国家自然科学基金(30771842)
- 作品数：7 被引量：21H指数：3
- 相关作者：郑英杰陆一涵姜庆五胡安群朱建福更多>>
- 相关机构：复旦大学浙江省德清县疾病预防控制中心安庆市立医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市教育委员会重点学科基金上海市卫生局科研基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学更多>>
- 华东地区散发性戊型肝炎病毒系统进化分析被引量：4
- 2009年
- 目的 了解华东地区散发性戊型肝炎病毒（HEV）的系统进化特征。方法2005—2008年收集华东地区14家二级或三级医院413份散发戊型肝炎患者血清，应用巢式RT-PCR方法检测HEVRNA并测序。参照GenBank相关序列，分析各序列之间的同源性，并构建进化树。结果413例患者的男女性别比为1．75：1，40～69岁患者居多（61．5％）。413份患者血清有140份分离出HEVRNA，阳性分离率为34％。所有分离的140份病毒株均属于HEVⅣ型，与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为77．9％～88．3％、80．8％～90．6％、73．4％～85．2％和91．0％～95．4％。结论基因Ⅳ型HEV是引起华东地区散发性戊型肝炎的优势病毒株，其起源和进化等问题仍需进一步研究。
- 夏玉刚李燕婷陆一涵任红胡安群朱建福王学才姜庆五郑英杰
- 关键词：戊型肝炎病毒系统进化基因型
- 戊型肝炎病毒基因ORF1、ORF2阳性选择分析
- 2009年
- 目的探讨戊型肝炎病毒基因2个主要读码框(ORF)1、(ORF)2是否存在阳性选择位点。方法p¨*p.收集戊型肝炎基因全序列,利用MEGA3.0软件进行序列比对,校对密码子。PHYLIP3.6构建NJ进化树,PAML4.0分析阳性选择位点。结果平均进化率估计提示ORF1、ORF2均以净化选择为主,平均ω分别为0.029,0.024;中性进化模型显示有ORF1有93%的位点属于保守位点。平均ω=0.018;ORF2有98%的位点属于保守位点,平均ω=0.018;阳性选择模型分析结果提示ORF1、ORF2没有阳性选择位点。结论HEV进化过程中可能不存在阳性选择的进化模式。
- 邵中军李晶华范俊郑英杰熊成龙姜庆五孙静栗燕杨林
- 关键词：戊型肝炎病毒病毒基因
- 华东地区猪基因4型戊肝病毒的季节变化及与人同源性的分析被引量：8
- 2009年
- 目的戊型肝炎病毒的人兽共患特征被认可，本研究检测华东地区猪群在不同季节中基因4型戊肝病毒（HEV）的感染情况，了解猪病毒株之间以及与人病毒株的同源性关系。方法2007年9月—2008年6月在华东地区浙江、安徽和江苏的3家屠宰场中共采集猪胆汁标本1200份，应用巢式RT—PCR方法检测HEVRNA，对阳性标本测序并结合同-地区人HEV序列进行同源性分析。结果猪胆汁标本中HEVRNA总检出率为4．5％，各季节猪群的检出率为9-10月平均检出率6％，12-1月4．33％，3-4月4．33％，5-6月3．33％，各地区的平均检出率为江苏6％、安徽5％、浙江2．5％。不同地区猪与猪、猪与人基因4型HEV病毒株的同源性都较高（猪株之间核苷酸序列约为80％-100％，氨基酸序列约为96％～100％；猪与人株之间核苷酸序列约为76％～99％，氨基酸序列约为95％-100％）。部分猪HEV与人HEV构成独立的同源性分支，进化起源关系密切。结论基因4型HEV在华东地区猪群中常年广泛流行，且可能拥有共同的进化与传播起源。猪群携带HEV可能会对人群戊肝的流行趋势产生影响。
- 陆一涵郑英杰胡安群朱建福王法弟王学才姜庆五
- 关键词：病毒戊型肝炎基因型序列同源性核酸序列同源性
- 华东和华南地区商品猪戊型肝炎病毒携带率和基因分型分析被引量：2
- 2010年
- 目的 了解华东和华南地区商品猪戊型肝炎病毒（HEV）的携带率和基因分型.方法 2007-2009年收集华东和华南地区5家屠宰场商品猪胆汁600份,应用巢式RT-PCR方法检测HEVRNA,测序后做系统进化分析.结果 600份猪胆汁中有47份（7.83%）分离出HEVRNA.基于HEV ORF2区域内150-nt序列的系统进化分析结果,分离的47份HEV病毒株均属于Ⅳ型,与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为75.0%～83.4%、75.0%～84.6%、71.9%～80.7%和88.1%～91.5%,且大部分病毒株按采样地区来源表现出地区聚集性.结论 HEV在华东和华南地区的商品猪中广泛存在,应加强对商品猪食用安全问题的关注.
