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裂叶牵牛获得表达序列标签资源的简单序列重复信息分析被引量：7: 2011年; 目的为了在裂叶牵牛中开发功能性EST-SSR分子标记,分析裂叶牵牛EST-SSRs特征。方法从NCBI公共数据库中下载裂叶牵牛EST序列,运用DNAstar软件中的Seqman Pro程序,对下载序列进行拼接和聚类,去除冗余序列,利用SSRIT软件筛选重复序列长度≥20 bp的二、三、四、五、六、七、八核苷酸7种类型的SSR,统计分析裂叶牵牛EST-SSRs的特征。结果从NCBI公共数据库中下载62 388条裂叶牵牛EST序列,剔除冗余序列,得到全长为8.35×106 bp的无冗余EST序列11 569条。在这些序列中搜索出985条EST序列含有1 132个SSRs,占无冗余EST序列的9.78%,平均每7.37 kb EST出现1个SSR位点。二核苷酸重复基元SSR出现频率最高(51.06%),其次是三核苷酸(33.57%),AG/TC、GA/CT和AAG/TTC是二、三核苷酸中的优势重复基元。裂叶牵牛EST-SSRs以4～10次重复为主,基序长度主要集中于20～30 bp。结论裂叶牵牛EST-SSR的出现频率高,重复类型丰富,理论上表明这些EST-SSRs具有较高的可用性。本实验通过对裂叶牵牛EST资源的SSR信息的研究,为分子水平和生物信息学角度上开发裂叶牵牛的SSR功能性标记提供了候选序列。; 刘越范增华孙洪波冯金朝张水仙熊圣文刘生全黄璐琦

乌拉尔甘草EST资源的SSR信息分析被引量：6: 2012年; 目的:为了在乌拉尔甘草中开发功能性EST-SSR分子标记,分析乌拉尔甘草EST-SSRs特征。方法:从NCBI公共数据库中下载乌拉尔甘草EST序列,运用DNAstar软件中的Seqman Pro程序,对下载序列进行拼接和聚类,去除冗余序列,利用SSRIT软件筛选重复序列长度≥20 bp的二、三、四、五核苷酸4种类型的SSR,统计分析乌拉尔甘草EST-SSR的特征。结果:从NCBI公共数据库中下载50666条乌拉尔甘草EST序列,剔除冗余序列,得到全长为9.28×106bp的无冗余EST序列11100条。在这些序列中搜索出752条EST序列含有963个SSR,占无冗余EST序列的8.68%,平均每9.64 kb EST出现1个SSR位点。二核苷酸重复基元SSR出现频率最高(43.41%),其次是三核苷酸(41.95%),AG/TC、GA/CT和CTT/GAA是二、三核苷酸中的优势重复基元。乌拉尔甘草EST-SSR以4～10次重复为主,基序长度主要集中于20～30bp。结论:乌拉尔甘草EST-SSR的出现频率高,重复类型丰富,理论上表明这些EST-SSR具有较高的可用性。本文通过对乌拉尔甘草EST资源的SSR信息的研究,为分子水平和生物信息学角度上开发乌拉尔甘草的SSR功能性标记提供了候选序列。; 刘越黄怡鹤孙洪波冯金朝张水仙王真戴景峰黄璐琦; 关键词：乌拉尔甘草 EST SSR分析

槲寄生化学成分及药理作用研究进展被引量：26: 2011年; 本文对槲寄生的化学成分、药理作用及分子生物学等方面的研究进展进行综述,为今后该药用资源的研究与开发提供参考。; 张水仙刘越孙洪波姚雪楠冯金朝; 关键词：槲寄生化学成分药理作用生物技术

蒙药“阿给”不同居群遗传多样性的ISSR分析被引量：4: 2011年; 目的研究内蒙古地区草甸草原、典型草原及森林草原中蒙药阿给的遗传多样性。方法利用12条ISSR引物对3个阿给居群进行扩增,用PopGen 32进行数据计算与聚类分析。结果 ①12条引物共扩增出184个位点,其中多态性位点为180,多态位点百分率为97.83%。②3个居群Gst=0.043 0,基因流Nm=11.135 5。③通过UPGMA分析,典型草原与森林草原阿给居群聚为一类,草甸草原阿给居群单独聚为一类。结论 ①阿给具有丰富的遗传多样性。②阿给居群总的遗传多样性大部分存在于居群内,各居群间有基因交流。③典型草原居群与森林草原居群的遗传距离最小,草甸草原居群与典型草原居群的遗传距离最大,这可能与其地理位置的远近有关。; 刘越王真孙洪波游光霞申刚义黄雪涛毛轲段福宇谢龙生蒋武霖邢晓晓徐艳红冯金朝黄璐琦; 关键词：蒙药阿给冷蒿

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中央民族大学青年教师科研基金(MUC0239)