国家现代农业产业技术体系建设项目(CARS-01-03)
- 作品数:8 被引量:41H指数:3
- 相关作者:高冠军张庆路何予卿罗利军李平波更多>>
- 相关机构:华中农业大学上海市农业生物基因中心更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 控制水稻抽穗期和株高的QTL的定位及遗传分析被引量:12
- 2014年
- 抽穗期(headingdata,HD)和株高(plantheight,PH)是水稻(Oryza sativaL.)非常重要的农艺性状。本研究利用金23B(Jin23B)和青谷矮1号(QGA-1)构建的BC3F1群体及其衍生的BC3F2群体通过分子标记定位水稻抽穗期和株高的QTL(quantitativetraitlocus)。构建的遗传连锁图包含105对SSR标记和8对InDel标记,图谱较好地覆盖了水稻12条染色体。两年来共定位到了9个抽穗期相关QTLs,6个株高相关的QTLs,其中抽穗期和株高最大效应都来源于第7染色体。抽穗期QTLqHD7-3在2011年LOD为37.07,可以解释的表型贡献率为41.05%,加性效应为11.68;株高QTLqPH7-2在2011年LOD为43.73,可以解释的表型贡献率为54.17%,加性效应为21.60;2012年LOD为42.66,可以解释的表型贡献率为54.39%,加性效应为19.95。qHD7-3和qPH7-2位于同一区域RM214-RM5543之间,Ghd7也位于这一区间,该QTL可能是Ghd7的等位基因。抽穗期QTLqHD2定位于第2染色体上标记ZH282和RM71之间,在两年内都能检测到,其LOD值分别为4.56和4.99,可解释的表型贡献率分别为4.31%和7.99%。株高QTLqPH4定位于第4染色体上标记RM241和RM317之间,其两年内的LOD分别为2.89和2.67,解释的表型贡献率为9.42%和8.78%。抽穗期QTL qHD2和株高QTL qPH4所定位的区间没有相关的基因或QTL报道,这两个QTL可能含有控制抽穗期和株高的新基因。本研究通过遗传定位证明了株高和抽穗期是由主效QTL和微效QTL共同控制的,并发掘了新的抽穗期和株高的QTL,为育种家利用分子标记辅助选择培育新品种提供更多的选择。
- 邱磊蒋海潮冯玉涛高冠军张庆路何予卿
- 关键词:水稻抽穗期株高QTL定位
- 水稻粒形和垩白的QTL分析被引量:1
- 2018年
- 水稻的产量和品质性状一直都是水稻育种长期关注的两个重要方面。本研究利用两个在粒形和垩白上有显著差异的籼稻品种R287和中早35为亲本,构建了一个含有192个单株的F2群体及衍生的F2:3群体,对其粒长、粒宽、长宽比、千粒重和腹白等性状进行了表型鉴定,并结合分子标记遗传连锁图谱进行了QTL(Quantitative trait locus)分析,结果表明:共检测到29个QTL,其中与粒重相关的QTL有6个,与粒形性状相关的QTL有12个,与垩白性状相关的QTL有11个。它们分布在第1号、第2号、第3号、第4号、第5号、第6号、第7号和第11号染色体上,表型变异贡献率介于0.10%~36.84%之间。
- 陈国威刘荣家高冠军张庆路何予卿
- 关键词:水稻粒形粒重QTL定位
- 利用高世代回交群体定位水稻抽穗期和株高QTL被引量:3
- 2014年
