中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(RIF2010-10)
- 作品数：2 被引量：15H指数：2
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- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 基于中麻黄萌发种子转录组的黄酮类化合物合成途径基因的挖掘被引量：8
- 2014年
- 应用新一代高通量测序技术(Illumina Solexa),对中麻黄(Ephedra intermedin)同萌期的种子进行转录组测序,数据重头(denovo)组装后,共获得52 007条Unigene序列,总长为25 043 596 bp。COG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了64 751个GO功能注释,17 701个COG功能注释以及16 942个KEGG注释,并从KEGG通路中找到参与黄酮类化合物合成途径的关键基因片段283个,其中包含了查尔酮合酶基因、细胞色素相关基因和花青素还原酶等基因。中麻黄转录组测序工作的完成,极大地扩充了麻黄的基因资源,为麻黄属植物分子系统进化分析、抗性和药用功能基因的发掘与利用、遗传改良等研究奠定基础。
- 邓楠史胜青常二梅刘建锋兰倩江泽平
- 关键词：中麻黄转录组黄酮类化合物高通量测序
- 膜果麻黄种子不同发育时期的转录组测序分析被引量：9
- 2015年
- 以不同萌发期间的膜果麻黄(E.przewalskii)种子为研究对象,应用新一代高通量测序技术平台Illumina Hi SeqTM2000对其进行转录组测序和数据重新组装,结果获得了12 999 122条初始序列,总长为1 169 920 980bp,初始序列组装获得序列片段的平均长度与N50值分别为351和548 bp;与COG功能注释、GO分类及KEGG代谢通路分析后,获得了49 449个GO功能注释、17 751个COG功能注释以及16 748个KEGG注释;并从KEGG通路中找到有关芪类、二芳基庚烷和姜醇合成途径的编码基因片段230个。
- 邓楠史胜青常二梅刘建锋兰倩江泽平
- 关键词：转录组芪类高通量测序
