为数据集,随机选取其中28个作为训练集,其它为检验集,采用多元线性回归(MLR)法及主成分回归分析(PCA)法分析每个化合物的197个分子参数,分别建立定量构效关系的最优预测模型。并用检验集检验所建模型的预测能力。结果表明:多元线性回归分析法所建模型与主成分回归所建模型相比,发现逐步筛选法为最优建模方法。该方法所建模型统计结果良好(R^2=0.846,SEE=1.060),应用于检验集时,结果也比较满意(R^2=0.841,SEP=1.071),模型的可靠性和预测性较强。建模和确定主要影响因素有助于指导筛选和研发新型类紫杉醇药物。
- 高峰李燕王永华张述伟
- 关键词:紫杉醇类似物多元线性回归分析主成分回归
- ERK信号转导网络反馈机制的研究
- 2009年
- 提出了一个计算机模型,利用该模型对表皮生长因子(EGF)激活的ERK信号转导网络进行了综合量化和动力学模拟.数学模型包含了各个途径的激活动力学,多条反馈回路和构架蛋白的连接.并对EGF受体和激活其下游的级联蛋白提出了新的认识.通过分析ERK信号转导途径正负反馈回路对信号转导的影响,发现这些反馈回路是ERK信号转导网络振荡的主要影响因素,它们能够导致下游底物的表达和相应的细胞行为.
- 韩勇李燕王永华张述伟
- 关键词:ERK反馈回路振荡
- P_2Y_(12)受体拮抗剂定量构效关系的研究被引量:2
- 2012年
- P2Y12受体拮抗剂是一类重要的抗血小板药物,研究分子活性与其结构参数的关系,对于合成新的P2Y12受体拮抗剂具有一定指导作用.选用178个结构多样的P2Y12受体拮抗剂分子作为数据集,随机选取了143个P2Y12受体拮抗剂作为训练集,剩余分子作为检验集.采用多元线性回归(MLR)方法和主成分回归分析(PCA)方法对每个分子的636个分子参数进行线性回归分析.MLR所建模型的结果为:训练集R2=0.800,检验集R2=0.834;PCA模型结果为:训练集R2=0.545,检验集R2=0.665.相比之下MLR法所建模型具有良好的预测性和可靠性.通过模型分析,确定了影响分子活性的关键因素.以上模型对筛选和合成新型高效P2Y12受体拮抗剂提供了一定理论指导.
- 李燕王德超王景辉张静晓张述伟
- 关键词:定量构效关系多元线性回归分析主成分回归分析