- 抽穗期(heading data,HD)和株高(plant height,PH)是水稻(Oryza sativa L.)重要的农艺性状。本研究利用金23B(Jin23B)和CR071构建了BC3F1群体及其衍生的BC3F2群体,建立的遗传连锁图谱包含140对SSR标记和5对InDel标记,较好的覆盖了水稻的12条染色体。两年共定位到了12个抽穗期相关QTLs(quantitative trait loci),8个株高相关的QTLs。其中抽穗期和株高最大效应QTL均由CR071提供,且都定位于第7染色体同一位置:抽穗期QTL qHD7 2011年LOD为33.26,解释的表型贡献率为38.2%,加性效应为10.40;2012年LOD为31.66,可以解释的表型贡献率为30.3%,加性效应为12.28;株高QTL qPH7同2011年LOD为48.72,解释的表型贡献率为44.2%,加性效应为19.97;2012年LOD为55.78,可以解释的表型贡献率为56.7%,加性效应为17.73。qHD7和qPH7都位于RM501-RM542之间,Ghd7也位于这一区间,该QTL可能就是Ghd7。抽穗期QTL qHD1-2和株高QTL qPH1-2同样都位于RM572-RM562之间,可以延迟抽穗期5 d左右和增加株高5 cm左右,qHD1-2两年内的LOD值分别为:7.58和7.03,可以解释的表型变异率分别为:6.84%和5.21%;qPH1-2两年内的LOD值分别为:4.21和4.77,可以解释的表型变异率为3.20%和3.64%,这一位点没有相关QTL定位或基因克隆的报道,位于这一区间的这两个性状也可能是由同一基因控制的。本研究通过发掘新的抽穗期和株高QTL,来增加基因的资源的多样性,为育种家利用分子标记辅助选择培育新品种提供更多的选择。
- 冯玉涛蒋海潮高冠军张庆路何予卿
- 关键词:水稻抽穗期株高QTL定位
- 利用高世代回交群体定位水稻广谱抗稻瘟病QTL被引量:2
- 2015年
- 稻瘟病是水稻(Oryza sativa L.)三大病害之一,对水稻产量和品质造成了严重的影响。本研究利用优良恢复系R287与广谱抗稻瘟品种细麻线的BC3F1回交群体构建的分子标记遗传连锁图谱,并通过全生育期自然诱发稻瘟病进行抗性鉴定。结果显示,全基因组分析共定位到16个抗叶瘟和13个抗穗颈瘟相关的QTLs,所有抗性QTL均来源于细麻线。其中q BR3是位于第3染色体上同时控制水稻叶瘟和穗颈瘟抗性效应的QTL,其能够提高叶瘟抗性2个数量级和降低穗颈瘟发病率40%左右。q BR3对叶瘟和穗颈瘟的抗性LOD值分别为18.63和22.77,解释的表型变异率分别为21.20%和26.10%。通过对水稻已有稻瘟病抗性位点的定位结果分析,发现q BR3可能是一个新的广谱抗性QTL位点。本研究结果为稻瘟病抗性育种提供了新的基因资源。
- 刘佳李志高冠军张庆路何予卿
- 关键词:水稻叶瘟穗颈瘟QTL定位稻瘟病分子标记辅助选择
- 水稻抽穗期QTL的遗传定位和效应验证被引量:1
- 2015年
- 水稻抽穗期是一个重要的农艺性状,与产量密切相关。为了探索抽穗期的遗传基础,本研究利用中国香稻和川香29B构建的重组自交系(recombinant inbred lines,RIL)群体,对控制水稻抽穗期的数量性状位点(quantitative trait loci,QTL)进行定位分析。结果显示:2010年和2011年两年共检测到q Hd1a、q Hd1b、q Hd4、q Hd6a、q Hd6b、q Hd6c、q Hd7、q Hd8a、q Hd8b等9个控制抽穗期的QTL,分别位于第1、第4、第6、第7和第8染色体上,贡献率在3.31%~29.64%之间。其中,q Hd1a、q Hd6b、q Hd6c、q Hd7、q Hd8b在两年中均被重复检测到。位于第1染色体上RM3746~RM259区间内的q Hd1a是一个尚未克隆的QTL位点,贡献率为8.21%。针对q Hd1a,本研究采用分子标记辅助选择的方法,构建其近等基因系(near isogenic lines,NIL)群体BC3F2并进行遗传效应分析。与携带纯合川香29B来源的q Hd1a位点的NIL(q Hd1a CX29B)相比,携带纯合中国香稻来源的q Hd1a位点的NIL(q Hd1a ZX)的抽穗期长7 d,差异达到极显著水平。本研究可望为水稻育种的生育期选择提供基础性数据。
