国家重点基础研究发展计划(2012CB721001)
- 作品数：3 被引量：39H指数：2
- 相关作者：洪葵马敏唐敏更多>>
- 相关机构：武汉大学华中农业大学海南医学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划欧盟第七框架计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 四种红树植物根际土壤微生物Ⅰ型和Ⅱ型PKS基因的检测与多样性分析被引量：4
- 2013年
- 【目的】探究红树林土壤中聚酮合酶(Polyketide synthase,PKS)基因的多样性和新颖性。【方法】用Ⅰ型和Ⅱ型PKS基因酮基合成酶(Ketosynthase,KS)域的简并引物对海南清澜港红树林海莲、黄槿、银叶、老鼠簕4种红树根际土壤样品中DNA进行PCR扩增,之后利用PCR-限制性酶切片段多样性(PCR-RFLP)和测序分析法对Ⅰ型和Ⅱ型PKS基因的多样性进行探讨。【结果】对得到的72条Ⅰ型PKS基因的酮基合成酶(Ketosynthase,KS)域DNA序列进行PCR-RFLP分析,共得到51个可操作分类单元(Operational taxo-nomic unit,OTUs),其中37个OTUs为单克隆产生,没有明显的优势OTU。选取了26个代表不同OTU的克隆进行测序分析,这些序列与GenBank中已知序列的最大相似率均未超过85%。KS域氨基酸序列的系统发育分析显示,所得KS域来源广泛,包括蓝细菌门(Cyanobacteria)、变形杆菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和一些未可培养细菌;对55条PKSⅡ基因KS域DNA序列的PCR-RFLP分析后共得到25个OTUs,有两个明显的优势OTUs,代表的克隆子数所占比例超过10%。【结论】PCR-RFLP分析表明红树林根际土壤中存在着丰富多样的Ⅰ型和Ⅱ型PKS基因,且前者多样性更高;低的序列相似度表明所获得的PKSⅠ基因KS域序列独特;系统发育分析表明得到的PKSⅠ基因来源广泛。
- 马敏唐敏洪葵
- 关键词：聚酮合酶基因多样性
- 红树林放线菌及其天然产物研究进展被引量：33
- 2013年
- 红树林是热带亚热带潮间带的木本植物群落。为从海洋环境寻找新的天然产物,红树林已经成为放线菌资源收集、天然产物分离鉴定及其生物合成机制研究的热点。从巴哈马红树林分离的盐孢菌所产生的盐孢菌素(Salinosporamide A)已经进入临床研究。从红树林分离的放线菌类群已经达到8个亚目11科24属,并发现新属3个,新种31个。从红树林放线菌分离的新天然产物包括生物碱、喹啉等芳香类、阿扎霉素等大环类脂及吲哚衍生物等,大多数天然产物来源于红树林链霉菌。新型吲哚咔唑、吲哚倍半萜及厦霉素等以新颖的结构备受关注,相关生物合成途径已被揭示。
- 洪葵
- 关键词：红树林放线菌生物活性生物合成
- 丝状真菌二倍半萜化合物及其合成酶被引量：2
- 2016年
- 相比其他萜类化合物,丝状真菌来源的二倍半萜化合物数量较少,但具有广泛的生理活性和药用价值。已经发现的丝状真菌二倍半萜合成酶均由萜类环化酶和异戊烯基转移酶两个结构域组成,表现出底物的非特异性和环化方式的多样性。本文重点叙述了丝状真菌来源的二倍半萜化合物以及其合成酶的结构与功能特征,并对丝状真菌二倍半萜化合物及其合成酶研究现状作简要概述。
- 殷如洪葵
- 关键词：丝状真菌
- 全文增补中
