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重庆市自然科学基金(CSTC2011BB5024)
作品数:
1
被引量:1
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饶文
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2014
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GPC5基因在肺腺癌组织中差异表达和突变分析
被引量:1
2014年
目的探讨GPC5基因在肺腺癌组织和正常肺组织中差异表达和突变情况。方法通过基因表达数据库(gene expression omnibus,GEO)的两个数据集分析肿瘤组织和相匹配正常组织GPC5表达量,对GPC5基因表达差异进行分析。运用肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)公共数据库初步分析GPC5突变和拷贝数变异情况。运用实时定量PCR检测39例肺癌患者肿瘤组织和正常组织样本中GPC5基因的表达,对结果进一步验证。结果我们对GEO数据库中的两个数据集进行分析发现肺腺癌肿瘤组织中GPC5表达量明显低于配对的正常组织(P<0.05);实时定量PCR检测结果证实了GPC5基因在肿瘤组织中的相对表达量均显著低于相匹配的正常组织(P<0.01),而且与Ⅰ期肿瘤组织相比,Ⅱ期+Ⅲa期的肿瘤组织中GPC5表达水平明显较低(P<0.05)。结论 GPC5基因的拷贝数变异广泛存在,杂合子缺失可能是导致GPC5表达水平降低的原因。
饶文
余祖滨
向颖
吴龙
邬娜
吴亚楠
白莉
李亚斐
关键词:
肺腺癌
突变
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