- 叶红李平波高冠军张庆路何予卿
- 关键词:水稻抽穗期重组自交系近等基因系数量性状位点
- 水稻糙米中维生素E相关QTL分析被引量:2
- 2014年
- 以珍汕97和德陇208两个籼稻品种为亲本杂交构建的重组自交系(recombinant inbred line,RIL)群体为材料,通过包含有179个简单重复序列(SSR)标记的遗传连锁图谱,全基因组对2011年糙米中维生素E的8个异构体(α,β,γ,δ-生育酚和α,β,γ,δ-生育三烯酚)含量进行数量性状位点(QTL)定位分析,共检测到4个QTLs,其中α-生育酚在水稻第1染色体上检测到一个QTL,γ-生育酚在水稻第2染色体检测到一个QTL,δ-生育三烯酚在水稻第2和第6染色体上分别检测到一个QTL。所有QTL中仅控制γ-生育酚含量的QTL是亲本德陇208上的等位基因起增效作用,余下的3个QTL均来自于珍汕97。维生素E是水稻重要的营养品质之一,研究水稻中维生素E的遗传基础,为进一步阐述水稻中维生素E合成的分子机制及水稻营养品质改良提供基础。
- 张晓娜王令强高冠军张庆路罗利军何予卿
- 关键词:SATIVA维生素E营养品质PDL
- 水稻茎秆抗倒伏相关QTL定位与分析被引量:6
- 2016年
- 水稻的倒伏问题一直是制约其产量的重要因素之一。不断发掘、利用水稻抗倒伏性状相关QTL,选育出抗倒伏品种,从而提高水稻收获指数,是新时期水稻理想株型和高产育种相结合的重要育种方向。本研究利用Vary Lava 1312和华恢1 462构建的F2:3群体,基于全基因组构建遗传连锁图谱,对水稻基部茎秆直径(BCM)、伸长第一节茎秆直径(FCM)、伸长第二节茎秆直径(SCM)和株高(PH)进行QTL(quantitative trait locus)分析。2013年和2014年两年表型数据共检测到19个控制茎宽的QTLs和4个控制株高的QTLs。其中,位于第1染色体和第9染色体上的5个茎宽QTLs(q BCM1,q BCM9,q FCM1,q FCM9.1和q SCM1)和2个株高QTLs(q PH1.1和q PH9)在两年中均被检测到。位于第1染色体上RM4011-RMYP41231区间内的QTL在两年重复中均具有较好的稳定性。此区间的QTLs对各节茎秆直径的表型变异解释率为2.69%~16.22%,这些稳定检测到的QTLs对于利用分子标记辅助选择改良水稻抗倒伏提供了重要的基因资源。
- 鞠晓晨胡杰高冠军张庆路何予卿
- 关键词:水稻抗倒伏QTLS
- 水稻柱头外露率QTL定位被引量:15
- 2014年
- 作为驯化的结果,水稻柱头外露率影响不育系的制种产量。本研究利用岳早籼6号和II-32B构建的重组自交系(RJLs)群体,对柱头双外露率(PDES)和柱头单外露率(PSES)进行QTL(quantitativetraitlocus)分析。2011年和2012年两年表型数据检测到16个控制柱头外露率的QTLs,分布于第1、第3、第5、第6、第7和第9染色体上。其中,位于第1染色体RM472-RM12276和第9染色体RM278-RM107两个区段中的QTLs,在两种表型的两年重复数据中均有稳定的定位。这两个区间中的QTLs对柱头双外露率和柱头单外露率的表型变异解释为6.71%~21.99%51]10.65%~35.72%。这些稳定检测到的QTLs对不育系分子遗传改良和研究水稻驯化具有重要意义。
- 尹成李平波高冠军张庆路罗利军何予卿
- 关键词:水稻柱头外露率数量性状位点