- 夏玉刚陆一涵胡安群秦雪董晓莲朱建福姜庆五郑英杰
- 关键词：戊型肝炎病毒携带率
- 安庆市人与猪群中戊型肝炎病毒的系统进化分析被引量：4
- 2010年
- 目的 了解安庆市人与猪群中流行的戊型肝炎病毒（hepatitis E Virus,HEV）的基因型和系统进化特征.方法 收集安庆市27份散发戊型肝炎患者血清标本和400份商品猪胆汁标本,并根据采样时间将猪胆汁标本分为A、B、C、D等4组（每组各100份）.应用巢氏逆转录聚合酶链反应（reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR）方法检测HEV开放式阅读框架（open reading frame,ORF）2区域内150 nt序列,测序后与GenBank下载的参考病毒株序列进行比对,并计算核苷酸序列间的同源性.使用贝叶斯推断法构建系统进化树,分析安庆市人与猪群中HEV的基因型和系统进化关系.结果 患者的男女性别比例为2.86∶1,平均年龄为56.78岁.27份患者血清标本中有16份检出HEV RNA,阳性检出率为59.26%.安庆市人HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为74.75%～82.99%、75.26%～83.64%、72.77%～80.57%和88.03%～91.63%.400份猪胆汁中有22份（5.5%）分离出HEV RNA,A、B、C、D各组的HEV携带率分别为7.00%、3.00%、9.00%、3.00%,各组间的猪HEV携带率差异无统计学意义（x2=5.20,P=0.16）.安庆市猪HEV病毒株与基因Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为75.24%～83.42%、75.93%～84.19%、72.86%～80.64%和88.15%～91.79%.系统进化树分析结果显示,安庆市人和猪HEV病毒株均属于基因Ⅳ型,且错落分布于进化分支上,无明显的物种聚集现象.结论 基因Ⅳ型HEV为安庆市人和猪的优势病毒株,且有可能在该地区人和猪群中跨物种传播.
- 夏玉刚胡安群陆一涵刘海燕郑英杰
- 关键词：基因型
- 西安市家畜戊型肝炎病毒携带情况调查被引量：3
- 2008年
- 目的 探讨西安市家畜戊型肝炎（戊肝）病毒（HEV）携带情况。方法收集猪、犬等常见家畜的胆汁标本，采用逆转录巢式聚合酶链反应（RT-nPCR）技术扩增HEV基因组开放读码2（ORF2）区域内150nt片段；阳性标本PCR产物直接测序，并与GenBank数据库进行比对，构建进化树分析遗传特征。结果共收集猪胆汁标本194份，犬胆汁标本178份，牛胆汁标本79份，羊胆汁标本191份。RT-nPCR检测结果表明，四种家畜胆汁标本HEVRNA阳性率分别为4．10％、0％、0％、0％；遗传距离分析发现本次得到的HEV与Ⅳ型HEV距离最近，其次为Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅲ型；氨基酸水平也显示了同样的规律。结论猪是HEV家畜宿主，Ⅳ型是主要流行型。
- 邵中军郑英杰张景霞熊成龙陆一涵马文涛徐德忠姜庆五
- 关键词：戊型肝炎病毒人兽共患病家畜
- 安庆地区人与猪群中戊型肝炎病毒的系统进化分析
- 目的了解安庆地区人与猪群中流行的戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)的基因型和系统进化特征。方法收集安庆市27份散发戊型肝炎患者血清标本和400份商品猪胆汁标本,应用巢氏RT-PCR方法检测HEV ...
- 夏玉刚胡安群陆一涵刘海燕郑英杰
- 关键词：戊型肝炎病毒基因型系统进化
- 文献传递
- 基因4型戊型肝炎病毒血症的持续时间被引量：2
- 2009年
- 目的推算基因4型戊型肝炎患者发病后病毒血症的持续时间，为戊型肝炎流行病学传播研究提供基础数据，进而评价戊型肝炎患者在临床症状期之后的潜在传染性。方法采集华东地区162份戊型肝炎住院患者人院后的首份血清。通过套式RT—PCR方法检测HEVRNA，采用生存分析中的乘积极限法（Kaplan—Meier法）估计患者发病后病毒血症的持续时间。结果162份血清中101份检出HEVRNA，总检出率为62．35％，经同源性比较均为基因4型HEV。114例男性中检出74例，占64．91％，48例女性中检出27例，占56．25％，两者比较，差异无统计学意义（X2=1．08，P=0．30）。Kaplan—Meier法分析后发现，基因4型HEV病毒血症在患者发病后维持时间的中位数为24d（95％CI：18～30d），即50％的患者病毒血症可持续阳性直到发病后24d。第75和25百分位数分别为14d和31d。男性与女性患者的病毒血症维持时间差异无统计学意义（Breslow检验P一0．98，Tarone—Ware检验P=0．91）。结论基因4型戊型肝炎患者中75％的病毒血症可以持续到发病后的2周，部分戊型肝炎病毒血症可持续至1个月以上。提示即使患者临床症状和生化指标已转归正常，仍然存在病毒血症，可以成为传染源。
- 陆一涵胡安群郑英杰谈逸云王法弟郁新森姜庆五
- 关键词：肝炎病毒戊型病毒血症存活率分析
