云南省教育厅科学研究基金(09C0197)
- 作品数：2 被引量：36H指数：2
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- 相关机构：云南农业大学云南农业职业技术学院更多>>
- 发文基金：云南省应用基础研究基金云南省应用基础研究计划面上项目云南省教育厅科学研究基金更多>>
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- 水牛κ-酪蛋白基因(CSN3)外显子4序列多态性研究被引量：3
- 2012年
- 分别设计位于CSN3 5个外显子旁侧引物,采用DNA测序法对沼泽型和河流型水牛CSN3编码区结构进行了分析,并对10个水牛群体共106个样本CSN3第4外显子序列进行了变异检测。结果表明,两类水牛CSN3编码区由848个核苷酸组成,包括ORF序列573bp、5′-UTR序列69bp和3′-UTR序列206bp。在水牛CSN3第4外显子中共检测到4个SNP,其中c.445G>A,c.467C>T和c.516A>C为异义替换,导致相应的κ-CN成熟肽中氨基酸发生p.Val128Ile、p.Thr135Ile和p.Glu151Asp改变,c.467C>T和c.516A>C替换可能对κ-CN功能产生了影响。群体遗传分析表明,在河流型水牛中,等位基因c.445G、c.467C、c.471C和c.516A均为优势等位基因,而在沼泽型水牛中,仅c.445G、c.467C和c.471C为优势等位基因,河流型和沼泽型水牛的遗传差异主要体现在SNP516位点的群体遗传组成上。
- 祁宏刘丽仙袁峰李大林袁跃云苗永旺
- 关键词：河流型水牛沼泽型水牛Κ-酪蛋白基因多态性
- 基于线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)序列分析瓢鸡的遗传多样性被引量：33
- 2011年
- 采用PCR产物直接测序技术对云南省镇沅县50只瓢鸡样品的线粒体DNA控制区(mtDNA D-loop)第Ⅰ高变区序列进行了分析。结果表明:在所分析的D-loop区序列中(520 bp),T,C,A,G平均含量分别为30.4%,29.6%,27.4%,12.6%;共检测到27个核苷酸多态位点,其中24个为转换,3个为颠换,序列突变率为5.19%;序列存在13种单倍型,单倍型多样度(H)为0.883±0.028,核苷酸多样度(π值)为0.015 03±0.000 99,表明瓢鸡群体内遗传变异较丰富。瓢鸡样品可划分为A,B,E,F,G等5个世系,在NJ无根系统树上聚为5大枝,揭示瓢鸡在遗传组成上具有5个母系血统来源。
- 贡潘偏抽刘丽仙李大林袁跃云孙利民杨润刘文瑜刘伟苗永旺
- 关键词：线粒体DNA单倍型
